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活跃基因诠释牡蛎生存智慧

昨天凌晨,英国《自然》杂志网站在线发表了来自中国科学家的一项成果:他们完成了牡蛎的基因组测序,并从中窥视到了牡蛎应对极端生活环境的种种生存智慧。 牡蛎是动物界中的一大支系――冠轮动物(特点为身体柔软,体型多变)的代表,是一种具有重要经济、生态价值的贝类。论文通讯作者、中国科学院海洋研究所张国范研究员介绍,牡蛎是世界上养殖产量最大的海洋动物,而我国的产量占到世界的3/4。同时,它从水中滤食有机碎屑、浮游生物等,可帮助消除富营养化,对河口海岸的生态稳定有重要作用。此外,牡蛎有10对染色体,在贝类中属于染色体比较简单的,因此课题组决定选择牡蛎作为研究对象。 他们联合深圳华大基因研究院、美国新泽西州立大学等5个国家9个实验室的80多位研究人员一起对牡蛎的基因组开展研究。经过4年多努力,在完成测序、分析基因的过程中,他们发现了造物主在牡蛎身上留下的许多“生存智慧”。 牡蛎生活在潮起潮落的海陆交界处、浅海泥沙中,生存环境十分恶劣......阅读全文

我国科学家发现黄花蒿首个染色体级别基因组图谱

  疟疾至今仍威胁着人类的健康。黄花蒿是全球普遍使用的抗疟疾药物——青蒿素的主要天然资源,保障全球优质廉价的青蒿素原料供应对于全球疟疾防控有重要价值。但黄花蒿基因组杂合度和重复度很高,致使高质量的黄花蒿基因组组装成为该领域难题。  在重大新药创制科技重大专项、国家重点研发计划“中医药现代化研究”重点

染色体水平冬瓜参考基因组发布

近日,广东省农业科学院蔬菜研究所发布了染色体水平冬瓜参考基因组。相关研究发表于Scientific Data,广东省农业科学院蔬菜研究所副研究员罗文龙和副研究员闫晋强为该论文共同第一作者,广东省农业科学院蔬菜研究所研究员江彪为通讯作者。广东省农业科学院蔬菜研究所于2019年对黑皮大冬瓜B227进行基

科学家获取染色体级别的高质量橡胶树参考基因组图谱。

   橡胶树(Hevea brasiliensis (Willd. ex A. Juss.) Muell. Arg. )是大戟科(Euphorbiaceae)植物。在植物界大约2,500种产胶植物中(如杜仲Eucommia ulmoides Oliver和橡胶草 Taraxacum kok-sagh

研究发布碧凤蝶染色体水平基因组

  蝴蝶因其丰富的形态多样性,自达尔文时代就作为研究物种适应性进化的重要类群之一,近几年更被认为是研究形态遗传、进化和发育的理想模型,已成为发育生物学、进化生物学、种群遗传学、保护生物学和生态学等研究领域的重要模式生物之一。凤蝶科是具有重要进化地位的蝴蝶支系,其丰富的色彩和形态等多样性是昆虫生态与进

染色体级别的银杏参考基因组公开

银杏果实 曹福亮供图  作为裸子植物银杏纲唯一的孑遗物种,银杏不仅具有特殊的科学研究价值,而且具有重要的应用价值。  近日,南京林业大学联合中国农业科学院农业基因组研究所在《自然—植物》在线发表了染色体级别的银杏参考基因组,是目前已发表的组装质量最高的裸子植物参考基因组。  论文共同通讯作者、中国工

科学家破译蓝鲸基因组

  新华社柏林4月8日电 蓝鲸是地球上现存体型最大的动物。德国和瑞典研究人员最新报告说,他们破译了蓝鲸以及其他3种须鲸的完整基因组。   研究团队在新一期美国《科学进展》杂志上发表了相关论文。他们认为,这将有助于科学界以“前所未有的细节”追寻蓝鲸及其“亲戚”的进化历程。   须鲸包括蓝鲸、座头鲸

科学家破译蓝鲸基因组

  蓝鲸是地球上现存体型最大的动物。德国和瑞典研究人员最新报告说,他们破译了蓝鲸以及其他3种须鲸的完整基因组。 研究团队在新一期美国《科学进展》杂志上发表了相关论文。他们认为,这将有助于科学界以“前所未有的细节”追寻蓝鲸及其“亲戚”的进化历程。 须鲸包括蓝鲸、座头鲸、灰鲸、长须鲸等种类。来自

科学家首次成功合成酵母染色体

  由美、英、法等多国研究人员组成的科研小组27日宣布,他们成功合成了第一条能正常工作的酵母染色体。这一成果被誉为攀上了合成生物学的新高峰,也是向合成人造微生物等生命体迈出的一大步。   研究人员在新一期《科学》杂志上报告说,他们利用计算机辅助设计技术,历时7年成功构造了源于酿酒酵母的被称作syn

