非靶向代谢组学更适宜选用哪些代谢组学通路数据库？
据相关介绍表明非靶向代谢组学的研究成果为众多的药物靶学、疾病机理研究以及疾病诊断提供有力依据。它还推动了免疫组化以及免疫荧光等技术的发展，事实上长期供应非靶向代谢组学更是由此迅速推进了研究步伐，现在就非靶向代谢组学更适宜选用哪些代谢组学通路数据库作简要阐述：1.HMDB非靶向代谢组学的代谢通路必须借助多类不同的数据库进行准确分析。比如进行动物粪便代谢产物分析时，若是没有有力的数据库进行源数据对比分析，那么便难以确定动物粪便代谢产物中包括哪些未知成分，而HMDB数据库已收集了大量适用于鉴定体内内源性代谢物的参考数据。2.KEGGKEGG是集合了众多大型分子数据集生成的基因组测序的实用程序数据库资源，选用这个数据库里面的资源对于提升非靶向代谢组学研究效率具有巨大的帮助。KEGG有助于帮助分析人员筛别动物粪便代谢的生物学信息、基因和蛋白质信息，从而便于提升代谢组学研究的准确性。3.Reactome非靶向代谢组学还适宜选用Reactom......阅读全文
代谢组学：未来新方向
加拿大阿伯特大学生命科学与计算科学教授David Wishart说，我们自身其实就是一大组生化反应，“因此，基因组和蛋白质组不断进化来支持代谢组，而不是相反的路径。” Wishart说，有别于其他组学方法，代谢组学提供了一种更加直接的生理状态检测方式。代谢组反应营养、胁迫或者疾病状态的速度比转
“代谢组学”技术与方法研究
【基于质谱的分析方法联用对”代谢组学”进行研究】 代谢组学”研究可分为：“发现代谢组学”和“靶标代谢组学”，两者共同组成了“代谢组学”研究的“生态系统”。本文将介绍基于质谱的分析方法联合统计学分析法对“代谢组学”进行研究。质谱能在一个广泛的动态范围内保持极高的检测灵敏度、高度的稳定性、重现
如何看待代谢组学的前景
是不错的，但是代谢组本身还是一个发展中的新型学科，一些关键性技术还有待突破，如果你只想使用代谢组学而不去深入的研究它的话就应该没问题，如果想要进一步研究代谢组学方法就需要有相当的分析化学知识。现在世界前十的药厂都在使用代谢组学进行药学研究，所以它在里面的前景肯定是不会差的。随着技术的发展肯定会越来越
“代谢组学”技术与方法研究
【基于质谱的分析方法联用对”代谢组学”进行研究】 代谢组学”研究可分为：“发现代谢组学”和“靶标代谢组学”，两者共同组成了“代谢组学”研究的“生态系统”。本文将介绍基于质谱的分析方法联合统计学分析法对“代谢组学”进行研究。质谱能在一个广泛的动态范围内保持极高的检测灵敏度、高度
如何看待代谢组学的前景
是不错的，但是代谢组本身还是一个发展中的新型学科，一些关键性技术还有待突破，如果你只想使用代谢组学而不去深入的研究它的话就应该没问题，如果想要进一步研究代谢组学方法就需要有相当的分析化学知识。现在世界前十的药厂都在使用代谢组学进行药学研究，所以它在里面的前景肯定是不会差的。随着技术的发展肯定会越来越
代谢组学——肿瘤研究的利器
细胞内许多生命活动是发生在代谢物层面的，代谢物更多地反映了细胞所处的环境，比如细胞现在是不是健康？药物是否起效？环境污染物是不是正在伤害细胞？等等。由此，20世纪90年代，衍生出了一门新学科：代谢组学。它回答了基因组学和蛋白质组学不能回答的问题：细胞到底发生了什么？ 1、肿瘤与代谢组学 肿瘤
进入前景光明的代谢组学
内容概要： 一、代谢组学在药物研发中的应用 二、SiDMAP技术在疾病诊断中的应用 三、仪器公司的研究开发：ThermoFisher Scientific公司和Advion Biosciences公司正在研发分析代谢物的更为灵敏的检测方法，而Bio-Rad公司正在发展用Holly Grail作
Bruker在ASMS－2016上推出最新代谢组学数据库
新型MetaboBASE Personal Library提高分析人员深入进行代谢物鉴定的信心 分析测试百科网讯 2016年6月6日—在ASMS 2016会议上，Bruker推出最新质谱数据库，被称为Bruker MetaboBASE Personal Library™，该数
