河流水库水体中微生物残体DNA干扰微生物多样性研究新进展

微生物残体DNA广泛存在于陆地和水域生态系统中。从水环境样品中提取的微生物DNA通常来自活体微生物和死亡微生物残体。环境DNA高通量测序技术的应用,显著提高了微生物群落检测的效率和通量,而无法区分微生物细胞的死活状态。因此,基于环境DNA的微生物群落分析会造成一些微生物多样性和群落组成的错误估计。已有研究使用叠氮溴化丙锭(Propidium monoazide,PMA)染色方法,可选择性地结合死细胞DNA,进而抑制PCR扩增。同时,PMA处理与高通量测序技术相结合,能够区分死活微生物,实现活体微生物群落分析。然而,以往研究集中在土壤环境或者细菌群落,而未对河流水库水体中浮游细菌和真核微生物群落进行系统研究。 中国科学院城市环境研究所水生态健康研究组(杨军团队)以亚热带河流水库浮游微生物为研究对象,利用PMA处理水体中死亡微生物的DNA,结合16S rRNA和18S rRNA基因扩增子测序,对水体中总体和活体微生物群落时空动......阅读全文

外源养分添加和土壤团聚体结构对微生物残体影响

  热带森林生态系统通常受磷的限制,氮沉降增加会加剧生态系统磷限制的程度,进而影响土壤碳循环过程。微生物残体不仅是土壤有机碳库的重要贡献来源,也可以通过土壤团聚体结构的调控间接影响土壤有机碳库的稳定性。但是关于土壤养分的可获得性、团聚体结构以及它们的交互作用如何影响微生物残体的积累及其对有机碳库的贡

热带森林微生物残体碳对氮添加方式的响应获揭示

近日,中科院华南植物园恢复生态学任务团队发现土壤深度调控热带森林微生物残体碳对氮添加方式的响应。相关研究发表于国际学术期刊《环境管理杂志》(Journal of Environmental Management)。土壤微生物是土壤碳循环过程的关键驱动者,微生物残体作为土壤有机碳库的重要来源,在调控土

微生物残体对森林土壤有机碳贡献研究获进展

  土壤微生物残体是微生物合成代谢和反复积累形成的难分解有机物,被认为它也是土壤有机碳库,尤其是稳定有机碳库的重要组成部分,在森林土壤有机碳固存和维持森林碳汇功能等方面发挥重要作用。然而,土壤细菌残体和真菌残体对土壤有机碳贡献的空间分布格局及其背后驱动机制尚不明确。  鉴于此,沈阳生态所人工林生态组

高寒草地土壤微生物群落构建及残体碳分布的研究

  作为生物地球化学循环的“引擎”,土壤微生物在调节土壤肥力、植物生长和气候变化等方面起到关键作用。作为土壤稳定碳库的重要组成部分,微生物残体碳占土壤有机碳的比例可达约50%以上。因此,阐明土壤微生物的群落构建机制及其残体碳的关键调控因素有助于探索土壤生态功能及其对全球变化的响应。目前,缺乏多营养级

高寒草地土壤微生物群落及残体碳分布研究获进展

中科院植物研究所研究员杨元合团队与合作者以青藏高原高寒草地为研究对象,基于样带调查,结合高通量测序、Null模型等手段,解析了不同营养级土壤生物群落的构建机制。相关研究成果于近日分别发表于《全球变化生物学》和《环境微生物学》。 作为生物地球化学循环的“引擎”,土壤微生物在调节土壤肥力、植物生长和

微生物残体循环的环境和微生物控制

  人们普遍认为,微生物残体碳是稳定土壤碳的主要组成部分,但其对碳稳定过程的控制因子尚不清楚。在稳定过程之前,微生物残体可能被微生物群落循环再利用。我们认为,这种再利用的效率是土壤碳稳定率的关键决定因素。本文采用稳定同位素示踪和指示种分析法,探讨了英国27个草地的土壤微生物残体再利用效率的控制因素。

高寒草地土壤微生物群落构建及残体碳分布研究新进展

  作为生物地球化学循环的“引擎”,土壤微生物在调节土壤肥力、植物生长和气候变化等方面起到关键作用。作为土壤稳定碳库的重要组成部分,微生物残体碳占土壤有机碳的比例可达约50%以上。因此,阐明土壤微生物的群落构建机制及其残体碳的关键调控因素有助于探索土壤生态功能及其对全球变化的响应。目前,缺乏多营养级