科学家揭示Y染色体演化历程

  4月24日,《自然》发表的两篇论文给雄性的Y染色体演化和功能提供了新见解。众所周知,Y染色体在演化历史中丢失了大量基因,不过丢失基因的过程在大约2500万年前停止了,留下了一组稳定的祖先基因。这两篇文章共同指出,由于剂量原因,这些基因被“精心”保留下来,因为它们的功能和其他基因以及其他基因的产物

上海师大团队破解染色体级别基因组密码

  中新网上海12月16日电 (记者 许婧)上海师范大学16日发布消息称,该校王全华研究团队在菠菜基因组研究领域又取得一项重大标志性研究成果。团队联合康奈尔大学Boyce Thompson研究所(BTI)费章君教授课题组等多家科研机构完成了新一代菠菜基因组精细图谱绘制、重要农艺性状遗传基础和菠菜驯化

龙井茶树染色体级别基因组组装成功

   龙井43    中国农科院供图 近日,《自然—通讯》在线发表了我国科学家在茶树全基因组组装和茶树起源演化研究上取得的重要突破。该项研究由中国农业科学院茶叶研究所(以下简称茶叶所)和中国农业科学院深圳农业基因组研究所(以下简称基因组所)主导并携手中国科学院昆明动物研究所(以下简称昆

染色体级别橡胶基因组研究揭秘乳胶生物合成

   橡胶树是大戟科植物。在植物界大约2500种产胶植物中,橡胶树产生的以聚异戊二烯为主要功能成分的天然胶乳约占全球天然橡胶的98% 以上。图片来源于网络  比起可能造成巨大环境污染的人工合成橡胶产业,天然橡胶因其良好的弹性、伸展性、耐老化等综合理化性能而具有不可替代性,是任何国家必须具备的重要战略

昆明动物所发布碧凤蝶染色体水平基因组

  蝴蝶因其丰富的形态多样性,自达尔文时代就作为研究物种适应性进化的重要类群之一,近几年更被认为是研究形态遗传、进化和发育的理想模型,已成为发育生物学、进化生物学、种群遗传学、保护生物学和生态学等研究领域的重要模式生物之一。凤蝶科是具有重要进化地位的蝴蝶支系,其丰富的色彩和形态等多样性是昆虫生态与进

染色体级别的铁线蕨基因组首次绘制

   日前,中国农业科学院深圳农业基因组研究所联合国内外8家科研院所首次绘制了染色体级别的铁线蕨基因组,揭示了蕨类植物孢子发育、真叶植物起源和种子演化、茉莉素信号通路进化等分子机制。相关研究成果发表在《自然—植物(Nature Plants)》。  真蕨植物以孢子体和配子体均具有光合自养能力为主要特

微阵列—比较基因组杂交技术检测染色体异常

【摘要】近年微阵列一比较基因组杂交(microarraycomparativegenomichybirdization,microarray.CGH)技术被应用到临床细胞遗传学领域。该技术是选择DNA特殊片段作为靶,固化在载体上,形成密集、有序的分子微阵列。然后,从测试标本中提取DNA,将测试DNA

用比较基因组杂交描述染色体结构异常实验

实验方法原理比较基因组杂交(CGH)是一种能够在一步全基因组筛查程序,描述G带不能发现的细胞遗传物质增加或减少的分子细胞遗传学技术。CGH优于进行全染色体涂染(wcp)的常规荧光原位杂交(FISH)和多色FISH之处,是它不仅能够识别增加的未知片段的染色体来源,而且还可将该片段定位于特定的染色体区带

我科学家破译龙眼基因组

  记者11日从福建农林大学获悉,该校赖钟雄科研团队的论文于牛津大学出版社出版的《Giga  Science》杂志上在线发表。这是首次在国际公布的龙眼全基因组数据库,也是无患子科植物第一个全基因组数据库,标志着我国在相关领域的研究处于国际领先水平。  据赖钟雄研究员介绍,龙眼与近缘属果树荔枝、红毛丹

科学家完成柑橘基因组测序

  美国佛罗里达大学研究人员带领的一个国际研究小组日前完成了对甜橙和克莱门氏小柑橘(为柑橘与酸柑杂交的品种)树的基因测序工作,并公布了相关基因图谱,这在柑橘属果树中尚属首次。   研究人员称,该基因图谱的公布将有助于科学家找到新方法来对抗包括柑橘黄龙病(又称黄枯病、青果病,对柑橘危

科学家进行基因组测序 成功破译金雕基因组

   作为一种知名度极高的猛禽,金雕经常以威猛霸气的形象出现在影视作品和小说中。现在,英国研究人员完成了对金雕的基因组测序工作,希望从基因层面深入了解这一物种,以便更好地保护它们。 金雕以巨大的体型和敏捷有力的飞行等特征而著名,其成鸟的翼展平均超过2米,体长可达1米。金雕一般生活于多山或丘陵地区

