“鸟枪法(shotgun)”定量蛋白质组学技术
1999年，Yates研究组提出“鸟枪法”(shotgun)，其基本技术路线是针对液体或SDS-PAGE条带的复杂混合物用酶(Trypsin)酶解成肽段混合物，然后对肽混合物进行多维毛细管液相色谱分离和串联质谱分析以及数据库检索，从而确定蛋白质的种类，可同时鉴定成百上千种蛋白质。他们把这种思路称为多维蛋白质鉴定技术，即Mud PIT(multidi-mensional protein identification technology)。与传统的双向电泳技术相比具有灵敏度更高，动态检测范围更广等特点。 现在，鸟枪法（Shotgun）蛋白质组学是指使用自下而上（bottom-up）的蛋白质组学技术来研究复杂混合物中的所有蛋白质，如血清、尿液和细胞裂解液等。它结合了高效液相色谱（HPLC）技术和质谱技术（MS）。鸟枪法蛋白质组学的最独特之处在于，它可以在最小限度分离蛋白质（不再使用二维凝胶......阅读全文
“鸟枪法(shotgun)”定量蛋白质组学技术
1999年，Yates研究组提出“鸟枪法”(shotgun)，其基本技术路线是针对液体或SDS-PAGE条带的复杂混合物用酶(Trypsin)酶解成肽段混合物，然后对肽混合物进行多维毛细管液相色谱分离和串联质谱分析以及数据库检索，从而确定蛋白质的种类，可同时鉴定成百上千种蛋白质。他们把这种思路称
鸟枪法如何测序
全基因组鸟枪法测序（Whole Genome Shotgun Sequencing）无需构建各类复杂的物理图谱和遗传图谱，采用最经济有效基因组鸟枪法测序/鸟枪法Shotgun测序（Whole Genome Shotgun Sequencing）无需构建各类复杂的物理图谱和遗传图谱，采用最经济有效的实
实验室分析技术基于HPLCMS/MS的蛋白质组学技术
基于高效液相色谱串联质谱（HPLC-MS/MS）的蛋白质组学技术的发展主要取决于液相色谱-质谱联用分析设备、样品分离和制备技术、鉴定以及生物信息学。目前，shotgun鸟枪法是最常用的大规模蛋白质鉴定策略。如下图所示，在自下而上分析策略中，蛋白质通过蛋白水解酶水解成肽的混合物，然后通过色谱法或亲和分
质谱技术在蛋白质组研究中的分析方法
2003年人类基因组精细图绘制完成，是人类科学史上一个里程碑式的事件。后基因组时代的研究重点自然落在了蛋白质头上。为啥？因为中心法则告诉我们，基因的产物——蛋白质，是生命活动的最终执行者。与基因组类比，研究生物体内全套蛋白质的科学，就是蛋白质组学。基因组计划完成的同年，人类蛋白质组计划启动，令人激动
质谱技术在蛋白质组研究中的分析方法介绍
2003年人类基因组精细图绘制完成，是人类科学史上一个里程碑式的事件。后基因组时代的研究重点自然落在了蛋白质头上。为啥？因为中心法则告诉我们，基因的产物——蛋白质，是生命活动的最终执行者。与基因组类比，研究生物体内全套蛋白质的科学，就是蛋白质组学。基因组计划完成的同年，人类蛋白质组计划启动，令人
鸟枪法测序的方法特点
中文名称鸟枪法测序英文名称shotgun sequencing定 义一种分析大片段基因组DNA序列的策略。系将大片段DNA(如噬菌体文库中约40 kb长或细菌人工染色体所含350 kb长的DNA插入片段)随机切成许多1～1.5 kb的小片段，分别对其测序，然后借助序列重叠区域拼接成全段序列。应用学
数据非依赖采集DIA－解决方案（一）
一、数据非依赖采集（DIA）随着生命科学的快速发展，蛋白质组学的关注焦点和研究趋势已经逐渐从定性转向定量。定量蛋白质组学是对细胞、组织乃至完整生物体的蛋白质表达量及差异进行分析，对于生物过程机理的探索和临床诊断标志物的发现与验证具有重要意义。基于静电场轨道阱 Orbitrap 的数据非依赖采集（Da
鸟枪法蛋白质鉴定质量控制方法研究进展
【摘要】鸟枪法串联质谱蛋白质鉴定策略由于其高可靠和高效率而被广泛应用于蛋白质组学研究中，这种方法直接对蛋白质混合物进行酶切，以肽段为鉴定单元，继而推导真实的样品蛋白质。由于利用质谱图推导肽段存在一定的假阳性率，而且直接对蛋白质混合物的酶切也导致了肽段和蛋白质之间关联信息的丢失，所鉴定的蛋白质难免存在
