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甲醛变性电泳检测RNA完整性材料和实验程序

一、材料、试剂和仪器1、材料:植物总RNA 5-10μg2、试剂:1)加样运载缓冲液(Loading buffer)50% 甘油1mmol/L EDTA (pH 8.0)0.25%溴酚蓝25%二甲苯氰FF2)10×TAE Buffer3)5×甲醛凝胶电泳缓冲液:0.1mol/L MOPs (pH7.0)40mmol/L乙酸钠5mmol/L DETA(pH8.0)4)甲醛,甲酰胺3、仪器:电泳装置,紫外透射观测仪二、实验程序1、甲醛变性的琼脂糖(Agarose) 凝胶的配制在250mL的锥形瓶中准确称量2g Agarose (Sigama),再加20mL 10×TAE Buffer,144mLDEPC处理过的双蒸水,微波炉中化胶,待冷却至50-60℃加EB至终浓度≤0.5μg/mL。在通风橱中加入36 mL甲醛,放置一段时间以减少甲醛蒸汽。2、RNA的甲醛变性电泳1) 样品制备RNA总量10μg5×甲醛凝胶电泳缓冲液4μl......阅读全文

RNA的定量和完整性分析

RNA的完整性可以通过琼脂糖变性电泳分析检测,而含量则通过紫外分光光度计确定。常见的变性电泳有甲醛变性电泳,戊二醛变性电泳等。甲醛变性电泳检测RNA完整性一、材料、试剂和仪器1 材料: 植物总RNA 5-10μg2 试剂:1)加样运载缓冲液(Loading buffer),50% 甘油,1mmol/

RNA 标准转录反应

            实验材料 模板 DNA 或质粒 试剂、试剂盒 TE 异

RNA 标准转录反应

实验材料 模板 DNA 或质粒试剂、试剂盒 TE 异丙醇 3mol LNaAc 无水乙醇 5×转录缓冲液 l00 mmol L DTT RNasin rATPrGTPrUTP 各 2.5 mmol L [α42P] rCTP SPGT3 或 T7RNA 聚合酶 TE-饱和的酚氯仿异戊醇 DN

3.1.1 RNA 标准转录反应

利用 DNA 聚合酶 I 的大片段(Klenow 酶)的 3'— 5'外切酶活性将 3'黏性末端转化成平末端。具体方法是在体外转录体系尚未加入核苷酸和 RNA 聚合酶时,加入 Klenoow 片段 (终浓度为 5U/ug),于 22℃ 孵育 15mim, 然后再加入核苷酸混合物和RNA 聚合酶实验材

植物组织总RNA的制备:异硫氰酸胍—酚法

异硫氰酸胍—酚法提取RNA的原理如下:GIT与β-巯基乙醇共同作用抑制RNase的活性;GIT与 十二烷基肌氨酸钠 (Sarcosyl)作用使蛋白质变性,从而释放RNA;酸性条件下DNA极少发生解离,同蛋白质一起变性被离心下来,RNA则溶于上清中。该法所提RNA纯度高完整性好较适合纯化mRNA,

异硫氰酸胍-酚法植物组织总RNA的制备

异硫氰酸胍—酚法提取RNA的原理如下:GIT与β-巯基乙醇共同作用抑制RNase的活性;GIT与 十二烷基肌氨酸钠 (Sarcosyl)作用使蛋白质变性,从而释放RNA;酸性条件下DNA极少发生解离,同蛋白质一起变性被离心下来,RNA则溶于上清中。该法所提 RNA纯度高完整性好较适合纯化mR