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科学家“复活”石器时代分子,展现古代微生物多样性

古代基因组重建和生物技术的突破正在揭示旧石器时代微生物丰富的分子秘密。在最新一期《科学》杂志上发表的研究中,德国莱布尼茨天然产物研究和感染生物学研究所、马克斯·普朗克进化人类学研究所以及美国哈佛大学领导的跨学科研究团队重建了更新世以前未知细菌的基因组,并由此建立了一个平台以恢复古代细菌的天然产物。当一个生物体死亡时,它的DNA会迅速降解并分裂成许多微小的碎片。科学家可通过将这些DNA片段与数据库进行匹配来识别其中的一些片段,但大多数古代DNA无法与当今已知的任何东西相匹配。这个问题长期以来一直困扰着科学家。近年来计算技术的进步使得将DNA片段重新组合在一起成为可能,就像拼图一样,或可重建未知的基因和基因组。经过3年的测试和优化,科学家取得了突破,实现了长度超过100000个碱基对的DNA片段,并恢复了广泛的古代基因和基因组。他们现在可从数十亿个未知的古代DNA片段开始,系统地将它们整理成冰河时代失传已久的细菌基因组。团队专注于重......阅读全文

微生物所发现植物保护内源编码基因避免RNA沉默的新机制

  在真核生物中,RNA沉默是一个具有核苷酸序列特异性的,能够导致RNA降解、DNA甲基化,异染色质形成,以及蛋白翻译抑制的调控机制。在植物中,诱发高效的RNA沉默还包括siRNA和甲基化在靶序列上的漂移、沉默信号在细胞间和整株植物的扩散并产生由信号诱导的RNA沉默(非自主性沉默)。植

调整基因编码蛋白的检测

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常见癌基因编码蛋白的检测

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PTEN基因编码的概念和特点

PTEN基因编码的蛋白具有蛋白磷酸酶和脂质磷酸酶活性,是第一个具有磷酸酶活性的抑癌基因,也是是继p53和Rb基因之后,与肿瘤发生密切相关的一种抑癌基因,其主要机制因为PTEN是PI3K/Akt通路的主要负调控因子。PTEN的功能缺陷在人类多种肿瘤中广泛存在。

常见癌基因编码蛋白的检测

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POLE正相关基因编码功能描述

该基因编码DNA聚合酶epsilon的催化亚单位。这种酶参与DNA修复和染色体DNA复制。该基因突变与结直肠癌12和面部畸形、免疫缺陷、利维多和身材矮小有关。This gene encodes the catalytic subunit of DNA polymerase epsilon. The

ECSCR基因编码功能及结构描述

该基因编码的蛋白质主要存在于内皮细胞和血管中,参与细胞形态变化和表皮生长因子诱导的细胞迁移。能增强血管内皮生长因子受体-2/激酶插入结构域受体的活化,并促进内化激酶插入结构域受体的蛋白水解。该基因可能在血管生成相关疾病中发挥作用。选择性剪接导致多个转录变体。The protein encoded b

DPROSHA基因编码功能及结构描述

双链(ds)RNA特异性内核糖核酸酶III超家族成员参与真核细胞和原核细胞的多种RNA成熟和衰变途径(Fortin等人,2002[PubMed 12191433])。RNase III Drosha是核心核酸酶,执行细胞核中microRNA(microRNA)处理的起始步骤(Lee等人,2003[P

DNTT基因编码功能及结构描述

该基因是DNA聚合酶X型家族的一员,编码一种对寡核苷酸引物的3'-羟基末端添加脱氧核苷酸进行催化的模板无关DNA聚合酶在体内,编码蛋白在正常和恶性的前b和前t淋巴细胞的限制性群体中在早期分化过程中表达,通过在重组ig重链和t细胞受体基因片段的连接处合成非生殖系元素(n区)来产生抗原受体多样性