蛋白质组和蛋白质组学分析
随着人类基因 组计划研究成果的公布，人们对基因的认识逐渐清晰，但基因数量的有限性和基因结构的相对稳定性，与生命现象的复杂性和多样性之间存在巨大反差。如何了解众多的基因与危害人类身心健康的疾病之间的关系，对生命科学研究者来说仍是一项长期而艰巨的任务。因此，作为生命活动的直接承担者――蛋白质，成为后基
更快更灵敏的timsTOF－Pro：为蛋白质组学而生
分析测试百科网讯，今年9月国际人类蛋白质组学大会（HUPO）上，布鲁克公司发布timsTOF Pro捕集离子淌度飞行时间质谱，该产品获得了由分析测试百科网组织评选的2017 ANTOP大奖，奖项名称为“蛋白质组学创新质谱技术奖” 。BCEIA展会上，分析测试百科网编辑采访到布鲁克道尔顿中国区高级
什么叫做鸟枪法
基因测序“鸟枪法”，也俗称“霰弹法”。简单地说，它有点类似生活中玩的拼图游戏。拼图游戏是将一个完整的画面分成杂乱无章的碎块，然后重新拼装复原。而“鸟枪法”则是先将整个基因组打乱，切成随机碎片，然后测定每个小片段序列，最终利用计算机对这些切片进行排序和组装，并确定它们在基因组中的正确位置。
DNA测序——鸟枪法
实验方法原理"鸟枪法"是一种由生物基因组提取目的基因的方法。首先利用物理方法(如剪切力、超声波等)或酶化学方法(如限制性内切核酸酶)将生物细胞染色体DNA切割成为基因水平的许多片段，继而将这些片段与适当的载体结合，将重组DNA转入受体菌扩增，获得无性繁殖的基因文库，再结合筛选方法，从众多的转化子菌株
鸟枪法脂质组学揭示白色和棕色脂肪有何不同
最近，德国多个机构的研究人员开发出一种鸟枪法脂质组学的新方法，对棕色脂肪和白色脂肪的分子图谱进行分析。这项成果于近日发表在《Molecular Metabolism》杂志上。 对哺乳动物而言，脂肪组织在全身能量平衡中起着关键作用。它主要以两种形式存在：白色脂肪主要作为能量储存器，而棕色脂肪有助
蛋白质组与蛋白质组学简介2
3 甲基化干扰实验用来检测蛋白质的结合位点。甲基化修饰的DNA探针可以干扰蛋白质的结合。结合位点上未被修饰的DNA片段才能与蛋白结合，然后将DNA从被修饰的碱基处切割，电泳分离，结合蛋白的DNA在结合位点上不能被修饰，不能切断，可确定结合位点的位置。 4 Dnase I 足纹分析 蛋白
蛋白质组与蛋白质组学简介1
一、蛋白质组概念：一个细胞、一个组织或一个机体全部基因所表达的全部蛋白质。 二、蛋白质组学研究范畴 1.蛋白质和蛋白质间 2.蛋白质和核酸之间 3.蛋白质及其组成质点的分离、分析、鉴定 4.蛋白质结构分析 5.生理、病理或不同发育状态下蛋白质组表
蛋白质组质谱新方法一览
2003年人类基因组精细图绘制完成，是人类科学史上一个里程碑式的事件。后基因组时代的研究重点自然落在了蛋白质头上。为啥？因为中心法则告诉我们，基因的产物——蛋白质，是生命活动的最终执行者。与基因组类比，研究生物体内全套蛋白质的科学，就是蛋白质组学。基因组计划完成的同年，人类蛋白质组计划启动，令人激动
蛋白质组，蛋白质组学及研究技术路线
基因组(genome)包含的遗传信息经转录产生mRNA，一个细胞在特定生理或病理状态下表达的所有种类的mRNA称为转录子组(transcriptome)。很显然，不同细胞在不同生理或病理状态下转录子组包含的mRNA的种类不尽相同。mRNA经翻译产生蛋白质，一个细胞在特定生理或病理状态下表达的所有种类
蛋白质组，蛋白质组学及研究技术路线
基因组(genome)包含的遗传信息经转录产生mRNA，一个细胞在特定生理或病理状态下表达的所有种类的mRNA称为转录子组(transcriptome)。很显然，不同细胞在不同生理或病理状态下转录子组包含的mRNA的种类不尽相同。mRNA经翻译产生蛋白质，一个细胞在特定生理或病理状态下表达的所有种类
DNA测序鸟枪法的介绍
