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科学家利用生物分子模拟预测代谢酶新功能

近日,中国科学院大连化学物理研究所研究员李国辉团队与中国科学院分子细胞科学卓越创新中心研究员杨巍维团队、广州大学教授王雄军、复旦大学附属中山医院教授李全林等合作,揭示了代谢酶果糖1,6-二磷酸酶1(FBP1)能够行使蛋白磷酸酶的功能,并证明了FBP1介导的IκBα去磷酸化在结直肠癌发生中起到关键作用。相关成果发表在《细胞研究》上。大连化物所供图 有研究表明,磷酸化可溶性代谢物的代谢酶,也可以作为蛋白质激酶磷酸化各种蛋白质底物,进而调节细胞周期、细胞凋亡和许多其他的细胞过程。 合作团队针对这一研究现象,拟先通过理论计算挖掘可作为蛋白质去磷酸化的代谢物磷酸酶。李国辉团队通过分子对接和分子动力学(MD)模拟对57种代谢物磷酸酶进行了高通量筛选,发现糖异生途径中的催化果糖1,6-二磷酸(F-1,6-BP)水解为果糖6-磷酸(F-6-P)的关键代谢酶FBP1,可作为蛋白质磷酸酶。鉴于此,实验合作团队进一步通过磷酸化蛋白质组学分析,......阅读全文

磷酸酶在医学和分子生物学等领域的应用

  AP 在医学和分子生物学等领域有广泛的用途。在临床医学上, 测定血清中AP 的活力已成为诊断和监测多种疾病重要手段。AP 主要用于阻塞性黄疸、原发性肝癌、继发性肝癌、胆汁淤积性肝炎等的检查, 患这些疾病时, 肝细胞过度制造AP , 经淋巴道和肝窦进入血液, 同时由于肝内胆道胆汁排泄障碍, 反流入

无机焦磷酸酶的分子反应介绍

无机焦磷酸酶(英语:Inorganic Pyrophosphatase,简称为焦磷酸酶)是一种催化一分子焦磷酸盐转化为两分子磷酸盐离子的酶。这是一个高放能的反应,因此此反应可偶联到一些热力学上不利的转化,以便驱动这些转化进行到完全。

无机焦磷酸酶参与哪些生物学过程

磷酸酶与激酶或磷酸化酶的磷酸化作用正相反。磷酸化可以使一个酶被激活或失活(如,激酶信号通路[7] ),也可以使一个蛋白-蛋白间相互作用发生(如SH2结构域);因此,磷酸酶是许多信号转导通路控制磷酸化所必需的。值得一提的是,磷酸化或去磷酸化并不一定对应着酶的激活或抑制,而且一些酶有多个磷酸化位点参与激

生物大分子是什么?脂肪是不是生物大分子?

生物大分子是指生物体细胞内存在的蛋白质、核酸、多糖等大分子。每个生物大分子内有几千到几十万个原子,分子量从几万到几百万以上。生物大分子的结构很复杂,但其基本的结构单元并不复杂。蛋白质分子是由氨基酸分子以一定的顺序排列成的长链。氨基酸分子是大部分生命物质的组成材料,不同的氨基酸分子有好几十种。生物体内

生物大分子是什么?脂肪是生物大分子吗?

  生物大分子是指生物体细胞内存在的蛋白质、核酸、多糖等大分子。每个生物大分子内有几千到几十万个原子,分子量从几万到几百万以上。生物大分子的结构很复杂,但其基本的结构单元并不复杂。  脂肪不是生物大分子。  脂类是油、脂肪、类脂的总称。脂肪由C、H、O三种元素组成。 脂肪是由甘油和脂肪酸组成的三酰甘

生物细胞分子的功能

  DNA 是负责遗传的主要分子,由 A、C、T、G 四种不同的单元依任意的顺序排列,例如一个有 10 个单元的 DNA 分子,会有 4 的 10 次方种不同的排列顺序,各种生物的遗传虽然均由 DNA 分子负责,由于排列顺序的差异,以致造成相互间极大的不同;RNA 是负责传递遗传讯息的分子,它将 D

生物大分子概况

生物大分子是生物体的重要组成成份,不但有生物功能,而且分子量较大,其结构也比较复杂。在生物大分子中除主要的蛋白质与核酸外,另外还有糖、脂类和它们相互结合的产物。如糖蛋白、脂蛋白、核蛋白等。它们的分子量往往比一般的无机盐类大百倍或千倍以上。蛋白质的分子量在一万至数万左右,核酸的分子量有的竟达上百万。这