细胞DNA倍体分类

DNA含量分析参数实验步骤二倍体细胞实验步骤展开 近二倍体细胞实验步骤展开近二倍体细胞实验步骤展开四倍体细胞实验步骤展开非整倍体细胞实验步骤展多异倍体实验步骤

细胞DNA倍体分类

DNA含量分析参数 二倍体细胞 近二倍体细胞 四倍体细胞 非整倍体细胞 多异倍体             实验步骤

细胞DNA倍体分类

DNA含量分析参数 二倍体细胞 近二倍体细胞 四倍体细胞 非整倍体细胞 多异倍体             实验步骤

鲑精担体DNA制备实验

基本方案             实验材料 鲑精DNA

鲑精担体DNA制备实验

利用这一方案可获得剪切好的高质量鲑精担体DNA,它可用于转化实验和其他需要高质量担体DNA的实验中。实验材料鲑精DNA试剂、试剂盒TE酚氯仿乙酸钠仪器、耗材离心机摇床超声仪实验步骤1.  将TE缓冲液加入装有干燥鲑精DNA的烧杯中,至鲑精DNA浓度为5~10 mg/ml。用10 ml 吸管反复吹打后

核糖体DNA的定义

核糖体DNA(Ribosomal DNA,rDNA)是一种DNA序列,该序列用于rRNA编码。核糖体是蛋白质和rRNA分子的组合,翻译mRNA分子以产生蛋白质的组件。真核生物的rDNA包括一个单元段,一个操纵子,以及由NTS、ETS、18S、ITS1、5.8S、ITS2和28S束组成的串联重复序列。

鲑精担体DNA制备实验

实验材料 鲑精DNA试剂、试剂盒 TE酚氯仿乙酸钠仪器、耗材 离心机摇床超声仪实验步骤 1.  将TE缓冲液加入装有干燥鲑精DNA的烧杯中,至鲑精DNA浓度为5~10 mg/ml。用10 ml 吸管反复吹打后,用搅拌棒于4℃搅拌过夜,最终获得一种均匀粘稠液体。 2.  将一个较大的超声波探头插入烧杯

染色体DNA的提取

一、实验目的与原理DNA是遗传信息的载体,是最重要的生物信息分子,是分子生物学研究的主要对象。DNA的提取是分子生物学实验技术中的最重要、最基本的操作。本实验通过植物样品在液氮下研磨以粉碎组织,通过裂解液裂解细胞,有机溶剂反复抽提,使DNA进入水相与蛋白质成分分开,在RNase作用下,降解RNA以纯

种子DNA提取仪用在农残检测中的检测过程

   我们知道,种子DNA提取仪是一种高效的样品研磨仪器,在动物组织、种子细胞等核酸提取实验中非常实用,但在农残检测中有用吗?   答案是可以的。随着农业的发展,农残检测变得越来越重要,同时也需要提高检测的速度来适应社会发展的需要,过去传统的农残检测方法,在研磨样品的时候耗时、费力、效率低,而现在只

我学者揭示土壤团聚体碳固持与植物残体碳输入间联系。

  林植被发育过程中,植物残体基质组成以及土壤微生物群落结构均相应改变,导致土壤团聚体分布发生变化,从而对土壤有机碳固存和稳定性产生显著影响。因此,开展土壤团聚体不同颗粒中有机质的含量和降解程度的研究,对森林群落发育下土壤碳截获过程和机制研究具有重要意义。土壤团聚结构和稳定性受植物根系生长周转和真菌

微生物检测应用DNA探针法

在许多病原微生物的检测上,常用的分离培养方法需要的时间较长,手续也较繁杂,而且病灶和粪便等病料含杂菌较多,阻碍病原微生物的检出,不能快速做出诊断。免疫学方法也有许多不足之处,尤其是在持续性感染和感染潜伏期抗体尚未产生或不易检测出抗体的情况下,即使有抗体存在也难以判断。而应用核酸探针技术,就可以直接确

肠道微生物DNA的提取方法

实验概要肠道微生物DNA是进行微生物分子生态学研究的前提。能否获得高的DNA提取率和高质量的DNA,从而真实地反映微生物群落的实际情况,是保障研究结果是否可靠的关键。如何获取高质量、较完整的肠道菌群基因组DNA是肠道微生物研究中的关键。本研究采用物理方法,化学方法,酶解法等进行DNA提取,并对其进行

