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原子键电负性均衡方法融合进分子力场(ABEEM/MM)应用于蛋白质BPTI水溶液的分子动力学模拟

摘要 利用ABEEM/MM 浮动电荷模型对蛋白质BPTI 分子的水溶液进行了分子动力学模拟, 验证了模拟参数(包括ABEEM参数和力场参数)的正确性以及可转移性. 结果表明, 对蛋白质BPTI水溶液模拟所得的蛋白质中各类非氢原子的位置与实验晶体结构相比的均方根位移偏差较小, 即模拟所得的BPTI 结构与实验晶体结构具有较好的一致性; 计算得到的径向分布函数表明, ABEEM/MM 模型很好地体现了蛋白质和周围水分子的静电极化, 并且溶质与溶剂之间强烈的氢键作用使溶液中BPTI 分子的体积变大.点击这里进入下载页面:进入下载页面......阅读全文

拉曼问题汇总:拉曼光谱百问解答总结!

拉曼光谱(Raman Spectra),是一种散射光谱。拉曼光谱分析法是基于印度科学家C.V.拉曼(Raman)所发现的拉曼散射效应,对与入射光频率不同的散射光谱进行分析以得到分子振动、转动方面信息,并应用于分子结构研究的一种分析方法。今天分享一些问答集锦,希望对你有帮助。一、测试了一些样品,得到的

苯环序列赋予其水凝胶在海水中强静电粘附作用

  开发出能用于海水环境中的粘结剂是一个巨大的挑战。模仿海洋固着生物是一种有效的手段。例如,受贻贝启发的邻苯二酚基胶粘剂在近十年来得到了广泛的研究。但是,邻苯二酚官能团稳定性差,在非酸性环境中很容易被氧化而失去粘合力,因此这类材料在实际环境中的粘结性能仍然不尽人意。在水中,许多固体表面(例如岩石,玻

邻位阳离子赋予其水凝胶在海水中强静电粘附作用

  开发出能用于海水环境中的粘结剂是一个巨大的挑战。模仿海洋固着生物是一种有效的手段。例如,受贻贝启发的邻苯二酚基胶粘剂在近十年来得到了广泛的研究。但是,邻苯二酚官能团稳定性差,在非酸性环境中很容易被氧化而失去粘合力,因此这类材料在实际环境中的粘结性能仍然不尽人意。在水中,许多固体表面(例如岩石,玻

关于拉曼光谱的83个问答总结(上)

  一、测试了一些样品,得到的是Ramanshift,但是文献是wavenumber,不知道它们之间的转换公式是怎么样的?激光波长632.8nm。  1. 两者是一回事。ramanshift即为拉曼位移或拉曼频移,频率的增加或减小常用波数差表示,拉曼光谱仪得到的谱图横坐标就是波数

《科学》文章复活蛋白

来自北卡罗莱纳州大学化学系,俄勒冈州大学生态与进化生物学中心的研究人员“复活”了4亿5千万年前的一个蛋白:脊椎动物糖皮质激素和盐皮质激素受体(glucocorticoid (GR) and mineralocorticoid (MR) receptors),寻找引起这类受体进化的变化,这一研究成果公

工信部印发产业关键共性技术发展指南 包含色谱和传感器

  分析测试百科网讯 近日,工业和信息化部组织修订了《产业关键共性技术发展指南(2015年)》(以下简称指南),并印发。指南在仪器仪表类中对色谱类分析仪器的关键制造技术、工业控制巨磁电阻传感器微型化和集成化技术、硅基压力传感器无引线封装制造技术、DCS/PLC冗余设计关键技术等做出了技术内容指南,如

正—反物质不对称性有了新证据

  近日,欧洲核子研究中心(CERN)宣布,大型强子对撞机(LHC)上的LHCb实验发现了D介子的正—反物质不对称性,并表示这项发现“绝对会被写进粒子物理的教科书”。这一发现被CERN研究和计算主任Eckhard Elsen称为“粒子物理学历史上的一个里程碑”。  科学家到底发现了什么?这次发现为什

麦克斯韦(Maxwell)的遗产:一位微波工程师的心得体会-4

这个力学系统同样可以模拟静电,麦克斯韦对今天被我们称之为极化的电荷进行了描述:在被感应的电介质[静电]中,我们可以想象每个分子中的电被移动了,一端显示出正的极性,一端显示出负的极性,但电是完全与分子整体连接在一起的,因此没有从一个分子穿越到另一个分子内。麦克斯韦随后指出这种电的位移并不是电流,因为它