中药基础物质、代谢及代谢组学研究方案
中药组成成分复杂、作用环节多样，中药药效物质基础以及临床疗效机理的阐明，已成为中医药现代化研究的重要内容。如何快速地从海量的质谱数据中获取有价值的信息，减轻繁重的数据处理工作量，成为广大中医药研究工作者的心声。 赛默飞的Compound Discoverer软件针对中药成分鉴定、体内代谢转化和
代谢组学、脂质组学在病毒研究中的应用（一）
在疫情逐步可控的情形下，一线的医务工作者和科研人员将有更多精力和时间对冠状病毒进行更深一步的研究和认识。我们此次调研了基于Orbitrap超高分辨的代谢组学，脂质组学，以及药物治疗在病毒学研究中的应用。致敬白衣天使和深耕医学研究的学者。 目前的研究显示，新型病毒进入细胞的路径与SARS冠状病毒一样，
代谢组学、脂质组学在病毒研究中的应用（二）
案例三基于代谢组学技术挖掘病毒感染宿主后代谢动态变化情况2019年发表在Viruses杂志上的另一篇文章，采用基于Orbitrap 的非靶标和靶标代谢组学方式研究了麻痹病毒（Cricket paralysis virus, CrPV）感染昆虫Bm5细胞后宿主代谢的动态变化情况。研究人员发现，CrPV
实质等同性（代谢组学）实验
实验材料SIMCA - P 多变量统计软件试剂、试剂盒[ 1H ] - NMR 抽提剂仪器、耗材Eppendorf 聚丙稀管NMR 管NMR 波谱仪实验步骤本章描述的方法最适合于分析小麦精白面，但改进后也适用于全面粉、麦麸或其他组织，如叶和根。在开展实质等同性代谢组学实验前，如其他任何田间试验或温室
实质等同性（代谢组学）实验
实验材料 SIMCA - P 多变量统计软件试剂、试剂盒 [ 1H ] - NMR 抽提剂仪器、耗材 Eppendorf 聚丙稀管NMR 管NMR 波谱仪实验步骤 本章描述的方法最适合于分析小麦精白面，但改进后也适用于全面粉、麦麸或其他组织，如叶和根。在开展实质等同性代谢组学实验前，如其他任何田间试
实质等同性（代谢组学）实验
实验材料：SIMCA - P 多变量统计软件 试剂、试剂盒：[ 1H ] - NMR 抽提剂 仪器、耗材：Eppendorf 聚丙稀管 NMR 管
临床代谢组学研究常见问题
分享一些我们举办完第一期微信公开课——临床代谢组学研究策略后，所收集到的常见问题，供大家学习和参考。Q：如何设置验证集和测试集？A：按我理解你想问的问题是：training set训练集和test set测试集的设置问题。我们做分析化学、生物化学或者分子生物学的初学者通常会混淆这几个数据集概念，通常
代谢组学全流程解决方案
赛默飞基于其超高分辨的静电场轨道阱（Orbitrap）质谱平台结合其功能强大的软件平台，提供代谢组学全流程解决方案。该方案不仅覆盖从极性代谢物到非极性代谢物的全面检测、峰提取与定量、统计学分析与可视化作图、代谢产物的全面鉴定、代谢通路分析等全流程的要求，而且还整合了从非靶标生物标记物发现到靶标生物标
质谱仪在代谢组学和代谢研究中有着杰出表现
质谱仪以离子源、质量分析器和离子检测器为核心。离子源是使试样分子在高真空条件下离子化的装置。电离后的分子因接受了过多的能量会进一步碎裂成较小质量的多种碎片离子和中性粒子。它们在加速电场作用下获取具有相同能量的平均动能而进入质量分析器。质量分析器是将同时进入其中的不同质量的离子，按质荷比m/e大小分
【JOAT刘虎威编者按】专题：代谢组学和脂质组学
刘虎威教授担任《Journal of Analysis and Testing》第三期特刊的客座主编。 近日，刘虎威教授担任《Journal of Analysis and Testing》第三期特刊的客座主编进行了约稿审稿工作，并撰写了题为“专题：代谢组学和脂质组学”的编者按。 代谢
首篇梅毒患者血清的非靶代谢组学研究发表
梅毒是世界范围内一种常见的性传播疾病，致病病原体是梅毒螺旋体，2017年，中国疾控中心报告梅毒新发病例47.5860万例，死亡45人，在所有乙类传染病中排名第三位。今天小编要为各位老师解读一篇APT客户厦门大学附属中山医院杨天赐课题组最近发表的文献，是首篇对梅毒患者进行代谢组学研究的文章，并筛选到了
