不止于遗传病和癌症,靶向测序还有这些用途

二代测序(NGS)的快速发展加速了遗传病、癌症等领域的研究,其本身也作为一种更为先进的基因检测手段逐步走进临床。在NGS的众多技术中,靶向测序正在成为新时代的“宠儿”。遗传病诊断(WES/Panel)、肿瘤伴随诊断(肿瘤多基因Panel)、免疫治疗疗效预测(WES/Panel),这些NGS应用热点都是靶向测序打下的“江山”。今天,咱们不谈常规操作,让小编给大家分享一些靶向测序的其他用途。图1:外显子测序被广泛应用于遗传病和癌症研究HPV整合位点检测HPV感染是宫颈癌的重要致病因素。在全世界范围内,每年有近50万宫颈癌新发病例,我国占了近三成。此前研究表明,99%的宫颈癌患者都存在HPV感染,备受关注的HPV疫苗正是针对了这个靶点。但绝大多数HPV感染都是一过性的,极少一部分感染者会最终发展成为宫颈癌。研究人员发现,从HPV感染到癌变的过程中,有些HPV病毒基因会“嵌入”(整合)到人体细胞的基因组中,整合事件的发生和癌变结局有着一......阅读全文

靶向深度测序和单细胞基因测序的区别

1、目标序列靶向测序是一种对感兴趣的基因组区域进行富集测序的研究策略。目标区域测序的主要优势在于可针对特定区域进行测序,有效降低了测序成本,提高了测序深度,能够更为经济有效地研究特定区域的遗传变异。2 单细胞测序是指单个细胞水平上对基因组进行测序。3、靶向测序步骤为 样品准备、探针/引物设计、目标序

靶向深度测序和单细胞基因测序的区别

1、目标序列靶向测序是一种对感兴趣的基因组区域进行富集测序的研究策略。目标区域测序的主要优势在于可针对特定区域进行测序,有效降低了测序成本,提高了测序深度,能够更为经济有效地研究特定区域的遗传变异。2 单细胞测序是指单个细胞水平上对基因组进行测序。3、靶向测序步骤为 样品准备、探针/引物设计、目标序

Nature子刊发布单色靶向测序法

  最近,研究人员开发出一种新的边合成边测序(sequencing-by-synthesis)方法,这种方法可让你在非常熟悉的平台上更快、更划算地进行靶向临床测序。相关研究结果发表在最近的《自然通讯》杂志(Nature Communications)。  新一代测序(NGS)技术通过降低测序的成本,

靶向测序:表达谱分析的新选择

  没有人愿意听到“癌症”这个词。不过在提到前列腺癌时,人们的情绪往往更加复杂:有些人的肿瘤不会扩散,需要积极监控;而有些人就没那么幸运,需要手术或放疗和化疗。医生所面临的挑战是正确的诊断,再加上适当的治疗。  Carlos S.Moreno是埃默里大学温希普癌症研究所(Winship Cancer

武汉大学研发纳米孔靶向测序检测方法

  记者从武汉大学获悉:该校组建的联合团队创新性开发的纳米孔靶向测序检测方法,能够大幅提升病毒阳性检出率,并能实现当天同时检测新冠病毒和其他10类40种常见呼吸道病毒并监测病毒突变,有助于破解临床疑似病例难以确诊的问题。  据介绍,既往新冠病毒诊断依赖于qPCR核酸检测,但是该方法显示出较高的假阴性

突破耐药基因组测序缺陷-靶向测序对抗耐药菌新契机

  自以抗生素为代表的抗菌剂问世以来,细菌对人类健康的危害得到了极大的控制。然而进入21世纪后,情况好似走入了另一个极端——由于抗生素滥用所致的耐药菌的出现以及广泛传播。这是由于在药物的选择压力下,敏感菌株被抑制或杀灭,天然耐药或获得性耐药菌株则继续生存、繁殖和克隆传播,导致细菌的耐药性增高。  细

安捷伦科技和Illumina共同推广靶向测序解决方案

新产品将Illumina Genome Analyzer的读长和安捷伦SureSelect平台有效结合,大大简化实验操作流程       2009年4月30日,北京——Illumina公司(NASDAQ:ILMN)和安捷伦科技(NYSE:A)于日前宣布,他们已经启动了一个非排他性的合作市场营销协

梅奥诊所通过靶向测序诊断短端粒综合征

  短端粒综合征(STS)是指一系列加速衰老的综合征。顾名思义,它们由基因突变导致端粒缩短而引起。细胞更新较快的器官,如皮肤、骨髓、肺和胃肠道,通常受到影响。梅奥诊所(Mayo Clinic)的研究人员近日利用靶向基因组学方法来寻找与疾病相关的基因突变。  梅奥诊所血液科的Mrinal Patnai

