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QTL定位的作图方法分类及介绍

区间作图法(interval mapping,IM)Lander 和Botstein(1989) 等提出,建立在个体数量性状观测值与双侧标记基因型变量的线性模型的基础上,利用最大似然法对相邻标记构成的区间内任意一点可能存在的QTL 进行似然比检测,进而获得其效应的极大似然估计。其遗传假设是,数量性状遗传变异只受一对基因控制,表型变异受遗传效应(固定效应) 和剩余误差(随机效应) 控制,不存在基因型与环境的互作。区间作图法可以估算QTL 加性和显性效应值。与单标记分析法相比,区间作图法具有以下特点:能从支撑区间推断QTL 的可能位置;可利用标记连锁图在全染色体组系统地搜索QTL,如果一条染色体上只有一个QTL,则QTL 的位置和效应估计趋于渐进无偏; QTL 检测所需的个体数大大减少。但IM也存在不足: QTL 回归效应为固定效应;无法估算基因型与环境间的互作(Q×E),无法检测复杂的遗传效应(如上位效应等) ; 当相邻QTLs ......阅读全文

QTL定位的作图方法分类及介绍

区间作图法(interval mapping,IM)Lander 和Botstein(1989) 等提出,建立在个体数量性状观测值与双侧标记基因型变量的线性模型的基础上,利用最大似然法对相邻标记构成的区间内任意一点可能存在的QTL 进行似然比检测,进而获得其效应的极大似然估计。其遗传假设是,数量性状

QTL定位的作图方法介绍

QTL 定位就是采用类似单基因定位的方法将QTL 定位在遗传图谱上,确定QTL 与遗传标记间的距离(以重组率表示)。根据标记数目的不同,可分为单标记、双标记和多标记几种方法。根据统计分析方法的不同,可分为方差与均值分析法、回归及相关分析法、矩估计及最大似然法等。根据标记区间数可分为零区间作图、单区间

小麦容重器在小麦QTL定位分析中应用

     小麦的容重是一个常见的使用标准在质量评价中,是指在一定的单位体积中小麦所具有的重量。因为小麦含有的胚乳在的比例比较大因此对于胚乳高的其容重值比较大,这样表皮层的含量少处分率比较高。通过小麦容重器的应用在相关的试验中发现容重值与食品烘焙的品质有很大的相关关系,并且是正相关,这也间接的反应了

杏果实性状遗传和QTL定位方面研究取得新进展

  近日,辽宁果树所李杏团队在国际植物学前沿期刊《植物科学前沿》(Frontiers in Plant Science)上发表研究论文。该研究对杏果实大小、可溶性固形物和果肉硬度进行了QTL定位,对培育优质耐贮新品种提供了理论基础。  杏主要种植在我国西北、华北、东北地区的干旱丘陵山区地带,近年来其

RFLP技术在作物育种上的应用与展望(二)

四、RFLP在作物遗传育种上的应用   1、分子水平上选择目的性状  RFLP图本身对植物育种并没有直接的用处,只有当它与经典标记即原已定位的基因结合起来 才有用,当确定哪一个RFLP标记与目的性状表现协同分离,即目的基因与RFLP的连锁,使得 对期望基因重组型的选择容易进行,在分子水

科学家推导出生物形状基因定位新模型

  近日,北京林业大学计算生物学中心研究人员将生物形状几何分析方法与基因功能作图理论相结合,成功推导出一批影响生物形状变异的基因定位新模型。该成果的两篇论文日前发表于《生物信息学》和《遗传学》。   据专家介绍,生物各个器官的形状及内部结构和功能息息相关。比较生物的形状和解剖结构是生物学最基

水分分析方法的分类及介绍

水分分析方法—般可分为两大类,即物理分析这和化学分析法。本文介绍了几种经典的水分分析方法。 经典水分分析方法已逐渐被各种水分分析方法所代替,目前市场上主要存在的水分测定仪'>水分测定仪主要有卡尔·费休水分测定仪'>水分测定仪、库仑水分仪、微波水分仪、红外水分仪、露点水分仪,以及一些专

叶面积测量仪研究玉米穗三叶与QTL定位

高产是玉米育种永恒追求的目标,这也说明对于其产量的影响是有多重因素构成的。果穗产量性状是其直接表现。叶片是玉米光合作用的主要器官,叶面积是决定光 合产物的一个重要指标,对于产量形成具有重要的作用。通过叶面积测量仪研究表明,玉米穗三叶面积与玉米单株产量呈显著的正相关,其中穗位叶面积与产量关系最为密切。

什么是QTL?

QTL是quantitative trait locus的缩写,中文可以翻译成数量性状座位或者数量性状基因座,它指的是控制数量性状的基因在基因组中的位置。对QTL的定位必须使用遗传标记,人们通过寻找遗传标记和感兴趣的数量性状之间的联系,将一个或多个QTL定位到位于同一染色体的遗传标记旁,换句话说,标

分子标记在基因组作图和基因定位研究中的作用

  长期以来,各种生物的遗传图谱几乎都是根据诸如形态、生理和生化等常规标记来构建的,所建成的遗传图谱仅限少数种类的生物,而且图谱分辨率大多很低,图距大,饱和度低,因而应用价值有限。分子标记用于遗传图谱构建是遗传学领域的重大进展之一。随着新的标记技术的发展,生物遗传图谱名单上的新成员将不断增加,图谱上