科学家揭示基因转录终止机制

DNA是遗传信息的载体,遗传信息通过转录从DNA传递到RNA,随后通过翻译解码成蛋白质。基因是DNA遗传信息的编码单元,基因的正确解码需要执行基因转录的RNA聚合酶严谨识别基因的的起始序列(启动子)和终止序列(终止子)。转录终止过程发生异常会干扰下游基因的表达,影响DNA复制,破坏基因组稳定性等。 1月12日,中国科学院分子植物科学卓越创新中心合成生物学重点实验室研究员张余团队和美国威斯康辛大学麦迪逊分校Robert Landick团队、浙江大学冯钰团队合作,在《自然》杂志发表论文,揭示了细菌RNA聚合酶识别转录终止序列,终止转录的工作机制。 “RNA聚合酶在执行基因转录时类似高速行驶的汽车,以大约每秒50个核苷酸的速度合成RNA,当RNA聚合酶转录至终止序列时,需要从高速延伸的状态刹车、停止转录并释放RNA。”张余介绍说,“细菌的固有转录终止序列是一段30至50个核苷酸碱基的序列,由能够形成发卡结构的序列和连续多聚尿苷......阅读全文

关于DNA解旋酶转录的介绍

  1、 不需要: DNA复制需要解旋酶,可是与DNA复制相类似的转录过程并不需要解旋酶,基因的转录是由RNA聚合酶催化进行的。基因的上游具有结合RNA聚合酶的区域,叫做启动子。启动子是一段具有特定序列的DNA,具有和RNA聚合酶特异性结合的位点,决定了基因转录的起始位点。RNA聚合酶与启动子结合后

《科学》:DNA绕个圈转录转向

  在玩具赛车轨道游戏里,出老千的玩家会扳动开关,让他们对手的车辆进入一个循环轨道,从而赢取比赛。细胞也会这一招――改变“轨道”布局,影响细胞功能,来自欧洲分子生物学实验室(EMBL)和牛津大学的科学家们发现通过形成或撤销基因环结构(gene loops),细胞能调控转录机器,控制它是沿着遗传物

研究发现DNA损伤修复与DNA转录的协同作用

  最近,来自挪威科学技术大学的Barbara van Loon博士等人在遗传信息修复方面有了新发现,该发现发表在最近的《Nature Communications》杂志上。  Van Loon的研究小组发现,阅读DNA的分子元件和纠正DNA错误的分子元件可以协同工作。(图片来源:NTNU)  Va

基因转录后调控方式

真核生物的RNA被翻译之前需要通过核孔输出,因此核输出对基因表达有着显著影响。所有进出细胞核的mRNA的运输都是通过核孔进行的,受到各种输入蛋白和输出蛋白的控制。携带遗传密码的mRNA需要存活足够长的时间才能被翻译,因为mRNA在翻译之前必须经过很长距离的运输。在典型的细胞中,RNA分子仅在特异性保

基因转录调控的途径

可分为三种主要途径:1)遗传调控(转录因子与靶标基因的直接相互作用);2)调控转录因子与转录机制相互作用,3)表观遗传调控(影响转录的DNA结构的非序列变化)。

细菌DNA转录偶联修复的结构基础

 活跃的转录基因中的DNA损伤修复比基因组中不活跃的区域更迅速。在细菌中,这个过程被转录修复偶联因子(transcription repair coupling factor , TRCF)介导。TRCF破坏DNA损伤位点的处的RNA聚合酶,并重新启动DNA切除修复机制(DNA excisi

北京基因组所转录因子TALE和DNA相互作用研究获进展

  近日,中国科学院北京基因组研究所基因组科学与信息重点实验室雷红星研究组,在其开展的转录因子TALE(transcription activator-like effector)和DNA相互作用研究方面取得阶段性进展,该研究对TALE蛋白的构象可塑性以及特异性识别DNA的机制进行了深入的计

基因转录因子的相关介绍

  转录因子(transcription factor)是起调控作用的反式作用因子。转录因子是转录起始过程中RNA聚合酶所需的辅助因子。真核生物基因在无转录因子时处于不表达状态,RNA聚合酶自身无法启动基因转录,只有当转录因子(蛋白质)结合在其识别的DNA序列上后,基因才开始表达。转录因子的结合位点

