复旦大学樊嘉、孙云帆等团队揭秘转移性肝癌:多组学研究揭示关键分子特征

一支来自中国的团队采用多组学方法,分析了随时间变化的转移性肝细胞癌(HCC)肿瘤内部和跨越肿瘤的分子特征,发现了早期转移性扩散的多样性肿瘤克隆。复旦大学肝癌研究所的肝脏外科研究员孙云帆在一封电子邮件中解释说:“传统上将HCC转移视为疾病的终点。然而,我们的数据显示原发性HCC和转移瘤之间存在高度的遗传分歧,反映出转移前体在进化历史中早期出现。”正如他们在周四在《癌细胞》杂志上报告的那样,共同第一作者孙云帆及其同事依靠外显子测序和RNA测序来分析来自182名转移性HCC(mHCC)患者的461个甲醛固定石蜡埋藏的肿瘤区域,这些肿瘤侵犯了肺、骨、脑、肾、肾上腺、淋巴结、脾脏、膈肌、或腹膜。基于基因组和转录组的特征,研究团队结合数字空间分析(DSP)、组织病理学、T细胞受体库、以及转移性肿瘤的单细胞RNA测序数据,对mHCC肿瘤中的遗传异质性进行了表征。孙云帆说:“尽管监测和治疗策略取得了进展,提高了总体生存率,但转移仍然是导致患者死......阅读全文

Nature:光遗传学的光终于照到肿瘤免疫治疗领域!

  “光照一照,你的肿瘤就缩小”听起来像是科幻,或者是某些赤脚民科的夸大其辞,但实际上,这是罗彻斯特大学的研究者们经过谨慎研究的结果,他们把一个非常新颖而有效的武器——光遗传学应用到了肿瘤免疫治疗领域,有效地缓解了实体瘤微环境的免疫抑制,肿瘤明显缩小。  众所周知,实体瘤周围有免疫抑制的微环境,导致

代谢组学——肿瘤研究的利器

  细胞内许多生命活动是发生在代谢物层面的,代谢物更多地反映了细胞所处的环境,比如细胞现在是不是健康?药物是否起效?环境污染物是不是正在伤害细胞?等等。由此,20世纪90年代,衍生出了一门新学科:代谢组学。它回答了基因组学和蛋白质组学不能回答的问题:细胞到底发生了什么?  1、肿瘤与代谢组学  肿瘤

肿瘤的免疫学检测

      肿瘤的免疫学检测的主要目的是对肿瘤进行免疫学诊断和评估宿主的免疫功能状态。  一、肿瘤的免疫学诊断  (一)检测肿瘤抗原  这是目前最常用的肿瘤免疫学诊断法,如AFP的检测对原发性肝细胞性肝癌有诊断价值,CFA的检测有助于诊断直肠癌、胰腺癌等。但对于人类肿瘤特异性抗原的检测进展不大。  

大连化物所等肝癌代谢组学研究取得进展

  近日,中科院大连化学物理研究所许国旺研究员领导的高分辨分离分析及代谢组学研究团队(1808组)与上海东方肝胆医院王红阳院士课题组合作,将基于液相色谱-质谱用于肝癌组织非靶标代谢组学研究并取得了重要进展,相关研究成果已经在线发表在Cancer Research杂志上。   原发性肝癌是全球最

女性常见乳腺肿瘤的遗传学原因

  乳腺纤维腺瘤(Fibroadenomas),发生于乳腺小叶内纤维组织和腺上皮的混合性瘤,是乳房良性肿瘤中最常见的一种。乳腺纤维腺瘤可发生于青春期后的任何年龄的女性,但以18~25岁的青年女性多见。  最近,新加坡国立癌症中心、杜克新加坡国立医学研究所和新加坡总医院的科学家组成的一个多学科小组,对

研究发现肿瘤内微生物组可预测肝癌预后

  近日,Clinical and Translational Medicine以论著形式发表了北京协和医院肝脏外科主任医师毛一雷、副研究员杨华瑜团队关于肝细胞癌肿瘤内微生物组相关研究。研究显示,肝细胞癌肿瘤内微生物组显著不同于癌旁组织,不同患者之间、同一患者的不同病灶之间均存在明显异质性。这表明肝

“遗传学+连接组学”,推动精神疾病客观诊疗

近日,北京邮电大学人工智能学院与荷兰阿姆斯特丹自由大学、德国明斯特大学研究者合作,基于多组学医学大数据,揭示了脑连接组和精神分裂症及双相情感障碍拥有的共同的遗传因素,发现两种疾病的遗传因素对宏观脑连接组的构成起着重要作用。 这是对精神疾病病理机制研究的又一重要发现,有望推动精神疾病迈向基于多组学

分子遗传学词汇免疫应答基因

中文名称:免疫应答基因外文名称:immune response gene定义:为支配免疫反应性的基因的总称。广义的也包括免疫球蛋白基因,但一般指在它之外的基因。最重要的是指在主要组织相容性抗原基因复合体(MHC)内存在的Ir基因(Ir genes)。表达lr gene的方式多种多样,支配阻遏细胞和辅