“鸟枪法”是一种由生物基因组提取目的基因的方法。首先利用物理方法(如剪切力、超声波等)或酶化学方法(如限制性内切核酸酶)将生物细胞染色体DNA切割成为基因水平的许多片段，继而将这些片段与适当的载体结合，将重组DNA转入受体菌扩增，获得无性繁殖的基因文库，再结合筛选方法，从众多的转化子菌株中选出含
蛋白质组鉴定技术
如果目前分离蛋白质组的最好技术是2-DE，那么随之而来的挑战是数百数千个蛋白如何被鉴定. 在这里，我们不考虑传统的蛋白鉴定方法，如免疫印迹法、内肽的化学测序、已知或未知蛋白的comigration分析，或者在一个有机体中有意义的基因的过表达. 并不是因为这些方法无效，而是因为它们通常耗时
蛋白质组是什么
蛋白质组(Proteome)的概念最先由Marc Wilkins提出，指由一个基因组(genOME)，或一个细胞、组织表达的所有蛋白质(PROTein). 蛋白质组的概念与基因组的概念有许多差别，它随着组织、甚至环境状态的不同而改变. 在转录时，一个基因可以多种mRNA形式剪接，一个蛋白质组不是一个
蛋白质组鉴定技术
如果目前分离蛋白质组的最好技术是2-DE，那么随之而来的挑战是数百数千个蛋白如何被鉴定. 在这里，我们不考虑传统的蛋白鉴定方法，如免疫印迹法、内肽的化学测序、已知或未知蛋白的comigration分析，或者在一个有机体中有意义的基因的过表达. 并不是因为这些方法无效，而是因为它们通常耗时、耗
蛋白质组鉴定技术
如果目前分离蛋白质组的最好技术是2-DE，那么随之而来的挑战是数百数千个蛋白如何被鉴定. 在这里，我们不考虑传统的蛋白鉴定方法，如免疫印迹法、内肽的化学测序、已知或未知蛋白的comigration分析，或者在一个有机体中有意义的基因的过表达. 并不是因为这些方法无效，而是因为它们通常耗时、耗力，不
蛋白质组是什么
蛋白质组(Proteome)的概念最先由Marc Wilkins提出，指由一个基因组(genOME)，或一个细胞、组织表达的所有蛋白质(PROTein). 蛋白质组的概念与基因组的概念有许多差别，它随着组织、甚至环境状态的不同而改变. 在转录时，一个基因可以多种mRNA形式剪接，一个蛋白质组不是一个
蛋白质组的概念
蛋白质组(Proteome)的概念最先由Marc Wilkins提出，指由一个基因组(Genome)，或一个细胞、组织表达的所有蛋白质(protein). 蛋白质组的概念与基因组的概念有许多差别，它随着组织、甚至环境状态的不同而改变。 在转录时，一个基因可以多种mRNA形式剪接，一个蛋白质组不是一个
蛋白质组服务介绍
基因是生物体的基本遗传单位。然而，基因本身并不能直接行使功能，其功能的发挥最终需要通过表达出的蛋白质体现出来。蛋白质是细胞所有功能的主要执行者，其功能的发挥决定了人体健康与疾病的各种状态。蛋白质组是在宏观的角度全面、系统地解析蛋白质状态与功能的科学，是“后基因组”时代的核心研究内容。蛋白质组是比基因
蛋白质组研究系统
4700 TOF/TOF蛋白质组分析系统4700TOF/TOF蛋白质组分析系统是全球第一台TOF/TOF 串联飞行质谱仪，它作为目前的最新质谱技术，它一问世即被世界各大蛋白组研究中心和著名蛋白质实验室所争相采用。它由两级TOF和高能碰撞池组成，其工作原理是离子在MALDI源中产生并被加速和聚焦；对于
赛默飞代谢组学新技术新方法交流会成功召开
代谢组学新技术新方法交流会于2012年4月17日在中国科学院大连化学物理研究所生物技术部一楼会议室召开。本次会议由赛默飞世尔科技(以下简称：赛默飞)和中科院大连化物所共同举办。约五十位来自全国各地的代谢组学研究专家参加了此次会议。会议主要讨论了代谢组学仪器分析技术及在脂组学、中医药等研究中的应用
蛋白质组学不能被基因组和转录组取代
基因和蛋白并不存在严格的线性关系ORF并不预示一定存在相应的功能性基因mRNA水平并非与蛋白质的表达水平对应翻译后修饰及同工蛋白质（isforms)等现象在基因水平无从表现
转录组和蛋白质组有何异同之处
转录组是RNA转录后的全部产物,而转录后的产物经过加工修饰（例如甲基化、拼接、加尾等）后才变成蛋白质.相同之处就是他们的大部分结构相同.不同之处就是一个有加工过程,一个没有.