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自动化的微流控芯片系统在单细胞中检测MicroRNA的异质性2

图3. 分析:单个iPS细胞及其NPC后裔 (A) 对数据进行非监督式聚类分析可以清楚的区别开iPS细胞及使用小分子从iPS获得的NPC后裔1. 同时揭示了每种细胞中的亚群。(B) PCA清楚的揭示了这两种表型不同的细胞群之间的差异。(C) Violin Plot显示了不同亚群中miRNA 的差异性表达,以及主成分1和2的主要贡献者(左上至右下的顺序)。iPS和NPC之间5种miRNA的表达变化,和使用microassay从胚胎干细胞(ES)及其NPC后裔得到的趋势相同(未发表数据,Yao Shuyuan友情提供)。 图4. 人类神经元,iPS和NPC细胞 (A) 对从iPS,NPC和成熟神经元(HN)获得的数据进行非监督式聚类分析,可以清楚的将HN细胞从iPS和NPC细胞区分开,同时也揭示了每类细胞中存在的亚群。miR-9更频繁且更高水平的在成熟神经元(HN)中表达。(B) 根据miRNA表达,PC......阅读全文

自动化的微流控芯片系统在单细胞中检测MicroRNA的异质性1

编辑推荐:Fluidigm 公司开发了一种在C1TM单细胞自动制备系统及BiomarkTM HD系统上检测单细胞miRNA表达谱的实验方案。此方案可以在小于24小时的时间内,平行处理96个单细胞,在一张GE 96.96芯片对每个单细胞分别检测多达96种miRNA。配套的SINGuLAR™ 2