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构建“整合AIR的序列和结构特征,预测免疫反应”学习框架

适应性免疫受体(AIR,包括 T 细胞受体,TCR;B 细胞受体,BCR)与其同源抗原之间的结构对接是适应性免疫中最基本的过程之一。然而,目前预测 AIR-抗原结合的方法很大程度上依赖于 AIR 的序列衍生特征,忽略了结合亲和力所必需的结构特征。 腾讯 AI Lab 的研究人员提出了一个名为 DeepAIR 的深度学习框架,通过整合 AIR 的序列和结构特征来准确预测 AIR 与抗原的结合。 DeepAIR 在预测 TCR 的结合亲和力方面实现了 0.813 的 Pearson 相关性,在预测 TCR 和 BCR 的结合反应性方面的接受者操作特征曲线(AUC)下面积中值分别为 0.904 和 0.942。 同时,利用 TCR 和 BCR 库,DeepAIR 在测试数据中正确识别出每一位患有鼻咽癌和炎症性肠病的患者。因此,DeepAIR 改进了 AIR-抗原结合预测,促进了适应性免疫的研究。 该研究以「DeepAIR:......阅读全文

分泌型免疫球蛋白A的结构特征

  IgA在分泌物中主要以二聚体形式存在,SIgA是由十肽组成的免疫球蛋白,来自2个不同的细胞系,沉降系数为11S,它包含2个单体的IgA、1条J链和1个分泌片,它们通过共价结合就形成所谓的SIgA。  单体IgA主要存在于血清中,含量较低,其沉降系数为7S,相对分子质量约为165×103,是重链为

分泌型免疫球蛋白A的结构特征

IgA在分泌物中主要以二聚体形式存在,SIgA是由十肽组成的免疫球蛋白,来自2个不同的细胞系,沉降系数为11S,它包含2个单体的IgA、1条J链和1个分泌片,它们通过共价结合就形成所谓的SIgA。 单体IgA主要存在于血清中,含量较低,其沉降系数为7S,相对分子质量约为165×103,是重链为α的免

氧化反应的特征

1.物质与氧气发生的化学反应是氧化反应的一种;氧气可以和许多物质发生化学反应。得电子的作用叫还原。狭义的氧化指物质与氧化合;还原指物质失去氧的作用。氧化时氧化值升高;还原时氧化值降低。氧化、还原都指反应物(分子、离子或原子)。氧化也称氧化作用或氧化反应。有机物反应时把有机物引入氧或脱去氢的作用叫氧化

氧化反应的特征

1.物质与氧气发生的化学反应是氧化反应的一种;氧气可以和许多物质发生化学反应。得电子的作用叫还原。狭义的氧化指物质与氧化合;还原指物质失去氧的作用。氧化时氧化值升高;还原时氧化值降低。氧化、还原都指反应物(分子、离子或原子)。氧化也称氧化作用或氧化反应。有机物反应时把有机物引入氧或脱去氢的作用叫氧化

Ⅳ型超敏反应的反应特征

Ⅳ型超敏反应发生较慢,当机体再次接受相同抗原刺激后,通常需经24~72小时方可出现炎症反应,因此又称迟发型超敏反应(delayed typehypersensitivity,DTH)。此型超敏反应发生与抗体和补体无关,而与效应性T细胞和吞噬细胞及其产生的细胞因子或细胞毒性介质有关 。该型反应均在接触

亮绿的结构特征

亮绿(Brilliant Green),又名碱性艳绿,灿烂绿,快绿。是一种碱性染料。通常用其酸性硫酸盐,是细小发光的金色晶体,溶于水、醇,显绿色。

类病毒结构特征

类病毒为环状闭合单链RNA分子,由一些碱基配对的双链区和不配对的单链环状区相间排列而成。通常在二级结构分子中央处有一段保守区。位于棒状结构中心有一个高度保守的序列,其能决定类病毒的种类。靠近这一保守中心区的左侧有一个多聚嘌呤区,棒状结构左侧序列保守性强,右侧变异性大。危害病理类病毒会引起植物基因序列

钴胺素的结构特征

谷氨酰胺和甲基谷氨酰胺是B12的两种辅酶形式。在咕啉环平面上方钴离子与5,6-二甲基苯基咪唑的N-3相连,在平面下方与5'-脱氧腺苷的C5’相连。一般应用的B12,和钴离子相连的是CN,称为氰钴氨,为绿色结晶。

