茶树的驯化历史和遗传机制研究新发现

茶树是重要的经济植物,其特征是基因组大、杂合度高、物种多样性高。中国农业科学院茶叶研究所、深圳农业基因组研究所和中国科学院昆明动物研究所在基因组层面上对茶树开展合作研究。 该研究获得染色体级别高质量的中国茶(Camellia sinensis var.sinensis)“Longjing 43”品种的基因组,大小为3.26Gb。研究人员收集到全球139个茶树品种并进行基因组重测序,进一步探究茶树的进化与系统发育关系。研究表明,随着茶树栽培的普及,杂交增加茶树种群间的杂合性并产生广泛的基因流。研究通过群体遗传和转录组学分析发现,在驯化过程中,中国茶种群的抗病性和风味等相关基因受到了选择,比大叶茶(C.sinensis var.assamica)种群所受选择压力更强。该研究为茶树标记辅助育种提供资源,为进一步研究茶树遗传和进化奠定基础。 相关研究成果以Population sequencing enhances unders......阅读全文

龙井茶树染色体级别基因组组装成功

   龙井43    中国农科院供图 近日,《自然—通讯》在线发表了我国科学家在茶树全基因组组装和茶树起源演化研究上取得的重要突破。该项研究由中国农业科学院茶叶研究所(以下简称茶叶所)和中国农业科学院深圳农业基因组研究所(以下简称基因组所)主导并携手中国科学院昆明动物研究所(以下简称昆

我国首次成功破译茶树基因组

   茶作为最早饮料,其相关的可信记录可以推至公元前三世纪--商代时期。茶叶不仅在中国而且在世界范围内具有巨大的经济和文化价值。日前,我国科学家经过七年研究,终于率先在国际上破解了茶树的基因组。   相对于“世界三大饮料植物”中的咖啡和可可而言,茶树基因组具有高杂合、高重复和基因组庞大等特点。由中科

中国种茶树全基因组密码破解

  记者从安徽农业大学获悉,该校茶树生物学与资源利用国家重点实验室宛晓春教授研究团队,联合深圳华大基因等单位,破解了世界上分布最广的中国种茶树的全基因组信息,成果日前在线发表于《美国科学院院刊》上。  世界主栽茶树分属两个变种:即中国种和阿萨姆种,前者叶小,分布广泛,适制绿茶等六大茶类;后者叶大,主

昆明植物所等首次成功破译茶树基因组

  茶是世界上最为古老也是最为广泛饮用的含咖啡因软饮料,目前全球160多个国家的30亿人喝茶爱茶。普遍认为,茶树起源于中国的云南、四川等地;作为传播中国文化的使者,在茶从中国起身向世界各地传播的数千年的漫长历程里,与全球100多个国家多元的文化邂逅交融,发展形成了地球上复杂而美妙的茶文化。除了因为迷

陈亮小组茶树功能基因组研究取得进展

  我国只有不到25%的茶园栽种经过改良的品种   茶树是一种重要的经济植物,由于其自身特性的限制,茶树分子生物学尤其是功能基因研究相对迟缓。在国家自然科学基金等的资助下,中国农业科学院茶叶研究所研究员陈亮率先展开茶树功能基因组、茶树分子标记研究,从更深层次上认识茶树生长发育、起源、

攻克基因组测序难题-探究茶树生物学奥秘

  我国现存最早的中医医药典籍《本草经》记载:“神农尝百草,日遇七十二毒,得荼(茶)而解之。”这说明了茶的神奇功效。茶树起源于我国的云南、四川等地,在从中国向世界各地数千年漫长传播历程里,与全球多元文化邂逅交融,发展形成了今天地球上复杂而美妙的茶文化。茶之所以广受欢迎,除了有迷人的香气和令人愉悦的滋

小叶茶染色体级别基因组图谱联合研究成果首次完成

  近日,生物学预印本服务器(www.biorxiv.org)在线发表了中美科学家联合研究团队的最新成果,该团队采用单分子实时测序(SMRT)和 Hi-C技术,在20多个代表性小叶茶品种中选用杂合度较低的小叶茶良种“碧云”,将组装获得的约2.85Gb 的基因组序列挂载到了15 条假染色体上,在国际上

茶树不赏花

  茶花 茶树花■付雷  金华这座城市并不大,却有多处茶花园,不但有一个中国茶花文化园,更有一个国际山茶物种园,显得很有声势。茶花在冬春时节开得颇盛,让冬季的色彩不再单调了。  供人观赏的茶花是山茶科植物的花,名列“中国十大名花”之中。山茶属于双子叶植物山茶科山茶属,有灌木,也有小乔木。它的叶片很硬

茶树的驯化历史和遗传机制研究新发现

  茶树是重要的经济植物,其特征是基因组大、杂合度高、物种多样性高。中国农业科学院茶叶研究所、深圳农业基因组研究所和中国科学院昆明动物研究所在基因组层面上对茶树开展合作研究。  该研究获得染色体级别高质量的中国茶(Camellia sinensis var.sinensis)“Longjing 43

