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基因告诉你,瘟疫来自哪里

上个月底世界卫生组织发出全球警告:一位卡塔尔人感染了新的冠状病毒。由于感冒和SARS病原都属于冠状病毒的家族,这个消息让各国感到紧张。 英国研究者从患者身上取出病毒,对比今年较早前一位沙特阿拉伯死者体内的病毒:两者有99.5%相似。研究者由此猜测,患者是在沙特感染。的确,这位卡塔尔人几个月前去沙特旅游过。 “现在的高通量核酸测序技术,能以非常低的价格大量测定基因组。这就给传染病研究者提供了机会。”在10月13日召开的中国科协“新观点、新学说”学术沙龙上,军事医学科学院研究员杨瑞馥说,“面临新发、突发传染病。只要准确溯源,就可以切断传染病的源头。” 科学家溯源,靠的是比对各病原样本的DNA:就像子女跟父母略有不同,病原在进化中会增加变异。两个样本的变异特征越相近,就说明亲缘越近。 “2009年青海有一次肺鼠疫的暴发。我们经过全基因组序列的分析,得出结论:这次暴发是由一只牧羊犬导致的。”杨瑞馥说,“这就给......阅读全文

OPGEN全基因组图谱应用系列——鞭虫全基因组测序

鞭虫是一种常见的土壤传播寄生虫,地理分布广,感染率高,寄生于人体盲肠,导致人体慢性感染,对人类危害巨大。鞭虫的全基因组测序研究由著名的桑格研究院(Wellcome Trust Sanger Institute)完成,发表在世界顶级期刊《Nature Genetics》上。该研究通过对2种不同

虎尾海马全基因组破译

  中科院南海海洋研究所、德国康斯坦茨大学、华大基因和新加坡A*STAR研究院联合破译了虎尾海马的全基因组。有关研究成果日前以封面文章的形式发表在《自然》杂志上。  海马隶属于海龙科。与其他硬骨鱼不同,海马呈现高度特殊的形态,例如头部前方具有管状长嘴,无腹鳍和尾鳍,尾端卷曲,全身覆盖硬骨骼,没有鳞片

人类全基因组测序计划

  全基因组测序是对未知基因组序列的物种进行个体的基因组测序。 1986年, Renato Dulbecco是Z早提出人类基因组测序的科学家之一。他认为如果能够知道所有人类基因的序列,对癌症的研究将会很有帮助。美国能源部(DOE)与美国国家卫生研究院(NIH),分别在1986年与1987年加入人类基

全基因组扩增技术介绍

研究人员通常会在下游分析中遭遇DNA样本量有限或不足的问题。QIAGEN的全基因组扩增技术通过以包括单细胞在内的小量样本或珍贵样本扩增获得基因组DNA,解决此类难题。REPLI-g Kit能够准确地复制原始DNA样本,不会造成偏差,扩增后的DNA可以直接应用于广泛的遗传学分析。什么是全基因组扩增(w

全基因组的比较基因组杂交技术介绍

Whole-Genome and Custom Fine-Tiling Array CGHComparative Genomic Hybridization (CGH) measures DNA copy number differences between a reference genome a

NIH 2500万资助Venter传染病基因组研究

        近日,美国国家卫生研究院(National Institutes of Health)授予美国克雷格·文特尔研究所(J.Craig Venter Institute)2500万美元,以支持传染性疾病(疟疾和流感)的基因研究,旨在基因水平寻找到更好的治疗方法和预防措施。  研究所的发言

多国实施全基因组分析计划

  由于基因测序可以探查与特定疾病相关的基因,该疗法正在成为日益受欢迎的诊断方法。   英国计划到2017年对10万人进行基因组测序。   美国加州一对龙凤胎出生后,他们的父母非常忧虑:两个婴儿不仅发育缓慢,而且肌肉松软无力。大脑扫描结果显示,男婴或存在大脑性麻痹;然而医生对造成女婴震颤和癫痫

全基因组测序的诊断价值

  根据《Nature Genetics》上发表的一项新成果,全基因组测序有望用于临床上的遗传病诊断。这项研究评估了影响全基因组测序在临床诊断中取得成功的因素。  这个国际研究小组由英国的研究人员领导,对156个病例或家庭开展了临床基因组测序。这些病例有着遗传疾病的特征,但无法通过之前的筛查检测来解

全血基因组提取操作步骤

操作步骤((200ul全血))* 第一次使用前请先在15ml漂洗液WB中加入60ml无水乙醇! 1. 取200ul新鲜、冷冻或加入各种抗凝剂的血液,放入1.5ml离心管。对如果全血起始量小于200μl,则用缓冲液BB补足到200μl。如果起始量介于200μl-300μl之间,则后续操作需要按照比例增

全基因组测序各步骤工具

全基因组测序(WGS)是下一代测序技术,用于快速,低成本地确定生物体的完整基因组序列。基因组的深度测序对于临床研究的意义重大,解读WGS数据并了解基因组突变在健康和疾病中的重要性是精准医疗的基石。WGS分析流程能分为三大块,数据处理、检测变异和综合分析,具体如下图所示:由于WGS现在已经非常成熟了,