科学家绘制肝癌药物基因组学“蓝图”

  8月1日,国际学术期刊Cancer Cell 在线发表了中国科学院生物化学与细胞生物学研究所惠利健研究组、中国科学院上海营养与健康研究所李亦学研究组、第二军医大学附属东方肝胆外科医院张海斌研究组以及南京大学医学院附属鼓楼医院施晓雷合作的题为A Pharmacogenomic Landscape

Cell重磅!揭秘肝癌多维蛋白组学最新成果

  2019年10月3日,国际顶尖期刊《cell》(SCI影响因子 36.216)在线发表了复旦大学附属中山医院樊嘉院士团队、中科院药物所周虎研究员团队、中科院生化与细胞所高大明研究员团队、美国“登月计划”临床蛋白质组肿瘤分析协作组(Clinical Proteomic Tumor Analysis

光遗传学首次用于控制肿瘤发生

  2014年10月,Nature Methods杂志在十周年之际推出了纪念特刊,点评了在过去十年中对生物学研究影响最深的十大技术,其中就包括光遗传学技 术。我们可以毫不夸张地说,光遗传学技术给神经学带来了一场革命。现在,这一技术已经迅速成为了许多实验室里的标准工具。尽管光遗传学还不是一个家喻户晓

肿瘤免疫学令医药界狂热

  免疫肿瘤学(IO)高达210亿英镑的潜在市场给大小制药公司带来了希望。  一些人竟然大胆地将它称为治愈癌症的有效方法。而保守人士则提到这种治疗方法在显著延长患者生存期方面出现早期迹象。不过,无论你问谁,IO无疑是抗癌领域多年来最激动人心的开发成果。  前所未有的数据  在这个曾经是癌症研究的边缘

最新肿瘤研究:合成免疫细胞组库可杀伤不同肿瘤

海军军医大学胡适、雷长海课题组采用合成生物学细胞重编程方法,建立了能够识别多样性未知抗原的合成免疫细胞组库。该组库由多克隆免疫细胞组成,携带有大容量嵌合抗原受体信息,可以识别超过106种抗原。 作为一种激发机体抗肿瘤免疫反应,依赖机体自身免疫力控制、清除肿瘤的治疗

细胞遗传学——比较基因组杂交(CGH)

·         Comparative Genomic Hybridization (CGH) CGH is a molecular Cytogenetic method of screening a tumor for genetic changes. The alterations are

利用遗传学手段描绘果蝇化学连接组

  最近十年,在神经科学领域被科学家提到频率最高的词汇中,“神经环路”绝对榜上有名并且排名很靠前。有关神经环路的研究因为技术的进步而变得可解决(do-able), 也因此成为当下最热门, 最具活力的研究领域之一。  最早的神经环路研究,大概源于人们开始思考如何判定大脑怎样指导行为,产生意识。其中比较

利用转录组学方法揭示南荻群体遗传

  南荻是中国特有的亩产生物量最大的芒属能源植物。南荻原产于河滨地带,但其遗传变异丰富,生态适应强,移栽到黄土高原等半干旱地区后,生长良好;由于其根系较浅,种植后不会过度利用深层土壤水分,可以有效减少地表径流,有助于水土保持,发挥重要的生态修复功能。  近日,中国科学院武汉植物园闫娟博士在李建强和桑

蛋白基因组学研究揭示肝癌发生和发展机制

  慢性乙肝病毒(hepatitis B virus,HBV)感染是导致我国肝癌发生的最主要原因,约85%的肝癌患者携带HBV感染标志。肝癌的发生发展是一个非常复杂的生物学过程,受到机体的系统性调控,基因突变会对HBV相关肝癌的表型产生怎样的影响,目前这方面的研究报道较少,亟待深入探究。同时,新药研

“系统生物学与遗传组学”研讨会在京开幕

  3月31日,由中国科学院和德国拜耳作物集团共同主办的“系统生物学与遗传组学”研讨会在京开幕。中国科学院副院长李家洋出席开幕式并致辞。   李家洋首先代表中科院对研讨会的顺利召开表示了祝贺。李家洋回顾了中科院与拜耳集团自2001年签署双边框架协议以来的合作历程和成果,并表示中科院

基因组学推进肿瘤研究未来发展

  ——访亿明达肿瘤业务营销副总裁约翰·莱特  基因组学正在改变肿瘤研究,其最终目标是推进癌症的诊断、治疗、监控及最终的筛查方式。  癌症通常按照形态进行分类,这指的是病理学家在显微镜下看到的内容。“如今,癌症分类依据已经开始从形态特征转变为更有效的治疗方式,其中的主要转变在很大程度上归功于基因组研