生物分子的提取概述

       生物分子分生物小分子和生物大分子。生物小分子的结构由较强的共价键决定。生物大分子中除较强的共价键外,还含有较弱的共价键和次级键,需温和的条件才能保证生物大分子的活性不被破坏。这两类生物分子的提取液成分和操作条件差别很大。        生物分子的提取在离心机分离纯化的前期。将样品研磨,

生物分子的提取概述

生物分子分生物小分子和生物大分子。生物小分子的结构由较强的共价键决定。生物大分子中除较强的共价键外,还含有较弱的共价键和次级键,需温和的条件才能保证生物大分子的活性不被破坏。这两类生物分子的提取液成分和操作条件差别很大。生物分子的提取在离心机分离纯化的前期。将样品研磨,把被破碎的细胞置于一定的提取液

生物大分子概况

生物大分子是生物体的重要组成成份,不但有生物功能,而且分子量较大,其结构也比较复杂。在生物大分子中除主要的蛋白质与核酸外,另外还有糖、脂类和它们相互结合的产物。如糖蛋白、脂蛋白、核蛋白等。它们的分子量往往比一般的无机盐类大百倍或千倍以上。蛋白质的分子量在一万至数万左右,核酸的分子量有的竟达上百万。这

分子生物学概念的发展与检验诊断—分子生物学到生物...

分子生物学概念的发展与检验诊断—分子生物学到生物...  经过了免疫学的热潮,20世纪中叶开始兴起了又一门新的学科“分子生物学”。人们怀着满腔热忱,期待这一学科能够对那些机理不清的疾病予以新的认识。众多科学家经过了半个世纪的努力,终于用分子生物学方法整理出一批单基因病等和基因相关的疾病。随着基因基础

生物大分子的概念

生物大分子是指生物体细胞内存在的蛋白质、核酸、多糖等大分子。每个生物大分子内有几千到几十万个原子,分子量从几万到几百万以上。生物大分子的结构很复杂,但其基本的结构单元并不复杂。蛋白质分子是由氨基酸分子以一定的顺序排列成的长链。氨基酸分子是大部分生命物质的组成材料,不同的氨基酸分子有好几十种。生物体内

什么是生物分子自调节?

中文名称自调节英文名称autoregulation定  义生物分子调节其自身的活性或表达的现象。如某一个转录因子的基因受该基因产物的调节。通过这种作用,一个刺激在小范围内产生的信号的影响可以维持很久,并产生很大的生理作用。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),信号转导(二级学科)

生物分子自调节的特点

中文名称自调节英文名称autoregulation定  义生物分子调节其自身的活性或表达的现象。如某一个转录因子的基因受该基因产物的调节。通过这种作用,一个刺激在小范围内产生的信号的影响可以维持很久,并产生很大的生理作用。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),信号转导(二级学科)

生物分子的溶剂提取法

一、生物分子的溶剂提取法原理:利用溶剂的溶解作用把所需物质从细胞中转移出来。二、影响生物分子的溶剂提取效率的因素:  1、溶剂的性质:根据相似相溶原理。  2、离子强度:离子强度是影响物质溶解度的主要因素,但离子强度对不同物质溶解度的影响不同,如高离子强度下DNA-核蛋白溶解度增加,低离子强度下RN

什么是生物大分子?

生物大分子是指生物体细胞内存在的蛋白质、核酸、多糖等大分子。每个生物大分子内有几千到几十万个原子,分子量从几万到几百万以上。生物大分子的结构很复杂,但其基本的结构单元并不复杂。蛋白质分子是由氨基酸分子以一定的顺序排列成的长链。氨基酸分子是大部分生命物质的组成材料,不同的氨基酸分子有好几十种。生物体内

生物大分子的形成

在原始地球条件下,有两条路径可以达到脱水缩合以形成高分子:其一是通过加热,将低相对分子量的构成物质加热使之脱水而聚合;其二是利用存在于原始地球上的脱水剂来缩合。前者常常是在近于无水的火山环境中进行,后者则可以在水的环境中进行。生物大分子都可以在生物体内由简单的结构合成,也都可以在生物体内经过分解作用

生物大分子的特点

生物大分子的特点在于其表现出的各种生物活性和在生物新陈代谢中的作用。生物大分子是构成生命的基础物质。比如:某些多肽和某些脂类物质的分子量并未达到惊人的地步,但其在生命过程中同样表现出了重要的生理活性。与一般的生物大分子并无二致。

生物大分子的“相变”

编者按:生物大分子的“相变”或者说“相分离”应该说近几年来生命科学领域里面发展非常迅速的热门领域。然而很多同行却表示自己还没搞清楚“相分离”到底是怎么回事它就已经火了。为什么说火了?除了同行私底下交谈关于最新学术进展可以约莫了解一些之外,另一个风向标是观察以CNS为代表的杂志发表相关论文的情况。截止