ASTM D150-11 实心电绝缘材料的交流损耗特性和电容率

  ASTM D150-11实心电绝缘材料的交流损耗特性和电容率(介电常数)的标准试验方法   本标准是以固定代号D150发布的。其后的数字表示原文本正式通过的年号;在有修订的情况下,为上一次的修订年号;圆括号中数字为上一次重新确认的年号。上标符号(ε)表示对上次修改或重新确定的版本有编辑上的修

拉曼光谱、红外光谱、XPS的工作原理和应用(一)

      拉曼光谱的原理及应用  拉曼光谱由于近几年来以下几项技术的集中发展而有了更广泛的应用。这些技术是:  CCD检测系统在近红外区域的高灵敏性,体积小而功率大的二极管激光器,与激发激光及信号过滤整合的光纤探头。这些产品连同高口径短焦距的分光光度计,提供了低荧光本

Nature系列10篇,清华、复旦、武大、西南交大等成果速递

  1. Nature Photonics:光学镊子声子激光器  声子激光器是普遍存在的光学激光器的类似物,并且其已经在各种环境中实现。然而,对于介观悬浮光机械系统还没有相关报道,并且这些系统正在成为量子力学和重力的基本测试的重要平台,以及发展为机械运动耦合到电子自旋和电荷的传感模式。受到Arthu

拉曼光谱的原理及应用

  拉曼光谱由于近几年来以下几项技术的集中发展而有了更广泛的应用。这些技术是:  CCD检测系统在近红外区域的高灵敏性,体积小而功率大的二极管激光器,与激发激光及信号过滤整合的光纤探头。这些产品连同高口径短焦距的分光光度计,提供了低荧光本底而高质量的拉曼光谱以及体积小、容易使用的拉曼光谱仪。1. 含

PODE1或PODE2+水+萃取剂三元体系的液液相平衡

萃取剂(糠醛、异佛尔酮、正辛醇)在常压、308.15 K下对聚甲氧基二甲醚(PODE)水溶液的萃取效果,测量了三元体系水+PODE1+萃取剂(糠醛、异佛尔酮、正辛醇)和水+PODE2+萃取剂(糠醛、异佛尔酮、正辛醇)的液液相平衡数据.对PODE的分配系数以及PODE和水的分离因子进行了估算,PODE

NIR 技术在饲料原料养分预测中的应用

NIR 技术在原料蛋白质含量预测中的应用传统凯氏定氮法等测定蛋白质含量的方法不能很好地实现快速高效的测定原料粗蛋白含量,且耗时耗力,而 NIR 技术的应用,使得原料蛋白质含量测定实现了高效快速,NIR 技术在苜蓿大豆等饲料原料粗蛋白含量的检测方面具有广泛应用。冯伟娟等(2018)比较了 NIR 技术

毛细管电泳的原理/分类/特点/仪器/应用

  毛细管电泳(capillary electrophoresis,CE)又称高效毛细管电泳(high performance capillary electrophoresis,HPCE),是一类以毛细管为分离通道、以高压直流电场为驱动力的新型液相分离技术。毛细管电泳实际上包含电泳、色谱及其交叉内

物理学能否抛开大型设备

  可能没有人比物理学家Gerald Gabrielse对那个电子了解得更多了。他曾在一个陷阱里捕捉了这个电子,然后连续10个月测量其内部电磁场大小。当它消失后,Gabrielse找了两天才不得不接受它已经不见了。“你会在一段时间后喜欢上你的粒子。”他说。Gerald Gabrielse 和博士后W

大豆粗蛋白、粗脂肪含量近红外检测模型建立及可靠性..