抗原的结构特征

抗原在化学结构上与机体自身不同,具有异物性:①异种物质。从生物进化过程来看,异种动物间的血缘关系越远,则免疫原性越强。如马的血清和各种微生物与人的血缘关系远,所以免疫原性强。而马的血清与驴、骡的血缘关系近,所以免疫原性相对就弱。②同种异体物质。如人的红细胞抗原物质和人的白细胞抗原等。③自身物质。自身

tRNA的结构特征

tRNA的结构特征之一是含有较多的修饰成分,如上面提到的 D、T、 Ψ等;核酸中大部分修饰成分是在tRNA中发现的。修饰成分在tRNA分子中的分布是有规律的,但其功能不清楚。1974年用X射线晶体衍射法测出第一个tRNA——酵母苯丙氨酸tRNA晶体的三维结构,分子全貌象倒写的英文字母L,呈扁平状,长

布鲁氏菌的结构特征

  布鲁氏菌为小球杆状菌,革兰氏染色阴性,无鞭毛,不形成芽孢,一般无荚膜,毒力菌株可有菲薄的荚膜。初次分离时多呈球状,球杆状和卵圆形,该菌传代培养后渐呈短小杆状。  布鲁氏菌细胞膜是一个三层膜的结构,最内层的膜称为细胞质膜、外层膜称为外周胞质膜,最外层膜称为外膜。外膜与聚肽糖(peptidoglyc

结构基因的特征

1.它们彼此紧密连锁。按Z,Y,A顺序排列,而且在一起转录形成一个多顺反子的mRNA;2.只有当乳糖存在时,这些基因才迅速转录,形成多顺反子的mRNA,并翻译成相应的酶。所以这些酶,就是由乳糖诱导产生的诱导酶,其活性的产生和活性的提高不是已有的酶被激活所致,而是在诱导物的诱导下酶的重新合成,并随着合

光聚合的反应特征

与普通化学法引发的聚合反应相比不同之处:引发聚合的活性种的产生方式。活性种是由光化学反应产生的聚合反应称为光聚合反应。因此,就链式反应而言光聚合只有在链引发阶段需要吸收光能。

一文解析:光化学反应釜的结构特征

  一、光化学反应釜的结构特征:  1、又称为光化学反应仪,多功能光化学反应器,光催化反应装置,多功能光化学反应仪等多系列光催化装置是光化学反应仪的基础上和实验室实践合作共同开发的新一代光化学反应装置。  2、主要用于研究气相、液相固相、流动体系在模拟紫外光、模拟可见光、特种模拟光照射下,是否负载光

固有免疫的住特征

固有免疫是生物在长期进化中逐渐形成的,是机体抵御病原入侵的第一道防线。参与固有免疫的细胞如单核-巨噬细胞、树突状细胞、粒细胞、NK细胞和NK T细胞,其识别免疫原虽然不像T细胞和B细胞那样具有高度的特异性,但可通过一类模式识别受体去识别病原微生物表达的称为病原体相关模式分子的结构。其特征是:(1)无

卤素原子结构特征

原子结构特征最外层电子数相同,均为7个电子,由于电子层数不同,原子半径不同,从F~I原子半径依次增大,因此原子核对最外层的电子的吸引能力依次减弱,从外界获得电子的能力依次减弱,单质的氧化性减弱。

锌指结构的共同特征

锌指结构的共同特征是通过肽链中氨基酸残基的特征基团与Zn2+的结合来稳定一种很短的,可自我折叠成“手指”形状的的多肽空间构型。

类病毒的结构特征

类病毒为环状闭合单链RNA分子,由一些碱基配对的双链区和不配对的单链环状区相间排列而成。通常在二级结构分子中央处有一段保守区。位于棒状结构中心有一个高度保守的序列,其能决定类病毒的种类。靠近这一保守中心区的左侧有一个多聚嘌呤区,棒状结构左侧序列保守性强,右侧变异性大。

电热套的结构特征

电热套是用无碱玻璃纤维作绝缘材料,将Cr20Ni80合金丝簧装置于其中,用硅酸铝棉经真空定型的半球形保温体保温,外壳一次性注塑成型,上盖采用静电喷电热套常见外观(8张)塑工艺,由于采用球形加热,可使容器受热面积达到60%以上。控温采用计算机芯片做主控单元,采用多重数字滤波电路,模糊PID控制算法,具

趋化因子的结构特征

所有趋化因子都很小,分子量在8到10 kDa之间。它们之间大约有20-50%是相同的;也就是说,它们具有相同的基因序列和氨基酸序列同源性。它们也都拥有保守的氨基酸,这些氨基酸对形成它们的三维或三级结构很重要,例如在大多数情况下四个半胱氨酸相互作用,形成一个希腊钥匙形状,这是趋化因子的一个特征。分子内

