研究观测到染色质重塑中DNA的BZ构象转变
近年来，Z型DNA（Z-DNA）的研究引发关注，但是在细胞中对其进行观测还存在困难，主要原因是缺少一种简便可靠的手段对其进行直接观测。最近，中国科学院合肥物质科学研究院智能机械研究所研究员黄青课题组与郑州大学张凤秋课题组合作，利用红外光谱技术观测并研究染色质重塑中DNA的B-Z构象转变，相关研究成果发表在Analytical Chemistry上。 染色质重塑是表观遗传学的主要研究内容之一，一般包括组蛋白共价修饰型或ATP（一种高能磷酸化合物）依赖型两种类型。组蛋白共价修饰型通过影响组蛋白与DNA双链的亲和性，从而改变染色质的疏松或凝结状态；ATP依赖型的染色质重塑通过染色质重塑复合物改变组蛋白与DNA的结合状态，在靠近核心组蛋白的DNA表面建立特殊构象，从而使转录因子更易靠近DNA的过程。在染色质重塑过程中，组蛋白与DNA间的相互作用将发生变化，因此可能导致DNA构象的改变。其中，Z-DNA构象可能更利于破坏核小体的结构......阅读全文
染色质重塑的概念
染色质重塑chromatin remodeling ：基因表达的复制和重组等过程中，染色质的包装状态、核小体中组蛋白以及对应DNA分子会发生改变的分子机理。
JBC：染色质重塑与癌症
染色质的结构变化又称为染色质重塑(Chromatin remodeling)，染色质重塑调节着基因转录、DNA修复、程序性细胞死亡等多种细胞基础过程。Stowers医学研究所的科学家们在前期研究的基础上深入解析了染色质重构的调控机制。 Stowers 研究所的研究人员进行了一系列生化实
研究观测到染色质重塑中DNA的BZ构象转变
近年来，Z型DNA（Z-DNA）的研究引发关注，但是在细胞中对其进行观测还存在困难，主要原因是缺少一种简便可靠的手段对其进行直接观测。最近，中国科学院合肥物质科学研究院智能机械研究所研究员黄青课题组与郑州大学张凤秋课题组合作，利用红外光谱技术观测并研究染色质重塑中DNA的B-Z构象转变，相关研究
Cell：染色质重塑抹去痛苦记忆
据统计，近八百万美国人受到创伤后应激障碍PTSD的困扰。这种疾病主要由战争或暴力袭击等创伤性事件引起，患者表现出极度的焦虑。 许多PTSD患者在接受着心理治疗，心理医生让患者在安全的环境中重新体验创伤性回忆，以帮助他们克服恐惧。然而，这样的记忆往往根深蒂固，心理疗法有时无法起作用，特别是对
染色质重塑因子PKL在RNA介导的DNA甲基化中的功能
5月31日，《基因组生物学》（Genome Biology）杂志在线发表了中国科学院上海生命科学研究院植物逆境生物学研究中心张蘅研究组题为The developmental regulator PKL is required to maintain correct DNA methylation
Cell子刊：染色质重塑与脂肪肝
研究人员发现了将碳水化合物转化为脂肪的关键基因，该基因有望作为脂肪肝、糖尿病和肥胖症治疗的潜在靶点。 加州大学伯克利分校的科学家们揭示了机体将碳水化合物转化为脂肪的分子机制，他们在研究中发现BAF60c基因会导致脂肪肝。研究显示，即使饮食中含糖量高，缺乏BAF60c基因的小鼠依然不能将碳水
陈柱成/李雪明/李明组揭示SNF2染色质重塑中DNA滑移的机理
染色质重塑复合物利用ATP的能量移动核小体在基因组上的位置和组成成分，在控制染色质结构、调节基因转录等方面具有重大作用，主要可以分四大类：SWI/SNF、CHD、ISWI和INO80【1】。这些分子机器的运行机理，即如何利用ATP水解的能量推动核小体移动和组蛋白交换，一直是一个未解的科学问题。利
陈柱成/李雪明－SNF2介导的染色质重塑中DNA滑移的机理
2019年3月13日，清华大学生命科学学院陈柱成课题组、李雪明课题组以及中科院物理所李明课题组合作在Nature上发表了题为Mechanism of DNA translocation underlying chromatin remodeling by Snf2的研究论文，析了不同核苷酸状态下
热带爪蟾表明染色质重塑对从头－TAD－建立有重要影响
动物间期染色体被组织成拓扑关联域 (TAD)。尚未完全了解 TAD 的形成方式。 2021年6月7日，南方科技大学侯春晖，陈永龙，华中农业大学李立及澳门大学张仲荣共同通讯在Nature Genetics 在线发表题为“Three-dimensional folding dynamics of
