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测序结果能知道各个细菌种类的含量分别是多少吗

测序分为一代测序和二代测序(两者差别,一代测序准确性高,通量低,二代测序通量高)一般确定各个细菌种类的含量,专业上讲叫种群丰度一般观察这种丰度细菌是通过16S rDNA的高变区V区来确定物种一代测序是通过PCR来扩增出特定V区,进行克隆后,一代测序进而分析,但是克隆挑选的数目对丰度的准确评估有很大影响(越多越好)二代测序pcr后直接进行测序,来找特定丰度,二代测序的高通量有这更好的适用性。......阅读全文

测序结果的分析

测序都是从5'端进行的,正向和反向测序是指对DNA的两条互补链分别测序,通常两个方向测序结果经校读后完全一致才能认为得到可靠结果。生工测序结果一般都提供两个文档,一个是TEXT的序列文档,一个是用Chromas软件打开的ABI文档。 1.寻找引物 http://blast.ncbi.n

如何分析DNA测序结果

Interpreting DNA Sequencing Results Evaluating ChromatogramsMany problems with sequencing results are not recognized by viewing the text file alone. T

PCR产物测序结果分析

pcr产物测序的最大风险是有在凝胶上看起来的一个条带,实际上有多个分子。也就是说长度相似的分子有可能在电泳的时候只有一条带。如果只是进行pcr产物回收,没有进行凝胶分离的过程的话,东西可能更多了。问题就在于,如果出现双峰或者多峰,这个样品就白送了,什么也结果也没有。特别你现在用的还是简并引物,本身目

PCR后测序结果怎样分析

首先,看测序峰图,如果结果的彩图显示峰型是尖锐单一的,碱基所对应的编码是一致的,那么可以判断序列是可以使用的。如果出现双峰,信号中断等异常现象,那么需要重新制备或者克隆后再测序。其次,将PCR产物在NCBI上blast,看是否与你预期想要的片段符合,如果是匹配度一致,那么可以进行下一步,例如克隆,表

PCR后测序结果怎样分析

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