关于基因转录的基本介绍

  基因转录是在细胞核和细胞质内进行的。它是指以DNA的一条链为模板,按照碱基互补配对原则,在RNA聚合酶作用下合成RNA的过程。基因转录有正调控和负调控之分。  如细菌基因的负调控机制是当一种阻遏蛋白(repressor protein)结合在受调控的基因上时,基因不表达;而从靶基因上去除阻遏蛋白

基因表达的转录机制介绍

  转录过程由RNA聚合酶(RNAP)进行,以DNA为模板,产物为RNA。RNA聚合酶沿着一段DNA移动,留下新合成的RNA链。  基因组DNA由两条反向平行和反向互补链组成,每条链具有5'和3'末端。这两条链分别称为“模板链”(产生RNA转录物的模板)和“编码链”(含有转录本序列的

Nature:DNA修复新模式解答转录争议

  紫外线和其他环境因素不多对我们的DNA造成破坏,可以说我们的健康在很大程度上依赖于细胞发现和修复DNA损伤的能力。纽约大学医学院的一项新研究展示,RNA聚合酶负责在基因组中搜寻DNA损伤,并招募盟友对其进行修复。这一机制能够有效减少突变,帮助人体控制癌症和其他疾病。这项研究由Evgeny N

用CRISPR实现基因转录活体成像

  最近,日本的一个研究小组开发出一种实时成像方法,用于内源基因转录活性和核定位的同步测量。研究人员用该方法来检测亚基因组范围的流动性变化,这取决于小鼠胚胎干细胞中多能性相关基因的活性。 Hiroshi Ochiai博士和他的同事Takeshi Sugawara博士、Takashi Yamamoto

RNA干扰(转录后基因沉默)实验

RNA干扰(RNA interference, RNAi)是指在进化过程中高度保守的、由双链RNA(double-stranded RNA,dsRNA)诱发的、同源mRNA高效特异性降解的现象。目前主要用于(1)特异性剔除或关闭特定基因的表达 (2)探索基因功能和传染性疾病及恶性肿瘤的治疗 (3)使

使用转录定位法进行基因定位

许多 RNA病毒的整个基因组往往作为一个单位转录。随着转录的进行,由基因组上各个基因所编码的蛋白质也依序在寄主细胞中出现。当寄主细胞被紫外线照射使本身的蛋白质合成受到抑制时,病毒蛋白的出现更为明显。紫外线照射也起着抑制病毒基因组的转录的作用。紫外线在 RNA分子的某一部位造成损伤后,损伤的部位和它后

基因转录图的结构或功能

转录图基因转录图即是把细胞内染色体或DNA上所有基因定位在染色体或DNA基因组的不同位置上,反映在 正常或受控条件下能够表达的cDNA片段数目、种类、结构与功能的信息,是用来表示DNA上哪些核苷酸序列可以编码蛋白质。生物性状是由结构或功能蛋白决定的,功能蛋白是由信使RNA(mRNA)编码的,mRNA

基因表达转录调控的主要途径

基因表达转录调控可分为三种主要途径:1)遗传调控(转录因子与靶标基因的直接相互作用);2)调控转录因子与转录机制相互作用,3)表观遗传调控(影响转录的DNA结构的非序列变化)。

基因表达的转录调控的介绍

  可分为三种主要途径:  1)遗传调控(转录因子与靶标基因的直接相互作用);  2)调控转录因子与转录机制相互作用;  3)表观遗传调控(影响转录的DNA结构的非序列变化)。  通过转录因子直接调控靶标DNA表达是最简单和最直接的转录调控改变转录水平的方法。基因的编码区周围通常都具有几个蛋白质结合

RNA干扰(转录后基因沉默)实验

RNA干扰             实验方法原理 1. 病毒基因、人工转入基因、转座子等外源性基因随机整合到宿主细胞基因组内,并利用宿主细胞进行转录时,常产生一些dsR

DNA转录“控制器”的关键结构被破译

  中介体是一种复杂的分子机器,在DNA(脱氧核糖核酸)的转录过程中扮演重要角色,被称为“真核转录调控中的中央控制器”。据美国物理学家组织网7月3日报道,美国印第安纳大学研究人员破译了中介体最关键的部分——其头部的蛋白组成结构,为研究中介体增加了重要的砝码,使人们能更深入理解细胞中基因