染色质免疫沉淀DNA分析
实验概要染色质免疫共沉淀是一种强力的方法，来联系蛋白质或其修饰的定位与基因组的关系。染色质分离并用特异性抗体判断是否与特异性 DNA 序列相结合。染色质免疫沉淀法亦可用来检测目的位点在基因组中的时空分布（用芯片或 DNA 测序）。本操作规程详细阐述了交联染色质免疫沉淀 (X-ChIP) 实验的具
染色质免疫沉淀DNA分析
实验概要染色质免疫共沉淀是一种强力的方法，来联系蛋白质或其修饰的定位与基因组的关系。染色质分离并用特异性抗体判断是否与特异性 DNA 序列相结合。染色质免疫沉淀法亦可用来检测目的位点在基因组中的时空分布（用芯片或 DNA 测序）。本操作规程详细阐述了交联染色质免疫沉淀 (X-ChIP) 实验的具
染色质的组成DNA的简介
细胞中编码和控制的信息是与DNA分子紧密地联系在一起的。DNA与染色质有着重大联系。DNA是一种高分子聚合物，即由重复单位构成的大分子。每一单位都由三种较小分子组成，它们彼此结合形成核苷酸。碱基共有四种：胸腺嘧啶(T)，胞嘧啶(C)，腺嘌呤(A)，鸟嘌呤(G)。人的碱基比例 A:T:G:C是29
染色质重塑SWI/SNF与INO80复合体新发现
中国科学技术大学蔡刚教授课题组利用冷冻电镜技术，解析了染色质重塑SWI/SNF与INO80复合体及其不同核小体结合状态复合物的三维结构，揭示了SWI/SNF与INO80复合体共有的肌动蛋白(Actin)和核肌动蛋白相关蛋白(Arps)组成的Actin/Arp模块作为构象调控的分子开关，调控核小体
华南农业大学阐明染色质重塑在水稻抗病中的作用
日前，华南农业大学生命科学学院、亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室研究员刘耀光和副研究员张群宇为共同通讯作者在国际著名生命科学期刊EMBO Reports在线发表研究论文，阐明染色质重塑在水稻抗病中的作用。 稻瘟病是影响全球水稻产量最严重的病害之一。刘耀光研究员领衔的研究小组利用全长
组蛋白分子伴侣DAXX和染色质重塑蛋白ATRX相互作用模式
近日，中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所陈勇研究组的最新研究成果，以Structural basis for DAXX interaction with ATRX为题，发表在Protein & Cell上，该成果揭示了组蛋白分子伴侣DAXX蛋白与染色质重塑蛋白ATRX相互作用
染色质DNA基因组的介绍
凡是具有细胞形态的生物其遗传物质都是DNA,只有少数病毒的遗传物质是RNA。在真核细胞中,每条未复制的染色体包含一条纵向贯穿的DNA分子。狭义而言,某一生物的细胞中储存于单倍染色体组中的总遗传信息,组成该生物的基因组。真核生物基因组DNA的含量比原核生物高得多。 突变分析结果表明,并非所有基因
华人科学家解读重塑DNA结构的双面蛋白
微小染色体维持蛋白MCM(mini-chromosome maintenance)能够维持DNA结构,维护基因组的稳定性，该蛋白还具有解螺旋酶活性，在DNA复制的起始和延伸过程中有重要作用。 日前，南加州大学的科学家们发现MCM也会通过改变DNA形态，给癌细胞助一臂之力，这种蛋白在癌细
清华大学生科院在Nature上发表论文阐述染色质重塑机理
2017年4月19日，清华大学生命科学学院陈柱成课题组和李雪明课题组合作在《自然》（Nature）杂志上以长文（Research Article）形式在线发表题为《Snf2-核小体复合物结构揭示的染色质重塑机理》（Mechanism of chromatin remodelling reveal
时隔两年－清华大学青年学者再发Nature解析染色质重塑
在真核生物细胞内，DNA缠绕着组蛋白八聚体形成染色质的基本组成单位，核小体。染色质在包装、保护遗传物质方面发挥着关键作用。 染色质形成同时对细胞内的一些生理过程，如DNA复制、转录、修复等产生了巨大的障碍。为此SWI/SNF家族染色质重塑复合物通过利用ATP水解的能量调控染色质的结构，广泛参与
Nature：解析人源PBAF染色质重塑复合物结合核小体的结构
