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钟声教授团队开发高通量蛋白互作检测技术

通过深入了解基因组产物形成的相互作用网络,人类基因组注释功能得以飞速发展。随着技术的进步,我们已经实现了DNA-DNA、蛋白质 -DNA、RNA-DNA和RNA-RNA相互作用的全基因组映射图谱。但完成人类蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)的全基因组映射图谱仍然是一项艰巨任务。 目前,大规模PPI映射方法可分为3类,即“并行化一对一”、“一对多”和“多对多”方法。“并行化一对一”方法是利用自动化和并行化来提高酵母双杂交(Y2H)分析的通量,包括高通量Y2H、MAPPIT 、QIS-seq以及将PPI对的基因序列进行融合测序的RLL-Y2H、Stitch-Seq、CrY2H-seq和BFG-Y2H等方法。“一对多”方法是从纯化或标记靶蛋白开始,在空间邻近亲和纯化、邻近生物素化(BioID)、GFP融合或蛋白微阵列中鉴定共纯化的蛋白。“多对多”方法旨在从单个实验中对所有PPI进行分析,用于解析配体-靶标对和抗体-抗原对。 上述......阅读全文

蛋白质相互作用

Interaction Trap/Trap Two-Hybrid System·         Yeast Two-Hybrid System (Finley Lab)This is one of the most comprehensive and detailed guide to yeast

蛋白质与水的相互作用

蛋白质与水之间的作用力主要是蛋白质中的肽键(偶极-偶极相互作用或氢键),或氨基酸的侧链(解离的、极性甚至非极性基团)同水分子之间发生了相互作用。影响蛋白质水溶性的应素很多:(1)pH>pI 时,蛋白质带负电荷,pH=pI 时,蛋白质不带电荷,pH 时,蛋白质带正电荷。溶液的pH 低于或高于蛋白质的p

蛋白质与水的相互作用

  水和蛋白质是构成一切生命的基础材料。对人体来说,我们需要有二十种氨基酸才能保证细胞的正常工作。其中,有八种氨基酸是人体无法自行合成,必须由食物中摄取,称作“必需氨基酸”,又称作完全蛋白。资料表明:这八种中如果缺少任何一种,其他则毫无用处。另外十二种是人体可以自行合成的,称作“非必需氨基酸”。人体

蛋白质间相互作用研究方法1

确定各种可能与目标蛋白相互作用的蛋白质,“撒大网” l        双杂交和其他双成分系统 第一阶段:诱饵-LexA融合蛋白的鉴定 诱饵-LexA融合蛋白的构建 1.将编码诱饵蛋白的靶DNA克隆到LexA融合载体的多聚接头处,以合成一种框架内的LexA融合基因。确定诱饵序列的羧基端存在翻

Far Western分析蛋白质相互作用实验

分析蛋白质混合物             实验方法原理 实验材料 待分析的样品 编码目的蛋白的

蛋白质间相互作用研究方法1

LY: 宋体; mso-ascii-font-family: 'Times New Roman'; mso-hansi-font-family: 'Times New Roman'">融合蛋白进行Far Western印迹来检测蛋白质-蛋白质相互作用  放射标记蛋白探

RNA-蛋白质的相互作用2

叶绿体mRNA3’末端的体外加工l      RNA加工反应1.在1.5ml微量离心管中加入下列反应液:缓冲液IVT(20×)                            0.5μl叶绿体蛋白提取物(20μg)                      Lμl缓冲液E           

研究蛋白质相互作用的新技术

  近期,来自多伦多大学Lunenfeld-Tanenbaum Research Institute (LTRI)和Donnelly中心的一组研究人员,开发出一种新技术,可以将细胞内的DNA条形码拼接在一起,以同时搜寻数百万个蛋白质配对,用以分析蛋白质相互作用。相关研究结果发表在4月22日的《Mol

蛋白质相互作用如何驱动细胞凋亡

  细胞敢死队  “健康的身体取决于严格按规定执行的细胞分裂和死亡,波鸿“Resolv” 卓越电子顺磁共振光谱研究组Stephanie Bleicken博士说。“当它们失控时,癌症和神经退行性疾病就会发生。”细胞凋亡是身体摆脱损害、老化或不需要的细胞的重要安全机制。  Bcl-2蛋白家族决定细胞何时

利用 BIAcore 分析相互作用的蛋白质

试剂、试剂盒 EDC氨基乙醇ExtracleanHEPES 缓冲的盐水缓冲液HClNHS小鼠抗-TSH 单克隆抗体兔抗小鼠-Fc 结构域TSHTSH 稀释液仪器、耗材 BIAcore 仪器CM-5 传感芯片实验步骤 第一阶段  捕获表面的制备和结合试验材料缓冲液和溶液将贮存溶液稀释到适当的浓度。ED