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新型双压线性离子阱质谱仪给蛋白质组学带来革...(一)

Tonya Pekar Second, Justin Blethrow, Jae C. Schwartz, Vlad Zabrouskov, Thermo Fisher Scientific, San Jose, CA关键词:LTQ Velos 线性离子阱,蛋白质学,蛋白鉴定,肽测序、灵敏度、蛋白质组发现者引言:对于一个蛋白质组全面的了解是研究动态蛋白质组的基础。蛋白质的鉴定是需要有效、稳定可靠的方法。串联质谱尤其是线性离子阱和基于阱的杂交质谱仪日益成为肽段和蛋白质鉴定的首选。选择此类仪器的主要原因在于该类仪器具有良好的稳定性、重现性、易用性以及良好的一级和二级谱图质量。在一个蛋白质组体系里,经常会存在一些低丰度不易被质谱仪鉴定到的蛋白,其中某些蛋白还会存在一些动态修饰,就更难被仪器检测到。因此,需要发展更先进灵敏度更高的一切来应对复杂蛋白质组蛋白鉴定的需求。本篇应用论文主要介绍了用新型双压线性离子阱质谱仪分析复杂、Caenor......阅读全文

新型双压线性离子阱质谱仪给蛋白质组学带来革...(一)

Tonya Pekar Second, Justin Blethrow, Jae C. Schwartz, Vlad Zabrouskov, Thermo Fisher Scientific, San Jose, CA关键词:LTQ Velos 线性离子阱,蛋白质学,蛋白鉴定,肽测序、灵敏度、蛋白质

新型双压线性离子阱质谱仪给蛋白质组学带来革...(五)

图 6 1ug C.elegans 蛋白胰酶酶解物在反相色谱分离的基峰图,四级杆飞行时间质谱和 LTQ Velos 线性离子阱全扫描动态范围的比较Q-TOF 扫描速率对灵敏度的影响 如图 7 所示,将 Q-TOF 扫描速率从 3Hz 升至 6Hz ,导致鉴定到肽段数目减少,这主要是因为随着 Q-TO

新型双压线性离子阱质谱仪给蛋白质组学带来革...(六)

图 9 四级杆 - 飞行时间质谱在两个不同二级质谱扫描速率下,对同一个二价前体离子 LVGDLDDAQVDVER 二级质谱图的比较。而 LTQ Velos 离子阱对同一前体离子检测只用了 80% 的样品量。结论:在一个复杂的蛋白质组样品中,高灵敏的检测和鉴定化合物对于了解和认知动态蛋白质学具有极其重

新型双压线性离子阱质谱仪给蛋白质组学带来革...(三)

表 3 四级杆 - 飞行时间质谱仪采集参数软件平台Proteome Discoverer搜索引擎MASCOT v 2.1数据库NCBI, April 2008最大漏切数目1前体离子容忍度离子阱数据 : 1.4 Da四级杆飞行时间质谱数据 : 40 ppm碎片容忍度离子阱数据四级杆飞行时间质谱数据 :

新型双压线性离子阱质谱仪给蛋白质组学带来革...(二)

实验 样品制备 C.elgans 匀浆液的可溶性部分用 pH7.8 的碳酸氢铵稀释,加入 0.1% 的 RapiGest 表面活性剂,解释用二硫苏糖醇在 100 ℃ 还原二硫键,并用碘乙酰胺对半胱氨酸烷基化。样品解释用对 K/R 特异性酶酶切 4 个小时。酶解物质酸化后存放至 -80 ℃ 。

新型双压线性离子阱质谱仪给蛋白质组学带来革...(四)

如图 4 所示,在不同仪器之间,有很多蛋白会重复出现,即被不同仪器同时鉴定到。在 60 分钟的分离过程中, LTQ Velos 双压离子阱鉴定到了 LTQ XL 得到到蛋白数目的 88% , LTQ Velos 双压离子阱鉴定到了 Q-TOF 得到蛋白数目的 90% ,此外,还有 570 个

线性离子阱质谱仪的用途

广泛应用于可预测和不可预测代谢物的检测,并可以使用同重元素标记法进行肽定量分析。

利用双压线性离子阱质谱仪多重解离技术对API杂...(一)

利用双压线性离子阱质谱仪多重解离技术对API杂质谱进行全面分析Theresa Lynch 1 ; Kate Comstock 2 ; Jack Cunniff 21 Gilead Sciences, 333 Lakeside Dr, Foster City, CA;  2 Thermo Fisher

线性离子阱质谱仪的产品介绍

性能:  1、创新的前置放大器电子元件提升了灵敏度;  2、平行 MS 和 MSn 功能加速了分析;  3、具有阻挡中性离子新型技术的离子光学和先进的检测系统提升了系统可靠性和定量性能;  4、结合快速扫描的信号处理确保了UHPLC兼容性;  5、多裂解技术(CID、HCD和可选ETD)提供了多功能

线性离子阱质谱仪的产品特点

性能:  1、创新的前置放大器电子元件提升了灵敏度;  2、平行 MS 和 MSn 功能加速了分析;  3、具有阻挡中性离子新型技术的离子光学和先进的检测系统提升了系统可靠性和定量性能;  4、结合快速扫描的信号处理确保了UHPLC兼容性;  5、多裂解技术(CID、HCD和可选ETD)提供了多功能