Nature公布新兴测序技术绘制的人类组织RNA多样性
由纽约基因组中心和布罗德研究所的科学家完成了一项对人类组织中RNA多样性的研究，最近发表在Nature杂志上。当遗传密码转录成RNA时，一个基因通常会产生几种不同形式的RNA分子，或具有不同功能的转录本。虽然这一现象几十年来一直为人所知，但人类转录本的目录仍然不完整。“我们配备了最新的测序技术，能够读取超过1000个核苷酸片段，相比之下，标准方法只能读取不到100个，”该项目负责人之一、曾在布罗德研究所(Broad Institute)担任博士后的Beryl Cummings博士描述道:“重要的是，我们能够从许多组织中提取80多个样本，这导致了数以万计的新转录本的发现。”研究人员利用他们的数据来描述遗传和环境差异如何在转录组差异中表现出来。“个体之间的基因差异会影响基因的调控。我们能够比以前更精确地描述转录结构是如何受到影响的。这有助于理解导致疾病风险的变异的分子基础”。“我们相信我们的发现、数据和工具为转录组研究的新时代铺平了......阅读全文
Cell：RNA机器如何越过基因组障碍
曾几何时，科学家们认为，RNA聚合酶——通过将DNA转录成RNA开启蛋白质合成的分子，就像一个发条玩具那样工作：它置于我们DNA中的一个起始位点上，一直稳步急速运作，抽出一个RNA拷贝，直到它到达停靠位置。延伸阅读：单细胞RNA-seq实现细胞空间定位。 最近，科学家们意识到，他们没有给予RN
从总 RNA 中除去基因组 DNA 实验
从总 RNA 中除去基因组 DNA 实验 试剂、试剂盒 变性（甲醛)琼脂糖凝胶 琼脂糖 蒸馏
从总 RNA 中除去基因组 DNA 实验
试剂、试剂盒 变性（甲醛)琼脂糖凝胶琼脂糖蒸馏水甲醛蒸馏水乙醇 甲醛MOPS 缓冲液乙二胺四乙酸MOPS乙酸钠酚 氯仿（3:1) 溶液氯仿液体酚Tris-HCl电泳缓冲液仪器、耗材 离心机和转头离心管配胶板微波炉实验步骤 一、材料1. 缓冲液、溶液和试剂变性（甲醛)琼脂糖凝胶（配制过程见第 18步）
从总 RNA 中除去基因组 DNA 实验
为了进行 FDD 基因表达的分析，以及使用任何其他基于 RNA 的基因表达技术，在反转录合成单链 cDNA 和后续的 PCR 操作之前，必须除掉污染的基因组 DNA。本实验来源于 PCR 实验指南（第二版），作者：种康，瞿礼嘉。试剂、试剂盒变性（甲醛)琼脂糖凝胶琼脂糖蒸馏水甲醛蒸馏水乙醇甲醛MOPS
Nature发布大型全基因组RNA分析研究
由来自宾夕法尼亚州立大学的化学家和植物生物学家领导的一个研究小组开发出了一种分子技术，将有助于科学团体以从前不可能达到的规模，来分析在基因表达调控中起重要作用的分子。 科学家们开发出了一种方法，能够更精确预测在活细胞内核糖核酸分子(RNAs)的折叠情况，由此阐明植物以及其他的活体生物对环境
RNA测序技术如何绘制全基因组转录终止？
近日，南方科技大学生命科学学院翟继先团队利用纳米孔单分子RNA测序技术绘制了拟南芥全基因组水平转录终止图谱。该方法能同时捕获包括已转录过polyA位点的 readthrough转录本、完成3’末端切割的5’或3’切割产物、以及已完成或正在进行多腺苷酸化（polyadenylation）的转录本在
植物基因组DNA及总RNA提取技术-2
（二）植物总RNA提取 （1）65°C水浴中预热15 mL CTAB提取液。 （2）液氮中研磨2～3 g新鲜或-70°C冷冻的材料。 （3）转移样品至有CTAB提取液的离心管中，立即激烈涡旋30s，短时放回 65°C水浴中（4～5 min）。 （4）加入等体积的氯仿/异戊醇并涡旋混合，10000 r
植物基因组DNA及总RNA提取技术-1
幼嫩组织的细胞处于旺盛的分裂阶段，核较大而胞质较少，核酸浓度高，且内含物少、次生代谢产物少，蛋白质及多糖类物质相对较少，在SDS或 CTAB物质存在时，经机械研磨，使细胞破裂并释放出内含物，提取的DNA、RNA的产量高，纯度好。 提取DNA所用的提取液、吸头、离心管等需要高压灭菌以灭活DNase。R
基因组分析揭示等位基因特异RNA编辑现象
核糖核酸（RNA）编辑是RNA水平一种常见的修饰，是增加基因转录和功能多样性的重要形式。17日，来自中科院昆明动物研究所的消息，由张亚平院士领导的、多个研究机构加盟的团队，在等位基因特异的RNA编辑研究上取得了重要进展。 中科院昆明动物研究所周中银博士介绍，对二倍体生物来说，虽然两个等位基
中心体“RNA基因组”的重大发现
基因组是有编码蛋白质的DNA组成，但是细胞核的一个关键部分还有一种特有的基因组，它由RNA构成，而RNA通常是从基因到蛋白质的中介物——这意味着这种奇怪的实体可能是RNA世界的一个分子遗迹，它先于DNA的进化并使人们更加相信生命最初依赖于RNA的假说。 RNA存在于中心体（centrosom