大豆籽粒约含粗蛋白40% ,粗脂肪20% ,是重要的植物蛋白和食用油来源。提高大豆籽粒中蛋白和脂肪含量是品质改良的重要目标之一,准确测定其粗蛋白、粗脂肪含量是前提。目前,国家颁布的粗蛋白 标准测定方法是基于凯氏定氮法的化学分析(GB290521982) ,粗脂肪标准方法是基于索氏提取法的化学分析(G

国家标准委发布《高效空气过滤器》新标准(二)

6技术要求 6.1 外观6.1.1过滤器表面不应有泥、油、黏性物等污染物和损伤,不应出现框架凹凸、扭曲或破裂;表面涂料层不应出现不均匀及剥落等损伤。 6.1.2滤料、分隔物、防护网应无变形,密封垫应无松脱。 6.1.3密封胶应齐整无裂纹,沿滤料和分隔板浸润高度应不大于5

一文读懂电磁学发展史(图文版)(二)

有一位物理学家,从理论上总结了人类对电磁现象的认识,创立了电磁学理论,预见了电磁波的存在,在科学上取得了伟大的成就。他的成就可与牛顿和爱因斯坦相提并论,可是很少有人知道他的名字。他的名字叫詹姆斯·克拉克·麦克斯韦。1831年11月13日,麦克斯韦出生在苏格兰古爱丁堡。恰好是这一年,法拉第发现了感生电

薰衣草油分析与鉴定(从花到精油)

Carly Burleson,Joseph Bonvallet关键词:薰衣草油,精油,掺假,化学计量学,MZ5,ATR,MWIR摘要精油在许多文化中用于医学和健康目的已有数千年的历史,其用途包括从芳香疗法,家庭清洁到整体医学。 精油通过从植物材料中提取所需的组分来生产,这是一种昂贵且耗费劳力的过

拉曼光谱答疑总结(二)

  十一、1 红外分析气体需要多高的分辨率?  2 拉曼光谱仪是否可分析纯金属?  3 红外与拉曼联用,BRUKER和NICOLET哪个好些?  1,分析气体时理论上最高只需0.5cm-1。实际应用上绝大部分情况下4cm-1已足够。对于气体,还是希望分辨率高一些好,一般都用1cm-1一下,这样对气体

广角激光光散射仪及其应用

    光散射仪是研究高分子和胶体的有力工具,包括动态和静态两个部分。静态光散射中,得到高聚物的重均分子量、回转半径等;动态光散射中,求得扩散系数和流体力学半径等;将静态与动态有机的结合,得到高分子的聚集与分散、吸附与解析以及高分子链的伸展与蜷缩等形态特征。  &nbs

广角激光光散射仪特点及其应用

    光散射仪是研究高分子和胶体的有力工具,包括动态和静态两个部分。静态光散射中,得到高聚物的重均分子量、回转半径等;动态光散射中,求得扩散系数和流体力学半径等;将静态与动态有机的结合,得到高分子的聚集与分散、吸附与解析以及高分子链的伸展与蜷缩等形态特征。1、广角激光光散射仪B

2016科学仪器重大专项指南发布

  分析测试百科网讯 今天,科技部发布了《“重大科学仪器设备开发”重点专项2016年度申报指南》,详情如下。  附1:申报相关要求和规定  附2:“重大科学仪器设备开发”重点专项2016年度申报指南  科学仪器设备是科学研究和技术创新的基石,是经济社会发展和国防安全的重要保障。为

等电聚焦和二维凝胶电泳实验

对于复杂混合物,如全细胞裂解物或富集的亚细胞组分,通过两步正交的分离 (orthogonalseperation),二维凝胶 (2D 胶)电泳可以很好地分离成几百个至上千个单个蛋白质。第一次分离基于电荷,即使用变性等电聚焦电泳; 第二次分离基于表观分子质量,即使用变性十二烷基磺酸钠-聚丙烯酰胺凝胶电

蛋白质组数据的多元分析实验

仪器、耗材 扫描仪图像分析软件Excel 程序多元数据分析的软件实验步骤 用 Progenesis、Excel 和 The  Unscrambler 对 2D 凝胶进行多元分析。3.1 确定研究方案后建立蛋白的 2D 凝胶在本章节中不再阐述,但要确定染色方法以便进行凝胶的定量分析

蛋白质组数据的多元分析实验

仪器、耗材:扫描仪                                        

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等电聚焦和二维凝胶电泳实验

等电聚焦和二维凝胶电泳实验             试剂、试剂盒 样品缓冲液

首次发现只在雄性中存在的代谢物

来自美国伊利诺斯州大学的研究人员在雄性 中发现了一种化合物,该物质在雌性中不存在。该研究首次发现一个完整的酶系统只在一个物种的一个性别中被激活。这项研究的结果发表在8月22日的PLoS ONE杂志上。 研究人员解释说,尽管激素水平的不同被认为是动物和人类发育中性别间的主要差异原因,但是新的研究发