蓝细菌的结构特征

蓝细菌的细胞一般比细菌大,通常直径为3~10μm,最大的可达60μm,如巨颤蓝细菌。根据细胞形态差异,蓝细菌可分为单细胞和丝状体两大类。单细胞类群多呈球状、椭圆状和杆状,单生或团聚体,如粘杆蓝细菌和皮果蓝细菌等属;丝状体蓝细菌是有许多细胞排列而成的群体,包括:有异形胞的(如鱼腥蓝细菌属),无异形胞的

氧化反应的主要特征

1.物质与氧气发生的化学反应是氧化反应的一种;氧气可以和许多物质发生化学反应。得电子的作用叫还原。狭义的氧化指物质与氧化合;还原指物质失去氧的作用。氧化时氧化值升高;还原时氧化值降低。氧化、还原都指反应物(分子、离子或原子)。氧化也称氧化作用或氧化反应。有机物反应时把有机物引入氧或脱去氢的作用叫氧化

还原反应的定义和特征

还原反应就是物质(分子、原子或离子)得到电子或电子对偏近的反应。一个完整的化学反应中,还原反应与氧化反应一般是同时存在的。中文名还原反应外文名Reduction Reaction概    念得到电子或电子对偏近的反应领    域化学特    征还原反应与氧化反应是同时存在举    例氢气与氯气的化合

酶催化反应的特征

特征酶催化反应还表现出一种在非酶促反应中不常见到的特征,即可与底物饱和。当底物浓度增加时,酶反应速率达到平衡并接近一个最大值Vm(见图)。公式简介1913年L.迈克利斯和L.M.门顿发展了关于酶的作用和动力学的一般理论,假定酶E首先与底物S结合形成酶-底物复合物ES;然后此复合物在第二步反应中分解形

催化反应特征的介绍

  催化反应有四个基本特征,可以根据定义导出,对了解催化剂的功能很重要。  1、催化剂只能加速热力学上可以进行的反应。要求开发新的化学反应催化剂时,首先要对反应进行热力学分析,看它是否是热力学上可行的反应。  2、催化剂只能加速反应趋于平衡,不能改变反应的平衡位置(平衡常数)。  3、催化剂对反应具

Ⅳ型超敏反应的特征

Ⅳ型超敏反应是由效应性T细胞与相应抗原作用后,引起的以单个核细胞浸润和组织细胞损伤为主要特征的炎症反应。细胞介导的免疫反应有不同的类型。与上述的由特异性抗体介导的三种类型的超敏反应不同,Ⅳ型或迟发型超敏反应(delayed type hypersensitivity,DTH)是由特异性致敏效应T细胞

细胞的免疫反应

展望未来,研究人员计划在多次给药后检查肺部运输的动力学,并研究基于细胞的免疫反应。Pasqualini说:“重要的是要注意,所有这些工作都是在临床前模型中进行的,因此我们期待将我们的方法应用于临床应用,例如针对肺部给药或基于肺部的疫苗接种。” 研究人员在概念验证研究中证明,用于疫苗的基于噬菌体的吸入

关于脑干网状结构的结构特征介绍

  网状结构神经元的轴突有长的上升支和下降支分别可抵达丘脑及脊髓(图一-2天大鼠脑干矢状切面),同一可通过它的侧支影响其上下不同水平的许多神经元。网状结构神经元的树突与其长的轴突常呈垂直方向排列,表明多方面来源的传入冲动可在网状结构内整合(图二-网状结构神经元树突的走行方向幼鼠网状细胞树突与脑干长轴

基因免疫的主要特征

基因免疫(gene immunization)又称DNA免疫(DNA immunization)、核酸疫苗(polynucleotide vaccine)、DNA疫苗、体细胞转基因免疫(somatic transgene immunization)。由于基因免疫将质粒DNA直接免疫,又称为裸DNA免

体液免疫缺陷的临床特征

体液免疫(B细胞)缺陷为主的疾病表现为免球蛋白的减少或缺乏。包括:(1)原发性丙种球蛋白缺乏症:有两种类型:①Bruton型,较常见,为婴儿性联丙种球蛋白缺乏病,与X染色体隐性遗传有关,仅发生于男孩,于出生半年以后开始发病;②常染色体隐性遗传型,男女均可受累,也可见于成年人。(2)孤立性IgA缺乏症