代谢组学：一项艰巨的任务
学生化的孩子真是伤不起。糖代谢、脂代谢、核酸代谢，一系列代谢通路，一大堆代谢产物，简直让人头晕眼花。然而，这又不能跳过。毕竟，DNA编码蛋白质，而蛋白质在小分子上发挥其魔力。但很多时候，科学界对这些分子一无所知。 “如果你测定一滴血中的小分子，大约60% 所检测到的峰都无法与任何代谢物相匹配，
临床代谢组学研究常见问题（一）
分享一些我们举办完第一期微信公开课——临床代谢组学研究策略后，所收集到的常见问题，供大家学习和参考。 Q：如何设置验证集和测试集？ A：按我理解你想问的问题是：training set训练集和test set测试集的设置问题。我们做分析化学、生物化学或者分子生物学的初学者通常会混淆这
临床代谢组学研究常见问题（一）
分享一些我们举办完第一期微信公开课——临床代谢组学研究策略后，所收集到的常见问题，供大家学习和参考。 Q：如何设置验证集和测试集？ A：按我理解你想问的问题是：training set训练集和test set测试集的设置问题。我们做分析化学、生物化学或者分子生物学的初学者通常会混淆这
AFADESI空间代谢组学高级研修班
为做好AFADESI空间代谢组学技术服务工作，由中国科学院高能物理研究所测试中心和中国科学院-香港大学金属组学与健康和环境联合实验室共同承办的“AFADESI空间代谢组学高级研修班”将于2023年4月26日-4月27日在京召开。在这里，我们将竭诚为您提供丰富的前沿应用信息和与专家零距离交流的平台
综述：代谢组学在疾病中的应用
代谢组学经历了迅猛的技术演化在过去二十年。尤其是广泛靶向代谢组学技术的新起，实现一次性检测坚定上千种物质，同时能够定量。整合了非靶向和靶向代谢物检测技术的优点，创造性实现了高通量、高灵敏度靶向代谢物检测，为定性、定量检测大批量、低丰度代谢物提供了高效的方法。 应用代谢组学的定义事件的预测生
利用精确血浆代谢组学方法揭示衰老相关代谢特征
过去二十年里，代谢（脂质）组学研究得到了迅速发展。液相色谱与高分辨质谱联用（LC-HRMS）技术是目前内源性代谢物最常用的手段，然而困扰LC-HRMS技术的分析精度和结构鉴定的瓶颈问题仍然存在。尤其是血浆样本，其组分化学性质各异，同时复杂的基质会显著减低代谢物定性与定量结果的准确性，导致生物学信
安捷伦使用代谢组学方法研究胚胎大脑发育的新型毒性通路
安捷伦科技联手约翰霍普金斯大学使用代谢组学方法研究胚胎大脑发育的新型毒性通路 2010 年 8 月 23 日，北京 — 安捷伦科技公司（NYSE：A）和安捷伦基金会今日宣布，Thomas Hartung 博士荣获安捷伦思想领袖奖，该奖项肯定了 Thomas Hartung
Cell提出一个新“组学”：蛋白质代谢小分子互动组学
科学家们提出了一个新的“组学”——一个处理蛋白质和小分子之间相互作用的互动组学（protein-metabolite interactomics）。此前系统生物学家专注于基因组学或蛋白质组学，现在他们日益发现了蛋白质-代谢小分子之间相互作用的重要性。 基因组学针对的是生物体基因的系统分析，而蛋
将领域知识引入神经网络，MIT团队用光谱Transformer研究非靶向代谢组学图谱
代谢组学研究已经确定了介导细胞信号传导、竞争和疾病病理学的小分子，部分原因是大规模社区努力测量数千种代谢物标准品的串联质谱。然而，在临床样品中观察到的大多数光谱不能与已知结构明确匹配。令人惊讶的是，用于阐明小分子结构的深度学习方法无法与经典统计方法相媲美，科学家认为这可能是由于缺乏纳入当前神经网络架
Agilent与Stemina－宣布代谢组学领域的合作
Agilent与Stemina 生物标记物发现公司宣布共同促进 Stemina 的代谢组学研究 2010 年 5 月 24 日，北京——安捷伦科技公司(纽约证交所：A)与 Stemina 生物标记物发现公司(Stemina Biomarker Discovery, Inc.)今日宣布，两家公司