综述:代谢组学研究加快医学生物标志物的发现

生物标志物(Biomarker)是指“一种可客观检测和评价的特性,可作为正常生物学过程、病理过程或治疗干预药理学反应的指示因子”,作为个体化医疗的“关键词”之一,寻找和发现有价值的生物标志物已经成为当前医学领域的研究热点。 01研究现状和发展趋势 第一个肿瘤标志物可追溯到1846年由H Bence-Jones所证实的本周氏蛋白(Bence Jones Protein),对多发性骨髓瘤有一定的诊断作用。170余年后的今天,随着基因组学、蛋白质组学、肽组学、代谢组学等在内的组学平台,以及包括纳米技术、生物信息学、抗体芯片等前沿在内的手段与方法,都为快速获得及筛选生物标志物带来了极大的可能。 基因组学及转录组学描述的是机体可能发生改变的生理指标, 而代谢物则是存在于信号通路的终端产物,反映的是机体当时的生理状态。与其他组学相比,代谢组学由于与表型更为接近,因此更适于疾病分型和标志物发现的研......阅读全文

代谢组学的优势、应用及研究内容介绍

  我们知道细胞内的生命活动由众多基因、蛋白质、以及小分子代谢产物来共同承担,而上游的(核酸、蛋白质等)大分子的功能性变化最终会体现于代谢层面,如神经递质的变化、激素调控、受体作用效应、细胞信号释放、能量传递和细胞间通讯等,所以代谢组处于基因调控网络和蛋白质作用网络的下游,所提供的是生物学的终端信息

代谢组学的优势、应用及研究内容介绍

我们知道细胞内的生命活动由众多基因、蛋白质、以及小分子代谢产物来共同承担,而上游的(核酸、蛋白质等)大分子的功能性变化最终会体现于代谢层面,如神经递质的变化、激素调控、受体作用效应、细胞信号释放、能量传递和细胞间通讯等,所以代谢组处于基因调控网络和蛋白质作用网络的下游,所提供的是生物学的终端信息。如

代谢组学的优势、应用及研究内容介绍

  我们知道细胞内的生命活动由众多基因、蛋白质、以及小分子代谢产物来共同承担,而上游的(核酸、蛋白质等)大分子的功能性变化最终会体现于代谢层面,如神经递质的变化、激素调控、受体作用效应、细胞信号释放、能量传递和细胞间通讯等,所以代谢组处于基因调控网络和蛋白质作用网络的下游,所提供的是生物学的终端信息

肠道宏基因组学及代谢组学标志物或可诊断早期结直肠癌

  在大多数散发性结直肠癌病例中,肿瘤的发生是一个多阶段的过程,包括基因组的改变和形态学的改变。近年来,越来越多的证据显示,人类肠道微生物组与结直肠癌的发生具有一定的关联,更多的科学研究试图从粪便中分析肠道菌群的特点,以期找到有关肠道微生物与结直肠癌的线索。今年4月,两个科学团队在Nature Me

细胞衰老的溶酶体代谢组学研究的新突破

  溶酶体对细胞代谢至关重要,并异质地参与各种细胞过程。测量溶酶体代谢异质性的能力对于理解它们的生理作用至关重要。  2021年6月14日,中国科学技术大学熊伟与仓春蕾共同通讯在Nature Methods 在线发表题为“Metabolomic profiling of single enlarge

最新综述:光遗传学在生物医学领域中应用

  核心刊物”栏目期刊:科学通报,中国科学C辑:生命科学,均是由中国科学院和国家自然科学基金委员会共同主办的,我国学术期刊中的知名品牌,被国内外各主要检索系统收录,如国内的《中国科学论文与引文数据库》(CSTPCD)、《中国科学引文数据库》(CSCD)等;美国的SCI、CA、EI,英国的SA,日本的

【NEJM】综述:肺癌基因组学发现的临床意义

  Charles Swanton与Ramaswamy Govindan两位教授合作在最近的新英格兰医学杂志发文,全面综述肺腺癌、鳞癌和小细胞肺癌这三种常见的病理类型的大规模基因组学研究发现,及其在肺癌的发生发展和临床诊疗中的意义。  基因组变异  基因组概览  肺癌与吸烟高度相关,是突变负荷最强的

武汉物数所代谢组学评价纳米金棒生物效应研究获进展

  近日,依托于中科院武汉物理与数学研究所的中国科学院生物磁共振分析重点实验室的生物波谱及代谢组学研究组,在纳米金棒暴露的细胞代谢应答方面取得新进展,相关研究结果发表在Biomaterials上(Biomaterials 34; (2013) 7117-7126)。   十六甲基溴化铵(cet