DNTT基因编码功能及结构描述

该基因是DNA聚合酶X型家族的一员,编码一种对寡核苷酸引物的3'-羟基末端添加脱氧核苷酸进行催化的模板无关DNA聚合酶在体内,编码蛋白在正常和恶性的前b和前t淋巴细胞的限制性群体中在早期分化过程中表达,通过在重组ig重链和t细胞受体基因片段的连接处合成非生殖系元素(n区)来产生抗原受体多样性

DEK基因编码功能及结构描述

这个基因编码一种具有一个SAP结构域的蛋白质。这种蛋白结合十字形和超螺旋DNA,诱导阳性的超螺旋形成闭合的环状DNA,并参与在mRNA处理过程中的剪接位点选择。涉及该区域的染色体畸变、该基因的表达增加以及抗该蛋白抗体的存在都与各种疾病有关。两个编码不同亚型的转录变体已经被发现。This gene e

DAXX基因编码功能及结构描述

该基因编码一种多功能蛋白质,位于细胞核和细胞质的多个位置。它与多种蛋白质相互作用,如凋亡抗原fas、着丝粒蛋白c和转录因子红细胞增多症病毒e26癌基因同源物1。在细胞核中,编码的蛋白质作为一种与sumoylated转录因子结合的有效转录抑制因子发挥作用。它的抑制作用可以通过将这种蛋白质固定在早幼粒细

FANCE基因编码功能及结构描述

fanconi贫血互补组(fanc)目前包括fanca、fancb、fancc、fancd1(也称为brca2)、fancd2、fance、fancf、fancg、fanci、fancj(也称为brip1)、fancl、fancm和fancn(也称为palb2)。先前定义的组fanch与fanca相

FANCI基因编码功能及结构描述

fanconi贫血互补组(fanc)目前包括fanca、fancb、fancc、fancd1(也称为brca2)、fancd2、fance、fancf、fancg、fanci、fancj(也称为brip1)、fancl、fancm和fancn(也称为palb2)。先前定义的组fanch与fanca相

FANCL基因编码功能及结构描述

这个基因编码泛素连接酶,它是范科尼贫血互补组(FANC)的成员。这一组的成员通过组装成一个共同的核蛋白复合物而不是通过序列相似性来联系。该基因编码互补群L的蛋白,该蛋白介导FANCD2和FANCI的单泛素化。范科尼贫血是一种遗传异质性隐性疾病,其特征是细胞遗传不稳定、对dna交联剂过敏、染色体断裂增

FES基因编码功能及结构描述

该基因编码具有转化能力的猫肉瘤逆转录病毒蛋白的人类细胞对应物。该基因产物具有酪氨酸特异性蛋白激酶活性,该活性是维持细胞转化所必需的。它的染色体定位与急性早幼粒细胞白血病患者中发现的一种特殊易位事件有关,但它也参与正常造血以及生长因子和细胞因子受体信号传导。选择性剪接导致编码不同亚型的多个变体。[由R

CLSPN基因编码功能及结构描述

这个基因的产物是检查点激酶1的一个重要上游调节因子,并触发细胞周期的检查点阻滞,以应对复制应激或dna损伤。在正常的s期,这种蛋白质也是有效的dna复制所必需的。已发现该基因编码不同亚型的多个转录变体。[由RefSeq提供,2010年6月]The product of this gene is an

CLTC基因编码功能及结构描述

氯氰菊酯是细胞内细胞器胞质表面的主要蛋白质成分,称为包被泡和包被坑这些特殊的细胞器参与受体的细胞内运输和多种大分子的内吞作用氯氰菊酯外壳的基本亚基由三条重链和三条轻链组成。[由RefSeq提供,2008年7月]Clathrin is a major protein component of the

CIITA基因编码功能及结构描述

该基因编码一个具有酸性转录激活结构域、4个LRRs(富含亮氨酸重复序列)和GTP结合结构域的蛋白质该蛋白位于细胞核内,是Ⅱ类主要组织相容性复合物基因转录的正调控因子,被称为这些基因表达的“主控因子”该蛋白还结合GTP,并利用GTP结合促进自身运输到细胞核一旦进入细胞核,它就不会与DNA结合,而是利用