生物分子的溶剂提取法

一、生物分子的溶剂提取法原理:利用溶剂的溶解作用把所需物质从细胞中转移出来。二、影响生物分子的溶剂提取效率的因素:  1、溶剂的性质:根据相似相溶原理。  2、离子强度:离子强度是影响物质溶解度的主要因素,但离子强度对不同物质溶解度的影响不同,如高离子强度下DNA-核蛋白溶解度增加,低离子强度下RN

脂肪等于生物大分子

  脂肪到底是不是生物大分子,这是一个让很多生物老师都很纠结的问题,高中生物人教版必修一并没有生物大分子的定义(必修一33页提到“多糖、蛋白质、核酸等都是生物大分子”),很多辅导书籍及练习题也经常添乱,搞得我们在备课时一头雾水。开卷有益,让我们翻开高校教材找找答案吧!  一、高分子化合物  根据《有

什么是生物单分子技术

单分子技术是可孤立或用于实验或分析研究某一个分子。单分子研究,对比测量一个整体或大量分子,其中个体行为无法区分收集测量对比,只有一般特征才可以衡量。虽然大多数测量技术在观察单分子还不够灵敏,单分子荧光已成为一种探测尚不能充分理解的位于大量分子层面上,如肌球蛋白在肌肉组织或肌动蛋白丝运动,还有个体位于

生物细胞分子的常见基团

  (一)羟基-OH  很多有机分子上含有羟基-OH,如醇、糖、核酸、蛋白质等。“羟”的字和音都由“氢氧”二字拼合而成。羟基与水有某些相似的性质,羟基是典型的极性基团,与水可形成氢键,因此,分子上羟基越多,亲水性就越大。羟基与电负性大的原子如-NH中的氮能形成氢键,氢键在维持蛋白质、核酸等大分子的空

生物分子成功置于纳米弹簧中

  据美国每日科学、物理学家组织网近日报道,美国俄勒冈州立大学研究人员在纳米弹簧中成功地放置了生物分子,该纳米弹簧在微型反应器中能最大限度地扩张药品同其他物质接触的表面积。它可作为一种高效催化剂载体,大大加快化学反应速度。详细研究成果发表在《生物技术进展》杂志上。   在纳米技术的

生物大分子单晶衍射仪

  生物大分子单晶衍射仪是一种用于生物学领域的分析仪器,于2005年7月11日启用。  技术指标  Mar-X型生物大分子X射线衍射采集系统是新一代即开即用的X射线衍射仪,具有节能稳定、耗材少,操作简单、使用可靠,不需要维护等特点。  主要功能  晶体衍射方法是测定生物大分子空间结构解析的主要研究手

生物分子糖类核磁共振光谱

糖类核磁共振光谱解决糖类结构和构象的问题。

生物分子的透析分离法

一、生物分子透析分离的原理:天然或人工半透膜只允许小分子通过而阻碍大分子通过,当膜的两侧存在小分子浓度差时,小分子从高浓度一侧向低浓度一侧扩散直到平衡。通过离心机分离不断去除扩散出来的小分子,从而达到分离纯化的目的。二、影响生物分子透析分离的因素:1、半透膜的通透性:半透膜的通透性取决于膜孔径的大小

生物大分子的功能特点

生物大分子的特点在于其表现出的各种生物活性和在生物新陈代谢中的作用。生物大分子是构成生命的基础物质。比如:某些多肽和某些脂类物质的分子量并未达到惊人的地步,但其在生命过程中同样表现出了重要的生理活性。与一般的生物大分子并无二致  。

生物分子核酸核磁共振光谱

“核酸核磁共振”是利用核磁共振光谱学获得关于多核酸如DNA或RNA的结构和动力学的信息。截至2003年,所有已知RNA结构中近一半已通过核磁共振波谱法确定。核酸和蛋白质核磁共振波谱相似但存在差异。核酸具有较小的氢原子百分比,这是在NMR光谱学中通常观察到的原子,并且因为核酸双股螺旋是刚性的且大致线性

生物大分子样品的保存

生物大分子制成品的正确保存极为重要,一旦保存不当,辛辛苦苦制成的样品失活、变性、变质,使前面的全部制备工作化为乌有,损失惨重,全功尽弃。影响生物大分子样品保存的主要因素有:⑴空气:空气的影响主要是潮解、微生物污染和自动氧化。空气中微生物的污染可使样品腐败变质,样品吸湿后会引起潮解变性,同时也为微生物