安捷伦与贝勒医学院建立代谢组学质谱中心

  近日,安捷伦和贝勒医学院表示,他们已在BCM's Alkek Center for Molecular Discovery开启安捷伦卓越质谱中心。  安捷伦将为中心提供两个质谱代谢工作系统:6495 三重四极杆 LC/MS和6550 iFunnel QTOF LC / MS系统,具有可切换的GC

代谢组学研究的影响因素与降低生物化学和化学...(二)

组分提取软件的数据处理工作流程如图 4 所示。该软件能像分析人员一样解析数据,批量处理各个数据文件,而不是单独处理,并将每次运行得到的信息用于验证下一次运行获得的信息。按照这种方式,由于每种组分在数据集中的最大浓度点定义,从而大大减小了数据缺失值现象。同样的组分在低浓度样品中时,可以采用更靶标性

代谢组学研究的影响因素与降低生物化学和化学...(一)

代谢组学研究的影响因素与降低生物化学和化学噪音的策略目的为代谢组学生物标记物的发现开发一套全新的自动化工作流程和仪器分析方法。 前言在制药行业中,代谢组学用于研究潜在候选药物的药理学 响应所产生的生化变化,其识别毒性 / 药效标记物的能力可以显著加速药物研发的进程并帮助制定合适的临床计划。来自于

研究发现通过肠道细菌等绘制人类微生物组药物代谢图谱

  2019年6月,美国耶鲁大学医学院微生物发病机理和微生物科学研究所Andrew L. Goodman教授团队在国际顶尖杂志Nature上发表了题为“Mapping human microbiome drug metabolism by gut bacteria and their genes”

综述:基于质谱技术的糖蛋白质组学与糖组学研究进展

   糖是组成生命体的四大类重要分子之一,糖蛋白质是由糖链与肽链中的特定氨基酸残基以糖苷键共价连接而成的蛋白质。糖蛋白质普遍存在于生物体内,在很多生命过程中起着重要作用,如蛋白质的折叠、细胞之间的相互识别、炎症反应等。同时,糖基化修饰在疾病中,特别是肿瘤的发生、发展和转移过程中也起到重要作用,许多疾

LCMS8060助力广泛靶向代谢组学研究

mGWAS (metabolome  Genome-Wide Association  Study)指基于代谢组学的全基因组关联分析,是将代谢组数据作为表型,与基因型数据进行关联分析的一种方法。由于代谢组数据对表型鉴定更为精细,因此关联分析的精度比传统GWAS分析更高。 海南大学和华中农业大学的罗杰

大连化物所等肝癌代谢组学研究取得进展

  近日,中科院大连化学物理研究所许国旺研究员领导的高分辨分离分析及代谢组学研究团队(1808组)与上海东方肝胆医院王红阳院士课题组合作,将基于液相色谱-质谱用于肝癌组织非靶标代谢组学研究并取得了重要进展,相关研究成果已经在线发表在Cancer Research杂志上。   原发性肝癌是全球最

质谱综述:上交大吕海涛首次定义精准修饰代谢组学新法

近日,上海交通大学吕海涛研究员再次受邀在组学与质谱学领域著名杂志《Mass Spectrometry Reviews》(中科院分区1区TOP级杂志,影响因子9.526)发表评论文章“Mass spectrometry and associated technologies delineate the

国人佳作惊艳时代风口!蛋白质组学2021科研成果汇编

蛋白质组学(proteomics)是指系统研究某一基因组所表达的所有蛋白质,包括组成蛋白质一级结构的氨基酸序列,蛋白质的丰度,蛋白质的修饰以及蛋白质之间的相互作用。蛋白质组(proteome)的概念最早在1994年由澳大利亚 Maquaire大学的一个学生 Marc wilkins 提出,蛋白质组被

GCMS-HRAM-代谢组学数据库-探索代谢组学的奥秘

  盐城4公分厚外墙岩棉板报价    岩棉制品是以精选的优质玄武岩为主要原料、经冲天炉熔化后,采用的四辊离心制棉工序,将玄武岩高温熔体甩扭成4-7μm的非连续性纤维,再在岩棉纤维中加入一定量的粘结剂、防尘油、憎水剂,经过沉降、固化、切割等工艺,根据不同用途制成棉毡、半硬板、保温带、管壳等系列产品。

我国应加快太赫兹技术生物医学应用研究

很多患者在医院检查病情时,需要做X光、CT、核磁共振等一系列检查。太赫兹(THz)波,一个尚未充分开发的电磁波段,或许将会改变这种状况。4月8日—9日,在以“太赫兹波在生物医学应用中的科学问题与前沿技术”为主题的第488次香山科学会议上,与会专家指出,由于太赫兹波具有反应物质结构与性质的指纹特性,并