科学家毕生研究鸟类染色体进化

  在过去25年间,每到夏季,生物学家Rusty Gonser就与妻子Elaina Tuttle都会到阿第伦达克山脉克兰伯里湖的野外台站。  现在,当把船系在摇摇晃晃的木码头后,Gonser听到了熟悉的鸟鸣声。这是白喉带鹀在唱求偶歌。但他却再也听不到妻子的笑声了,这是数十年来,Gonser第一次独自

用比较基因组杂交描述染色体结构异常实验(二)

二、正常男性中期染色体标本的制备1.准备一个封闭环境,其相对湿度约55%(可在50%〜60%变化),温度24〜26.5℃。2.将巴斯德吸管置于玻璃载片上方2〜4in处,让一滴细胞悬液滴在玻片的左侧。然后迅速将第二滴细胞悬液滴在玻片右侧(见注释7)3.在固定液全部蒸发前,将玻片浸入盛有新鲜固定液的染色

用比较基因组杂交描述染色体结构异常实验(三)

六、中期染色体标本的变性1.在染色缸中加入大约50mL变性液,将染色缸放于75〜76℃水浴中。预热变性液使其温度达到(73±2)℃。2.从-20℃冰箱中取出实验所需的标本,室温下系列乙醇脱水,各2min。3.室温干燥片子(5min),或在实验室抽风橱中微风吹过标本使标本干燥。4.在37〜40℃电热板

用比较基因组杂交描述染色体结构异常实验(一)

实验方法原理 比较基因组杂交(CGH)是一种能够在一步全基因组筛查程序,描述G带不能发现的细胞遗传物质增加或减少的分子细胞遗传学技术。CGH优于进行全染色体涂染(wcp)的常规荧光原位杂交(FISH)和多色FISH之处,是它不仅能够识别增加的未知片段的染色体来源,而且还可将该片段定位于特定的染色体区

研究从基因组水平揭示食肉目染色体进化规律

  染色体进化是物种形成和演化的重要驱动因素。具有显著核型差异的食肉目动物为染色体进化研究提供了很好的研究素材。虽然前人通过比较染色体涂色法建立了食肉目内许多物种的染色体比较图谱,但这些研究的分辨率比较低,尚没有深入到精细的核苷酸水平,也不能在核苷酸水平研究不同食肉目物种间的共线性区块、染色体重排以

“六谷”丰登?——首个染色体水平基因组组装完成

中国菰    中国农科院供图        中国菰 (Zizania latifolia) 原产于中国,属于禾本科稻族菰属,主要分布于中国、韩国、日本和印度等国家。中国菰的颖果为菰米,在我国古代是重要的“六谷”之一。    近日,中国农业科学院烟草研究所烟草功能成分与综合利用创新团队与中国水稻研

象腿蕉染色体级别基因组组装研究获进展

中国科学院华南植物园海外知名学者John Seymour Heslop Harrison教授领导的研究团队,在象腿蕉染色体级别基因组组装研究方面取得新进展。相关研究发表于Gigascience。王梓维为该文第一作者,John Seymour Heslop Harrison和刘青副研究员为通讯作者,华

象腿蕉染色体级别基因组组装研究获进展

象腿蕉(Ensete glaucum)是芭蕉科中耐寒的蕉类植物,原产于中国云南和东南亚地区,具有观赏、饲用和药用价值。中国科学院华南植物园教授John Seymour Heslop Harrison带领的研究团队,采用单分子纳米孔、Illumina测序策略,结合染色体构像捕获技术,发表了首个象腿蕉染

鸭嘴兽基因组图谱揭秘独特的性染色体

  鸭嘴兽可能是世界上长得最奇怪的动物。据说,当欧洲学者第一次见到这种鸭子嘴、海狸尾、水獭足的动物时,他们认为这是一场精心设计的骗局。它看上去既像爬行动物又像哺乳动物,还像鸟类。实际上,它属于稀有的单孔类动物。  鸭嘴兽不仅有一些奇特的身体特征,其新的基因组版本也强调了它一些不寻常的遗传特性。在上周

科学家启动“狮虎豹基因组计划”

  日前,我国科学家在深圳宣布启动“狮虎豹基因组计划”,将在1年内完成狮虎豹基因组的序列框架图,并且在行为科学和保护生物学等众多学科领域探索基因组测序成果的应用。计划由深圳华大基因研究院、北京大学、黑龙江虎林园、中科院昆明动物所、美国圣·迭亚哥动物保护研究所等中外科学家共同发起并承担。   深圳华

科学家完成古老绿藻基因组测序

  已知最小的真核生物Micromonas之一的电子断层切片( 0.5微米厚)   一个国际研究小组日前对两株被认为属于同一种藻类的古老绿藻进行了基因组测序,结果发现二者的基因只有90%相同。由于研究所用的绿藻位于真核生物生命树底部,科学家认为,这一发现为研究藻类以及陆地植物的进化提供了新线索