武大联合团队开发纳米孔靶向测序-快速“捕获”新冠病毒

   武汉大学联合团队创新性开发了纳米孔靶向测序检测方法(NTS),能大幅提升病毒阳性检出率,并能实现当天同时检测新冠和其他10大类、40种常见呼吸道病毒并监测病毒突变。  3月7日,该团队在预印版平台medRxiv发表题为《纳米孔靶向测序精准全面检测新冠病毒以及其他呼吸道病毒》的研究论文。  既往

追根溯源:细说靶向重测序与扩增子捕获技术

  追根溯源:细说靶向重测序与扩增子捕获技术   Thermo 与 Illumina合作的消息公布之后,在生物医学界投下了一颗重磅炸弹,Ion Ampliseq也一下子成为网络热搜词。Ion Ampliseq这个技术究竟是什么?它有什么独特之处?为什么这个技术会造成轰动性的效应呢?让我们追根溯源,

不止于遗传病和癌症,靶向测序还有这些用途

二代测序(NGS)的快速发展加速了遗传病、癌症等领域的研究,其本身也作为一种更为先进的基因检测手段逐步走进临床。在NGS的众多技术中,靶向测序正在成为新时代的“宠儿”。遗传病诊断(WES/Panel)、肿瘤伴随诊断(肿瘤多基因Panel)、免疫治疗疗效预测(WES/Panel),这些NGS应用热点都

追根溯源:细说靶向重测序与扩增子捕获技术

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安捷伦:用于RNA测序的文库制备与靶向序列捕获解决方案

简化的RNA和DNA测序解决方案,用于精简临床NGS  2020年9月1日,北京——安捷伦科技公司(纽约证交所:A)今日宣布推出SureSelect XT HS2 RNA试剂盒。该解决方案采用模块化设计,为RNA 和 DNA样品提供了一种简单的平行分析方法,从而确保客户能够简化并整合其工作流程,而无

PCRfree的靶向捕获技术遇上PCRfree-PacBio-SMRT测序

  高通量测序技术已经被广泛用于疾病基因组特征和分子机制研究,研究策略无非是全基因组测序或是靶向测序,在靶向测序中,常见的靶向富集技术有PCR扩增目的区域或基于探针的靶向捕获技术,但这两种方法都很难绕过一个关键步骤-PCR扩增,使得研究人员无法对原始的基因组区域进行测序,从而无法保证测序结果的真实性

DNA靶向测序panel:七个你不可不知的问答

在之前举办的NGS系列讲座中,我们邀请专家为您介绍了从样本制备到数据解读报告的全面NGS技术应用。讲座收到了众多反馈与咨询,在此我们总结出最受关注的7大问题,与您分享。1 QIAGEN的靶向基因扩增试剂盒能用在哪些NGS平台?GeneRead DNAseq Targeted Panels V2适用于

SageHLS靶向捕获大片段DNA在测序解析神经精神疾病CNVs结...

SageHLS靶向捕获大片段DNA在测序解析神经精神疾病CNVs结构研究的应用在2020年的美国AGBT(基因组生物学与技术进展)大会上,由斯坦福大学实验室的Alexander Urban和Hanlee Ji主导的一项国际合作项目中,研究人员使用SageHLS超大片段核酸回收系统在结构复杂的人类染色

靶向序列捕获和新一代测序前对石蜡包埋组织及...(一)

靶向序列捕获和新一代测序前对石蜡包埋组织及新鲜冷冻组织进行DNA质控靶向序列捕获和新一代测序前对福尔马林固定石蜡包埋组织及新鲜冷冻组织进行 DNA 质量控制 作者Melissa Huang Liu安捷伦科技有限公司美国加利福尼亚州拉霍亚Maria Celeste Ramirez安捷伦科技有限公司美国

靶向序列捕获和新一代测序前对石蜡包埋组织及...(二)

捕获前扩增四个 DNA 样品按照样品前处理工作流程(图 1)进行进一步处理。对捕获前扩增样品进行五次 PCR 循环,然后采用 DNA 1000 试剂盒在 2100 生物分析仪上进行分析(图 3)。 图3. 使用 Agilent 2100 生物分析仪及安捷伦 DNA 1000 试剂盒分析所得的捕获前扩

安捷伦推出首款商业化测序外显子靶向序列捕获试剂盒

安捷伦科技针对模式生物,推出世界首款 商业化下一代测序外显子靶向序列捕获试剂盒     2011 年 1 月 19 日,北京——安捷伦科技公司(纽约证交所:A)今日推出 ,这是全球首款可用于模式生物外显子靶向序列捕获的商业化系统,用以简化下一代测序实验。      日本 RIKEN

靶向捕获测序应用于多基因遗传病银屑病的致病基因鉴...