Oncotarget:首次利用光遗传学控制肿瘤发生

  在一项新的研究中,来自美国塔夫斯大学的研究人员基于青蛙模型首次证实利用光控制细胞之间的电信号,阻止肿瘤形成,以及在肿瘤形成后,让它们正常化。这项研究是首次报道利用光遗传学特异性地操纵生物电信号从而阻止癌基因诱导的肿瘤形成,和导致癌基因诱导的肿瘤消退。相关研究结果于2016年3月16日在线发表在O

肿瘤与遗传

   在人们生活的环境中存着不少物理的、化学的和生物的致癌因子,它们在一定条件下可以诱发肿瘤。例如,各种电离辐射和紫外线照射可以引起白血病和皮肤癌;多环芳烃化合物如3,4-苯并芘可以引起肺癌,黄曲霉素可以诱发肝癌;亚硝受可以引起各种消化道肿瘤;在生物因子中,已经证明某些病毒可以引起动物肿瘤,并与一些

遗传学大牛Science发现基因组新奥秘

  来自斯坦福大学,霍德华休斯医学院的一组研究人员发现,当基因组中相似的基因不断“弹出来”的时候,通常这些基因会丢失,但如果能被留下来(也就成为了多余基因),就会由于一个基因发生一次表达消减这一理论,而在哺乳动物中受到保护。  这一研究成果公布在5月20日的Science杂志上。文章的通讯作者是斯坦

酵母遗传学方法9:酵母免疫荧光

酵母免疫荧光1)细胞制备1.培养5ml酵母至对数生长早期(106~107细胞/ml)。2.直接加1/10体积的甲醛到培养基里固定细胞(加入的甲醛终浓度为3.7%,标准母液是37%)。3.细胞在甲醛中培养至少1小时。4.离心收集细胞,用0.1mol/L磷酸钾(pH7.5)洗一次。5.把细胞悬浮在1ml

肝癌和肝肿瘤的区别

核心提示: 肝癌是现在非常常见的一种疾病,这种病对患者来说伤害真的很大,肝癌也就是肝部的恶性肿瘤,它的治疗难度很大,早期还可能通过手术治疗,如果发现的比较晚,那么只能通过放射治疗来维持生命,所以大家平时一定要注意每年体检,如果发现身体出现什么状况一定要及时治疗。   随着人

肝癌的肿瘤标志物

核心提示: 我们都知道,肝癌是一种由于肝脏上皮细胞恶性增殖而造成的疾病,它的破坏力相当大,会对患者的生命安全造成严重的威胁,所以对于这种疾病,我们千万不能够掉以轻心。在日常的生活中,我们要密切的关注自己的身体状况,并且要定期的进行检查,如果发现肝癌肿瘤标志物升高,一定要及时的进行治疗。

如何判断肝肿瘤是肝癌?

核心提示:   肝肿瘤是肝癌吗?  好多人在B超单子上发现了肝上有一个肿瘤,这让很多人害怕不已,那么这个肝肿瘤是不是就是我们所称的肝癌呢?这些肿瘤我们应该如何区分呢?这些肿瘤有什么区别呢?下面我们一起来了解一下。  肝肿瘤是肝癌吗  肝恶性肿瘤才是俗称肝癌,在B超单子上常常写成

肝癌肿瘤多大能做介入?

核心提示: 肝癌即肝脏恶性肿瘤,可分为原发性和继发性两大类。原发性肝脏恶性肿瘤起源于肝脏的上皮或间叶组织,前者称为原发性肝癌,是我国高发的,危害极大的恶性肿瘤;后者称为肉瘤,与原发性肝癌相比较较为少见。在肝癌的治疗过程中,与普通手术治疗不同的是,即使是那些身体弱岁数大的病人也可

面对免疫肿瘤学和癌症生物学,我们能做些什么?

  当前,迅速发展的免疫肿瘤疗法已经改变了癌症治疗的前景。要发现安全、有效和持久的免疫细胞治疗产品,需要对癌症生物学和免疫细胞特性(例如激活、细胞命运、细胞毒性杀伤、免疫调节和记忆)有完整的了解。那么我们该使用什么工具对活细胞进行实时分析?  此外,随着我们通过使用更复杂的体外癌症模型不断提高对癌症

NEJM:找到“遗传密码”-预防肝癌复发

由复旦大学附属中山医院汤钊猷院士指导、中美科学家合作完成   复旦大学附属中山医院的肝癌研究再次取得突破性进展,10月15日发布已发现人体微小遗传密码miR-26在乙型肝炎病毒感染相关的肝癌发生中起较为关键的作用,找到了肝癌患者中该遗传密码表达水平低的人最有可能采用干扰素预防肝癌复发的可能机制,从

《自然-遗传学》:多种基因能够延缓衰老并抑制肿瘤

将来更深入的研究或能帮助人们保持年轻并远离癌症 美国科学家近日研究发现,秀丽隐杆线虫(C. elegans)体内含有多种能够同时减缓老化和抑制肿瘤细胞生长的基因。由于C. elegans的多种基因与人类的相似,所以此次发现意味着,也许有一天科学家将开发出能够延长寿命并避免癌症的药物。相关论文10月