激活的热稳定-DNA-聚合酶进行反转录和-DNA-扩增实验

试剂、试剂盒 RNA寡核苷酸引物脱氧核苷三磷酸RT RNA PCR 酶AccuRT 缓冲液UNG琼脂糖溴化乙锭二甲基亚砜乙酸镁去除 RNA 酶的水SYBRGreen I Dye仪器、耗材 琼脂糖凝胶的电泳设备实验步骤 一、材料1. 缓冲液、溶液和试剂琼脂糖二甲基亚砜(见注释 1)(DMSO)溴化乙锭

激活的热稳定-DNA-聚合酶进行反转录和-DNA-扩增实验

本实验介绍激活的热稳定 DNA 聚合酶进行反转录和 DNA 扩增。本实验来源于 PCR 实验指南(第二版),作者:种康,瞿礼嘉。试剂、试剂盒RNA寡核苷酸引物脱氧核苷三磷酸RT RNA PCR 酶AccuRT 缓冲液UNG琼脂糖溴化乙锭二甲基亚砜乙酸镁去除 RNA 酶的水SYBRGreen I Dy

激活的热稳定-DNA-聚合酶进行反转录和-DNA-扩增实验

            试剂、试剂盒 RNA寡核苷酸引物 脱氧核苷三磷酸 RT RNA PCR 酶 AccuRT 缓冲液 UNG 琼脂糖 溴化乙锭

基因检测DNA分析

DNA分析主要用于识别单个基因异常引发的遗传性疾病,如亨廷顿病等。DNA分析的细胞来自血液或胎儿细胞。

Nature:新研究发现确保DNA正确转录方向的机制

  麻省理工学院的生物学家发现了人体细胞确保其DNA向正确方向进行阅读、阻止“垃圾DNA”拷贝的机制。   人类基因组中大约有15%是蛋白质编码基因,但是近年来科学家发现有相当多的垃圾DNA,或者说基因间DNA可转录为RNA。科学家们一直在试图了解这些RNA的作用。在2008 年,MIT的科学

中国科大基因转录调控研究取得进展

  近日,中国科学技术大学生命科学学院教授单革实验室研究发现,秀丽线虫中两个高度保守的转录因子UNC-30和UNC-55,共调控包括cAMP通路、微小RNA(microRNA)和长链非编码RNA(lncRNA)等在内的数以千计的靶基因的表达,从而调控D型运动神经元的发育和可塑性。研究论文近日发表在《

科学家揭示基因转录终止机制

DNA是遗传信息的载体,遗传信息通过转录从DNA传递到RNA,随后通过翻译解码成蛋白质。基因是DNA遗传信息的编码单元,基因的正确解码需要执行基因转录的RNA聚合酶严谨识别基因的的起始序列(启动子)和终止序列(终止子)。转录终止过程发生异常会干扰下游基因的表达,影响DNA复制,破坏基因组稳定性等。

PNAS惊人发现:基因转录成双对

  DNA转录是指根据DNA模板生成信使RNA用于蛋白质合成的过程。现在Whitehead研究所的科学家发现,编码蛋白的DNA在开始转录时会同时启动一个逆向转录程序,生成相应的长非编码RNA(lncRNA)。而且,在干细胞分化为其他类型细胞的过程中,成对mRNA 和lncRNA的转录是相协调的。这一

基因表达的转录后调控的介绍

  真核生物的RNA被翻译之前需要通过核孔输出,因此核输出对基因表达有着显著影响。所有进出细胞核的mRNA的运输都是通过核孔进行的,受到各种输入蛋白和输出蛋白的控制。  携带遗传密码的mRNA需要存活足够长的时间才能被翻译,因为mRNA在翻译之前必须经过很长距离的运输。在典型的细胞中,RNA分子仅在

T细胞基因的转录激活及其表达

  TCR/CD3复合物与配体结合后,经多种信号转导途径传递信号,最终导致T细胞活化和增殖。信号转导中所涉及的基因根据其活化时间可以分为早早期、早期、晚期基因三种类型(表8-5)。早早期基因的转录不需蛋白的合成,而早期及晚期基因的转录则需蛋白的合成。早早期及早期基因转录在有丝分裂期之前,而晚期基因转

真核基因转录水平的调控2

(3)增强子的位置可在基因5′上游、基因内或其3′下游的序列中,而其作用与所在基因旁侧部位的方向似无关系,因为无论正向还是反向,它都具有增强效应;(4)增强子所含核苷酸序列大多为重复序列,其内部含有的核心序列,对于它进入到另一宿主之后重新产生增强子效应至关重要;(5)增强子一般都具有组织和细胞特异性