靶向捕获测序应用于多基因遗传病银屑病的致病基因鉴定银屑病,俗称干癣,是一种常见的具有特征性皮损的慢性易于复发的炎症性皮肤病,被认为是是遗传因素与环境因素等多种因素相互作用的多基因遗传病。 在以往对多基因遗传病的发病机理探索中,研究者们通过正常与疾病对照样本的基于SNP芯片的全基因组GWAS实验,寻找

安捷伦科技针对新一代测序仪的靶向序列捕获技术提速四倍

  2012 年 3 月 26日,加利福尼亚州圣克拉拉市——安捷伦科技公司(纽约证交所:A)推出了 HaloPlex 靶向序列捕获系统的加速版本,该版本适用于台式测序仪。使用该系统后,从前需要大约 24 小时才能完成的实验方案,现在不到 6 小时便可轻松结束。这就意味着,用户可在一

靶向克隆法

靶向克隆法是一种新的基因克隆方法,该克隆方法的特点是:在基因克隆过程中不使用已有的DNA Ligase,而是使用新开发的靶向克隆酶。靶向克隆酶能够使末端序列相同的双链DNA(14bp-18bp)同源重组,从而达到克隆基因的目的。LP Recco酶,中文名:靶向克隆酶,无需传统基因克隆所需要的限制性内

DNA测序的测序原理

DNA测序的测序原理是:利用一种DNA聚合酶来延伸结合在待定序列模板上的引物。直到掺入一种链终止核苷酸为止。每一次序列测定由一套四个单独的反应构成,每个反应含有所有四种脱氧核苷酸三磷酸(dNTP),并混入限量的一种不同的双脱氧核苷三磷酸。由于ddNTP缺乏延伸所需要的3-OH基团,使延长的寡聚核苷酸

DNA测序PCR测序反应

  1. 取0.2 ml的PCR管,用记号笔编号,将管插在颗粒冰中,按下表加试剂:  所加试剂 测定模板管 标准对照管  BigDye Mix 1 μl 1 μl  待测的质粒DNA 1 μl -  pGEM-3Zf (+) 双链DNA - 1 μl  待测DNA的正向引物 1 μl -  M13(

DNA测序的测序技术

高通量测序技术(High-throughput sequencing)又称“下一代”测序技术(Next-generation sequencing technology),以能一次并行对几十万到几百万条DNA分子进行序列测定和一般读长较短等为标志。根据发展历史、影响力、测序原理和技术不同等,主要有以

什么是靶向治疗

是在细胞分子水平上,针对已经明确的致癌位点(该位点可以是肿瘤细胞内部的一个蛋白分子,也可以是一个基因片段),来设计相应的治疗药物,药物进入体内会特异地选择致癌位点来相结合发生作用,使肿瘤细胞特异性死亡,而不会波及肿瘤周围的正常组织细胞,所以分子靶向治疗又被称为生物导弹。

RNA靶向的定义

中文名称RNA靶向英文名称RNA targeting定  义(1)针对RNA分子设计的一种定向作用技术。包括一些小分子化合物(如抗生素)、反义核酸、反式作用核酶、适配体、干扰小RNA等的应用。(2)由于RNA分子本身具有较大的柔性,能专一地与RNA、DNA和蛋白质相互作用,而成为一种特异的靶向试剂。

“基因靶向”技术介绍

“基因靶向”技术,通常被称作基因敲除,是指对一个结构已知但功能未知的基因,从分子水平上设计实验,将该基因去除,或用其他相近基因取代,然后从整体上观察实验动物,推测相应基因的功能。

靶向治疗是什么

许多新的用来治疗癌症的化疗药物,被称为靶向治疗。这类药物作用在癌细胞的特定部位,以阻断肿瘤细胞生长并扩散。他们主要起效于影响正常细胞转化成为癌细胞并转化成肿瘤。靶向治疗的目标是在减少对正常健康细胞的伤害下,摧毁癌细胞。靶向治疗可以用来治疗许多不同类型的癌症,包括肺癌、胰腺癌、头、颈、肝、结肠直肠癌,

什么是基因靶向?

基因靶向(英语:gene targeting,又称为基因打靶)是一种利用同源重组方法改变生物体某一内源基因的遗传学技术。这一技术可以用于删除某一基因、去除外显子或导入点突变,从而可以对此基因的功能进行研究。基因打靶的效果可以是持续的,也可以是条件化的。例如,条件可以是生物体发育或整个生命过程中的一个