CHFR基因编码功能及结构描述

该基因编码一种E3泛素蛋白连接酶,维持调控细胞周期进入有丝分裂的前相检查点,因此可能在细胞周期进展和肿瘤发生中起关键作用编码的蛋白质具有一个N末端叉头相关结构域、一个中央无名指结构域和一个富含半胱氨酸的C末端区域。已经描述了编码不同蛋白质亚型的选择性剪接转录变体[由RefSeq提供,2014年3月]

ERF基因编码功能及结构描述

ets2是一种转录因子和原癌基因,参与端粒酶的发育、凋亡和调控。该基因编码的蛋白与ets2启动子结合,是ets2转录的一个强抑制因子。已经发现了编码两种不同亚型的转录变体。[由RefSeq提供,2015年8月]ETS2 is a transcription factor and protooncog

EPOR基因编码功能及结构描述

该基因编码红细胞生成素受体,红细胞生成素受体是细胞因子受体家族的一员。在促红细胞生成素结合后,该受体激活JAK2酪氨酸激酶,激活不同的细胞内途径,包括:ras/map激酶、磷脂酰肌醇3激酶和stat转录因子。受刺激的促红细胞生成素受体似乎在红细胞存活中起作用。红细胞生成素受体缺陷可导致红白血病和家族

ENG基因编码功能及结构描述

该基因编码一种同二聚体跨膜蛋白,是血管内皮的主要糖蛋白。该蛋白是转化生长因子β受体复合物的一个组成部分,它与beta1和beta3肽具有高亲和力。该基因突变导致遗传性出血性毛细血管扩张症,也称为Osler-Rendu-Weber综合征1,常染色体显性遗传性多系统血管发育不良这个基因也可能与子痫前期和

FGR基因编码功能及结构描述

Gardner-Rasheed猫肉瘤病毒(v-fgr)致癌基因同源物,也称为FGR,是人类中由FGR基因编码的蛋白质。 该基因是Src蛋白酪氨酸激酶(PTK)家族的成员。 编码的蛋白质含有用于豆蔻酰化和棕榈酰化的N-末端位点,PTK结构域和SH2和SH3结构域,其分别参与介导蛋白质 - 蛋白质与含磷

FHIT基因编码功能及结构描述

该基因编码的蛋白是一种参与嘌呤代谢的P1-P3-双(5'-腺苷)三磷酸水解酶这个基因包含了3号染色体上常见的脆性位点fra3b,致癌物引起的损伤可导致易位和异常转录。事实上,在大约一半的食管癌、胃癌和结肠癌中发现了这种基因的异常转录物。编码的蛋白质也是一种肿瘤抑制因子,因为其活性的丧失会导致

FUS基因编码功能及结构描述

该基因编码异质核核糖核蛋白(hnrnp)复合物的多功能蛋白成分。hnRNP复合物参与mRNA的前剪接和全加工mRNA向细胞质的输出该蛋白属于FET家族的RNA结合蛋白,参与了包括基因表达调控、基因组完整性维护和mRNA/microRNA处理在内的细胞过程选择性剪接导致多个转录变体该基因缺陷导致肌萎缩

FNTA基因编码功能及结构描述

Prenyl转移酶可通过C-末端Caax盒将硫醚连接的法尼酰基或香叶基与蛋白质的半胱氨酸残基结合。caax-geranylgeranyltransferase和caax-farnesyltransfer是具有相同α亚基但具有不同β亚基的异二聚体。这个基因编码这些转移酶的α亚单位。选择性剪接导致多个转

FPGS基因编码功能及结构描述

该基因编码叶酸聚谷氨酸合成酶这种酶在建立和维持细胞液和线粒体的叶酸多聚谷氨酸浓度方面起着中心作用,因此,对于叶酸的稳态和增殖细胞的生存至关重要这种酶催化谷氨酸部分对叶酸和叶酸衍生物的ATP依赖性加成选择性剪接导致编码不同亚型的转录变体。[由RefSeq提供,2014年1月]This gene enc