清华大学生命科学学院/结构生物学高精尖创新中心/清华-北大生命科学联合中心陈柱成教授研究团队在《自然》杂志在线发表题为“人源PBAF染色质重塑复合物结合核小体的结构”（Structure of human PBAF chromatin remodeling complex bound to a
DNA的化学检测项目介绍X染色质
X染色质介绍： 染色质与染色体是在细胞周期的不同时间所呈现形态结构不同的同一物质。X染色质正常值： 在妊娠16周前后，从孕妇腹壁外采取胎儿的羊水，用低速离心，使羊水中漂浮的胎儿脱落细胞沉淀，取沉淀物。镜下检查可数细胞100个，算出X小体的百分率。男胎的X小体占0％-2％，小于5％可判为男胎。X染
DNA的化学检测项目介绍Y染色质
Y染色质介绍： 男性Y染色体长臂远侧由异染色质构成，如用荧光染料染色时，可出现强荧光。Y染色质正常值： 可数100个细胞，计算阳性率，男胎的Y小体＞50％，大于10％判为男胎；女胎的Y小体占0％-1％，小于5％则判为女胎。Y染色质临床意义： 临床上检查Y小体，也关联到X连锁遗传病，如血友病等只
染色质DNA的二级结构介绍
生物的遗传信息储存在DNA的核苷酸序列中,生物界物种的多样性也寓于DNA分子4种核苷酸千变万化的排列之中。DNA分子不仅一级结构具有多样性,而且二级结构也具有多态性。所谓二级结构是指两条多核苷酸链反向平行盘绕所生成的双螺旋结构。DNA二级结构构型分3种： ①B型DNA（右手双螺旋DNA）,是“
科学家称未来通过DNA可重塑疑犯面部特征
北京时间9月18日消息新科学家报道，最新研究表示警察可能有朝一日通过嫌疑犯的DNA，重塑他们的面部。而这项可能性多亏了鉴定出人体五种决定面部形状和特征的基因。 预测眼部、头发和皮肤颜色的DNA测试目前已经存在或者正在研发中，因此鉴别出与面部特征有关的基因能够帮助纯粹利用某人的DNA建造更为
著名学者庄小威Nature解析核小体重塑
来自哈佛大学的研究人员在新研究中探究了ISWI染色质重塑因子协调重塑核小体的机制。研究结果发表在6月29日的《自然》（Nature）杂志上。 文章的通讯作者之一是著名的华裔女科学家，哈佛大学庄小威（Xiaowei Zhuang）教授，庄教授早年毕业于中国科技大学少年班，34岁的时候就成为了哈佛
不同核苷酸状态下Snf2核小体复合物的冷冻电镜结构
SWI/SNF家族蛋白利用ATP水解产生的能量移动核小体在基因组DNA的位置，重塑染色质。这对于控制遗传物质的开放性，调节基因转录等方面发挥重要作用。陈柱成实验室近期报道了Snf2与核小体结合的结构。但这个早期的工作并没有明确检测到DNA移位。 染色质重塑蛋白如何利用ATP水解的能量推动核小体滑移依
中国科大在染色质重塑SWI/SNF与INO80复合体结构研究获进展
中国科学技术大学教授蔡刚课题组利用冷冻电镜技术，解析了染色质重塑SWI/SNF与INO80复合体及其不同核小体结合状态复合物的三维结构，揭示了SWI/SNF与INO80复合体共有的肌动蛋白(Actin)和核肌动蛋白相关蛋白(Arps)组成的Actin/Arp模块作为构象调控的分子开关，调控核小体结合
癌症相关的基因突变类型及临床解释－ATRX
该基因编码的蛋白含有一个atpase/螺旋酶结构域，因此属于染色质重塑蛋白的swi/snf家族。这种蛋白被发现经历了细胞周期依赖性磷酸化，它调节其核基质和染色质的结合，并表明它参与有丝分裂的间期基因调节和染色体分离。该基因突变与X连锁精神发育迟滞（XLMR）综合征有关，通常伴有α-地中海贫血（ATR
DNA损伤修复信号通路ATRX基因的临床解释
该基因编码的蛋白含有一个atpase/螺旋酶结构域，因此属于染色质重塑蛋白的swi/snf家族。这种蛋白被发现经历了细胞周期依赖性磷酸化，它调节其核基质和染色质的结合，并表明它参与有丝分裂的间期基因调节和染色体分离。该基因突变与X连锁精神发育迟滞（XLMR）综合征有关，通常伴有α-地中海贫血（ATR
ATRX基因的结构特点和作用
该基因编码的蛋白含有一个atpase/螺旋酶结构域，因此属于染色质重塑蛋白的swi/snf家族。这种蛋白被发现经历了细胞周期依赖性磷酸化，它调节其核基质和染色质的结合，并表明它参与有丝分裂的间期基因调节和染色体分离。该基因突变与X连锁精神发育迟滞（XLMR）综合征有关，通常伴有α-地中海贫血（ATR