构建单细胞癌症基因组时间序列模型，可预测乳腺癌细...
构建单细胞癌症基因组时间序列模型，可预测乳腺癌细胞克隆适应性不同生物会随着时间的推移不断进化，环境压力可促使具有某些特征的个体在群体中变得更加普遍。癌症也不例外，在不断增殖的肿瘤中，具有最佳竞争资源和抵御环境压力的癌细胞会逐渐占据主导地位。癌细胞的适应性（fitness）并不是一成不变的。在化疗药物的治疗环境中表现最好的癌细胞可能与无药物环境中茁壮成长的癌细胞迥然不同。因此，预测肿瘤如何随时间演变，尤其治疗进程中的肿瘤变化，一直是肿瘤学家面临的一项重大挑战。此外，由于缺乏多克隆群体的多时间点单细胞抽样和时间统计模型，在确定癌症基因组适应性，尤其是由拷贝数改变（CNA）定义的基因适应性方面的进展受到了阻碍。MSK计算机生物学家Sohrab Shah和乳腺癌研究员Samuel Aparicio牵头进行了一项新研究，利用基于人类演化的群体遗传学原理构建的机器学习方法，预测人类乳腺癌细胞克隆适应性的演变。该研究成果近日发表在Nature......阅读全文
构建单细胞癌症基因组时间序列模型，可预测乳腺癌细...
构建单细胞癌症基因组时间序列模型，可预测乳腺癌细胞克隆适应性不同生物会随着时间的推移不断进化，环境压力可促使具有某些特征的个体在群体中变得更加普遍。癌症也不例外，在不断增殖的肿瘤中，具有最佳竞争资源和抵御环境压力的癌细胞会逐渐占据主导地位。癌细胞的适应性（fitness）并不是一成不变的。在化疗药物
验血可更早地在患有早期乳腺癌的患者中预测癌症的复发
研究人员报告说，病人血液中的循环肿瘤DNA可在看似根治性疗法后被用来预测早期乳腺癌复发的可能性。 据一项新的研究披露，监控早期乳腺癌患者血液中的循环肿瘤DNA能在诊所用常规方法发现肿瘤之前约8个月准确地预测肿瘤的复发。这些发现为提前治疗患者以防止癌症转移打开了一个机会之窗，它们也表明
常规血液测试可预测癌症患者存活时间！
研究人员在新加坡ESMO亚洲2016年大会上报告，常规的血液检查可以预测姑息治疗中癌症患者的存活时间。 首席作者日本京都大学肿瘤学家Yu Uneno博士说，“需要姑息治疗中癌症患者诚实和准确的预后信息，但这种信息很敏感，必须尊重患者。” “患有晚期癌症的患者及其家属必须对治疗做出决定，何时寿
新技术构建机器学习模型可预测玉米株高
近日，中国农业科学院生物技术研究所玉米功能基因组团队与作物代谢调控与营养强化团队合作，首次对玉米自交系全生育期进行全自动高通量无损监测，深入解析了玉米株高形成的动态遗传基础和调控网络，并通过机器学习构建了株高的智能预测模型。该研究为玉米表型精准鉴定、重要基因克隆和株型改良提供了有效策略和新的基因资源
NEJM：生物标志物可预测癌症化疗反应
DNA的错配修复(MMR)主要负责纠正复制后的错误以及维持基因组的稳定，有时候MMR的异常会引发一系列癌变表型，近日来自约翰霍普金斯基墨尔癌症中心（Johns Hopkins Kimmel Cancer Center ）的研究人员发现，MMR基因的突变或可帮助准确预测病人对化疗药物—PD-1抑制
16种常见癌症可做预测性基因检测
研究人员正在进行肿瘤组织基因组提取。 随着癌症发病率逐年上升，癌症基因检测愈发流行。基于自身健康的考虑，一些高危人群开始主动进行癌症基因检测。目前，癌症基因检测还处于发展阶段，多数用于肿瘤的靶向治疗以及临床疾病的药物治疗，不过我国现在已有16种常见癌症变异基因被破译，可做预测性基因检测。 精
Sci Trans Med：血液检测可预测乳腺癌药物抵抗
科学家最近开发出一种具有高灵敏度的血液检测方法，可以确定乳腺癌何时对标准激素治疗法产生抵抗，他们还证明这种检测方法能够指导病人如何进行进一步治疗。 研究人员表示这种方法能够在乳腺癌细胞对芳香酶抑制剂产生抵抗的早期阶段给予病人警告，芳香酶抑制剂是治疗雌激素受体阳性乳腺癌的常用药物。他们发现这种新
检测 DNA 突变，可以告诉我们谁可能有发展早期癌症
爱因斯坦研究人员已经开发并验证了一种准确识别单细胞基因组中突变的方法。这种新方法可以帮助预测癌症是否将在看似健康的组织中发展，在今天的自然方法的在线版本中发表的论文中被描述。相应的作者是 Lola 和 Saul Kramer 分子遗传学主席 Jan Vijg 博士。 在科学家可以分析单个细胞的
单细胞基因组突变检测新突破
爱因斯坦研究人员已经开发并验证了一种准确识别单细胞基因组中突变的方法。这种新方法可以帮助预测癌症是否将在看似健康的组织中发展，在今天的自然方法的在线版本中发表的论文中被描述。相应的作者是Lola和Saul Kramer分子遗传学主席Jan Vijg博士。 在科学家可以分析单个细胞的基因组之前，
数码DNA测试可帮助预测癌症患者的存活率
一种新的以数码方式计数T细胞的DNA检测可对卵巢癌患者的存活预测有帮助。这些发现增添了证据，这些证据提示含有大量的一种被称为肿瘤浸润淋巴细胞(TIL)的T细胞与卵巢癌患者存活率的改善有关。Harlan Robins及其同事研发了一种基于DNA的测试，它能够以数码的方式对任何存在于某组织样本中