百趣生物:代谢组学检测领域的先行者

  --访上海百趣生物医学科技有限公司总经理邓军亮  代谢组学是继基因组学和蛋白质组学之后新近发展起来的一门学科,是系统生物学的重要组成部分。成立于2012年的上海阿趣生物科技有限公司(上海百趣生物医学科技有限公司全资子公司)是国内代谢组学和蛋白质组学检测方面的先行者之一,为近千家科研院所和相关企业

代谢组学新工具:METLIN

  METLIN是由美国Scripps研究院Gary J Patti和Gary Siuzdak开发出的新型数据库,将能用于解决代谢组学等领域研究中关于数据处理这个大问题。   超过上万个代谢物   目前METLIN包括有超过10,000个代谢产物中带有详细,高分辨率串联质谱信息的六万化合物,

如何看待代谢组学的前景

是不错的,但是代谢组本身还是一个发展中的新型学科,一些关键性技术还有待突破,如果你只想使用代谢组学而不去深入的研究它的话就应该没问题,如果想要进一步研究代谢组学方法就需要有相当的分析化学知识。现在世界前十的药厂都在使用代谢组学进行药学研究,所以它在里面的前景肯定是不会差的。随着技术的发展肯定会越来越

如何看待代谢组学的前景

是不错的,但是代谢组本身还是一个发展中的新型学科,一些关键性技术还有待突破,如果你只想使用代谢组学而不去深入的研究它的话就应该没问题,如果想要进一步研究代谢组学方法就需要有相当的分析化学知识。现在世界前十的药厂都在使用代谢组学进行药学研究,所以它在里面的前景肯定是不会差的。随着技术的发展肯定会越来越

进入前景光明的代谢组学

内容概要: 一、代谢组学在药物研发中的应用 二、SiDMAP技术在疾病诊断中的应用 三、仪器公司的研究开发:ThermoFisher Scientific公司和Advion Biosciences公司正在研发分析代谢物的更为灵敏的检测方法,而Bio-Rad公司正在发展用Holly Grail作

非靶向代谢组学与靶向代谢组学的区别主要表现在哪些...

非靶向代谢组学与靶向代谢组学的区别主要表现在哪些方面?非靶向代谢组学已实现了对众多生物体系代谢物进行定性和相对定量分析,其结果的分析为各类医学研究以及药物开发提供重要参考数据。特别是那些比较好的非靶向代谢组学更是致力挖掘基因与细胞间更深层的关系,现在就非靶向代谢组学与靶向代谢组学的区别主要表现在哪些

高深度空间代谢组学助力肿瘤微环境研究

肿瘤的发展除了与癌细胞自身基因突变导致的恶性增殖有关以外,还与肿瘤微环境息息相关。在癌症中,正常组织中和谐的细胞相互作用关系被破坏,原本保护正常细胞生存的微环境在肿瘤细胞的影响下,逐渐演变成适应肿瘤生长的条件。针对肿瘤微环境的检测和表征研究也可为癌症治疗提供新的思路。目前空间多组学技术已用于研究几种

功能代谢组学用于胶质瘤研究获进展

  近日,中国科学院大连化学物理研究所与美国NIH、哈尔滨医科大学附属第一医院合作将功能代谢组学用于胶质瘤研究取得新进展:利用毛细管电泳-质谱技术,发现瘤组织中的亚牛磺酸含量显著高于癌旁对照组织中的亚牛磺酸,并且与胶质瘤分级即恶性程度呈正相关。经过分子对接计算机模拟,科研人员发现亚牛磺酸能够与α-酮

布鲁克发布全新空间单细胞代谢组学研究策略

  摘要  * 创新的无偏原位空间单细胞代谢组学(SSCM)能够以单细胞分辨率实现高通量代谢组织样本表征;  * 基于 timsTOF fleX MALDI 的全新 5 μm microGRID 技术可在大视场内提供几乎无伪影的小分子图像;  * 创新的 4D-代谢组学可通过 CCS-Predict

岛津超快速质谱助力靶向代谢组学研究

  靶向代谢组学中,通常需要同时检测多个目标组分,这对质谱数据的采集速度提出了很高的要求。   岛津超快速质谱(UFMS)拥有业内首屈一指采集速度。以LCMS-8050为例,其驻留时间(Dwell time≥0.8 ms)、切换时间(Pause time≥1 ms)、扫描速度(Scan s

岛津超快速质谱助力靶向代谢组学研究

靶向代谢组学中,通常需要同时检测多个目标组分,这对质谱数据的采集速度提出了很高的要求。  岛津超快速质谱(UFMS)拥有业内首屈一指采集速度。以LCMS-8050为例,其驻留时间(Dwell time≥0.8 ms)、切换时间(Pause time≥1 ms)、扫描速度(Scan speed≤3