国家重点实验室破解中国种茶树全基因组密码

  当前,世界主栽茶树分属两个变种: 中国种和阿萨姆种。省部共建茶树生物学与资源利用国家重点实验室安徽农业大学宛晓春教授研究团队,联合深圳华大基因和中国科学院国家基因研究中心等相关研究团队,以国家级茶树品种舒茶早(中国种)为材料,用二代和三代测序技术对其进行测序,采取杂合组装策略,获得覆盖基因组93

我国科学家在茶树起源演化研究上取得重要突破

  由中国农业科学院茶叶研究所和中国农业科学院深圳农业基因组研究所主导的一项研究,日前揭示了茶树群体的系统发生关系,描绘了栽培茶树的进化历史。研究成果为茶树基因组学研究和育种研究,以及茶树遗传和进化研究提供了丰富素材。 茶是世界性饮料。茶树起源于中国,在我国分布广泛,种质资源丰富,红茶、绿茶、乌

世界第一个茶树基因组测序计划在昆启动

2月3日,记者从中国科学院昆明植物研究所获悉,在中国科学院昆明植物研究所3名中科院院士吴征镒、周俊、孙汉董的大力推动下,一个在世界生物学界和推动普洱茶产业发展上均具有重大意义和经济价值的科研创新项目——世界上第一个茶树基因组测序计划已在昆明正式启动。此举,将为云南省利用高科技实现对普洱茶的全新研究和

染色体水平冬瓜参考基因组发布

近日,广东省农业科学院蔬菜研究所发布了染色体水平冬瓜参考基因组。相关研究发表于Scientific Data,广东省农业科学院蔬菜研究所副研究员罗文龙和副研究员闫晋强为该论文共同第一作者,广东省农业科学院蔬菜研究所研究员江彪为通讯作者。广东省农业科学院蔬菜研究所于2019年对黑皮大冬瓜B227进行基

研究发布碧凤蝶染色体水平基因组

  蝴蝶因其丰富的形态多样性,自达尔文时代就作为研究物种适应性进化的重要类群之一,近几年更被认为是研究形态遗传、进化和发育的理想模型,已成为发育生物学、进化生物学、种群遗传学、保护生物学和生态学等研究领域的重要模式生物之一。凤蝶科是具有重要进化地位的蝴蝶支系,其丰富的色彩和形态等多样性是昆虫生态与进

染色体级别的银杏参考基因组公开

银杏果实 曹福亮供图  作为裸子植物银杏纲唯一的孑遗物种,银杏不仅具有特殊的科学研究价值,而且具有重要的应用价值。  近日,南京林业大学联合中国农业科学院农业基因组研究所在《自然—植物》在线发表了染色体级别的银杏参考基因组,是目前已发表的组装质量最高的裸子植物参考基因组。  论文共同通讯作者、中国工

茶树和薰衣草精油成分的分析

  摘要:采用气相色谱-质谱法分析了茶树和薰衣草精油的成分,分别鉴定出58、42个组分。结果表明:两种精油成分差异还是比较大的。茶树精油中的主要成分是烷烃类占39.61%,其中小茴香烷为33.98%,蒈烷为5.5%,其次是酮类化合物28.32%,其中反式-薄荷酮和薄荷酮含量最高分别为16.76%和7

叶绿素仪对茶树氮肥施用的分析

茶树的生长和品质产量都受氮素的影响,施用氮肥可以有效的提高茶树氨基酸和咖啡碱的含量,但是如果过量的话,也会使茶叶的品质下降,造成环境的污染。对茶树进行营养诊断,了解其需肥关键时期,实现适时、定量供应养分,可以有效地提高施肥的经济效益。测定叶片氮素含量是诊断茶树氮素状况的重要方法,但是全氮 分析操作繁

种茶树也有基因密码了?生物学与资源重点实验室成立

   记者24日从安徽农业大学获悉,该校茶树生物学与资源利用国家重点实验室,联合深圳华大基因和中国科学院国家基因研究中心(上海)等相关研究团队,破解了世界上分布最广的中国种茶树的全基因组信息,从基因组层面系统解开了茶叶中富含独特的风味物质之谜,标志着中国茶树生物学基础研究取得重大突破。    据

科学家破解中国种茶树全基因密码

   记者24日从安徽农业大学获悉,该校茶树生物学与资源利用国家重点实验室,联合深圳华大基因和中国科学院国家基因研究中心(上海)等相关研究团队,破解了世界上分布最广的中国种茶树的全基因组信息,从基因组层面系统解开了茶叶中富含独特的风味物质之谜,标志着中国茶树生物学基础研究取得重大突破。   据介绍,