DNA结合模体的结构特点

中文名称DNA结合模体英文名称DNA-binding motif定  义DNA结合蛋白中与DNA发生相互作用的区域所具有的特定的结构模式。如锌指结构、亮氨酸拉链、螺旋-转角-螺旋、螺旋-环-螺旋等。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)

细胞化学词汇DNA双链体

中文名称:DNA双链体英文名称:DNA duplex定  义:两条以3′,5′-磷酸二酯键相连而成的反向多核苷酸链通过沿着其轴向的互补碱基对的氢键交联在一起形成的双链DNA,通常形成双螺旋的结构。可以共价闭合成环状分子,形成超螺旋DNA。应用学科:生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学

DNA倍体异质性分析

肿瘤原发灶DNA倍体异质性分析-同质体肿瘤 肿瘤原发灶DNA倍体异质性分析-异质体肿瘤 肿瘤原发灶DNA倍体异质性分析的临床意义 肿瘤原发灶和淋巴结转移灶DNA倍体异质性分析 肿瘤原发灶和癌旁组织细胞DNA倍体异质性分析

细胞化学基础核糖体DNA

核糖体DNA(Ribosomal DNA,rDNA)是一种DNA序列,该序列用于rRNA编码。核糖体是蛋白质和rRNA分子的组合,翻译mRNA分子以产生蛋白质的组件。真核生物的rDNA包括一个单元段,一个操纵子,以及由NTS、ETS、18S、ITS1、5.8S、ITS2和28S束组成的串联重复序列。

DNA倍体异质性分析

肿瘤原发灶DNA倍体异质性分析-同质体肿瘤 肿瘤原发灶DNA倍体异质性分析-异质体肿瘤 肿瘤原发灶DNA倍体异质性分析的临床意义 肿瘤原发灶和淋巴结转移灶DNA倍体异质性分析 肿瘤原发灶和癌旁组织细胞DNA倍体异质性分析

DNA三链体的结构特点

中文名称DNA三链体英文名称DNA triplex定  义DNA的一种特殊的结构,是由第三条核苷酸链通过胡斯坦碱基配对,与双螺旋DNA中的一条链以特殊的氢键相连形成的一种三股螺旋DNA结构。三股链均为同型聚嘌呤或聚嘧啶;第三个碱基以A或T与A≒T碱基对中的A配对;G或C与G≒C碱基对中的G配对,C必

细胞化学词汇DNA四链体

中文名称:DNA四链体英文名称:DNA tetraplex定  义:富含鸟嘌呤序列的四链DNA所形成的一种结构。已发现两种主要的类型,一类为重复的鸟嘌呤序列的回折形成的反平行链;另一类由四条独立的平行链相系而成。应用学科:生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科) 

染色体DNA的片段化

实验概要琼脂糖(agarose)或聚丙烯酰胺(PAGE)电泳是分离、鉴定和纯化DNA的标准方法。琼脂糖凝胶的分辨率比聚丙烯酰胺电泳低,但分离范围广,可以分离200 bp一50 kb的DNA。细胞凋亡时染色体从核小体间断裂形成大小为180-200bp整数倍的片段,在琼脂糖凝胶中电泳后可呈现出规

核糖体DNA的结构特点

核糖体DNA(Ribosomal DNA,rDNA)是一种DNA序列,该序列用于rRNA编码。核糖体是蛋白质和rRNA分子的组合,翻译mRNA分子以产生蛋白质的组件。真核生物的rDNA包括一个单元段,一个操纵子,以及由NTS、ETS、18S、ITS1、5.8S、ITS2和28S束组成的串联重复序列。

细胞化学词汇DNA结合模体

中文名称:NA结合模体英文名称:DNA-binding motif定  义:DNA结合蛋白中与DNA发生相互作用的区域所具有的特定的结构模式。如锌指结构、亮氨酸拉链、螺旋-转角-螺旋、螺旋-环-螺旋等。应用学科:生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)

细胞化学词汇DNA三链体

中文名称:DNA三链体英文名称:DNA triplex定  义:DNA的一种特殊的结构,是由第三条核苷酸链通过胡斯坦碱基配对,与双螺旋DNA中的一条链以特殊的氢键相连形成的一种三股螺旋DNA结构。三股链均为同型聚嘌呤或聚嘧啶;第三个碱基以A或T与A≒T碱基对中的A配对;G或C与G≒C碱基对中的G配对