上海师大团队破解染色体级别基因组密码

  中新网上海12月16日电 (记者 许婧)上海师范大学16日发布消息称,该校王全华研究团队在菠菜基因组研究领域又取得一项重大标志性研究成果。团队联合康奈尔大学Boyce Thompson研究所(BTI)费章君教授课题组等多家科研机构完成了新一代菠菜基因组精细图谱绘制、重要农艺性状遗传基础和菠菜驯化

染色体级别橡胶基因组研究揭秘乳胶生物合成

   橡胶树是大戟科植物。在植物界大约2500种产胶植物中,橡胶树产生的以聚异戊二烯为主要功能成分的天然胶乳约占全球天然橡胶的98% 以上。图片来源于网络  比起可能造成巨大环境污染的人工合成橡胶产业,天然橡胶因其良好的弹性、伸展性、耐老化等综合理化性能而具有不可替代性,是任何国家必须具备的重要战略

昆明动物所发布碧凤蝶染色体水平基因组

  蝴蝶因其丰富的形态多样性,自达尔文时代就作为研究物种适应性进化的重要类群之一,近几年更被认为是研究形态遗传、进化和发育的理想模型,已成为发育生物学、进化生物学、种群遗传学、保护生物学和生态学等研究领域的重要模式生物之一。凤蝶科是具有重要进化地位的蝴蝶支系,其丰富的色彩和形态等多样性是昆虫生态与进

染色体级别的铁线蕨基因组首次绘制

   日前,中国农业科学院深圳农业基因组研究所联合国内外8家科研院所首次绘制了染色体级别的铁线蕨基因组,揭示了蕨类植物孢子发育、真叶植物起源和种子演化、茉莉素信号通路进化等分子机制。相关研究成果发表在《自然—植物(Nature Plants)》。  真蕨植物以孢子体和配子体均具有光合自养能力为主要特

用比较基因组杂交描述染色体结构异常实验

实验方法原理比较基因组杂交(CGH)是一种能够在一步全基因组筛查程序,描述G带不能发现的细胞遗传物质增加或减少的分子细胞遗传学技术。CGH优于进行全染色体涂染(wcp)的常规荧光原位杂交(FISH)和多色FISH之处,是它不仅能够识别增加的未知片段的染色体来源,而且还可将该片段定位于特定的染色体区带

微阵列—比较基因组杂交技术检测染色体异常

【摘要】近年微阵列一比较基因组杂交(microarraycomparativegenomichybirdization,microarray.CGH)技术被应用到临床细胞遗传学领域。该技术是选择DNA特殊片段作为靶,固化在载体上,形成密集、有序的分子微阵列。然后,从测试标本中提取DNA,将测试DNA

用比较基因组杂交描述染色体结构异常实验(二)

二、正常男性中期染色体标本的制备1.准备一个封闭环境,其相对湿度约55%(可在50%〜60%变化),温度24〜26.5℃。2.将巴斯德吸管置于玻璃载片上方2〜4in处,让一滴细胞悬液滴在玻片的左侧。然后迅速将第二滴细胞悬液滴在玻片右侧(见注释7)3.在固定液全部蒸发前,将玻片浸入盛有新鲜固定液的染色

用比较基因组杂交描述染色体结构异常实验(三)

六、中期染色体标本的变性1.在染色缸中加入大约50mL变性液,将染色缸放于75〜76℃水浴中。预热变性液使其温度达到(73±2)℃。2.从-20℃冰箱中取出实验所需的标本,室温下系列乙醇脱水,各2min。3.室温干燥片子(5min),或在实验室抽风橱中微风吹过标本使标本干燥。4.在37〜40℃电热板

用比较基因组杂交描述染色体结构异常实验(一)

实验方法原理 比较基因组杂交(CGH)是一种能够在一步全基因组筛查程序,描述G带不能发现的细胞遗传物质增加或减少的分子细胞遗传学技术。CGH优于进行全染色体涂染(wcp)的常规荧光原位杂交(FISH)和多色FISH之处,是它不仅能够识别增加的未知片段的染色体来源,而且还可将该片段定位于特定的染色体区

研究从基因组水平揭示食肉目染色体进化规律

  染色体进化是物种形成和演化的重要驱动因素。具有显著核型差异的食肉目动物为染色体进化研究提供了很好的研究素材。虽然前人通过比较染色体涂色法建立了食肉目内许多物种的染色体比较图谱,但这些研究的分辨率比较低,尚没有深入到精细的核苷酸水平,也不能在核苷酸水平研究不同食肉目物种间的共线性区块、染色体重排以

“六谷”丰登?——首个染色体水平基因组组装完成

中国菰    中国农科院供图        中国菰 (Zizania latifolia) 原产于中国,属于禾本科稻族菰属,主要分布于中国、韩国、日本和印度等国家。中国菰的颖果为菰米,在我国古代是重要的“六谷”之一。    近日,中国农业科学院烟草研究所烟草功能成分与综合利用创新团队与中国水稻研