新探针可实现对蛋白质N端组学深度富集检测

中国科学院上海药物研究所研究员黄河、柳红合作,研究设计合成了一种含有吡啶甲醛片段的可断裂分子探针2PCA-Probe,可实现对蛋白质N-端的深度富集检测。相关研究发表于《美国化学会志》。蛋白质水解是一种广泛存在的翻译后修饰方式,在多种生物过程中发挥重要作用。在正常组织中,大多数蛋白酶的活性受到严格调控,而在肿瘤组织中则往往被异常激活,并通过介导免疫逃逸、肿瘤细胞侵袭等多个途径促进肿瘤的发生发展。通过对蛋白质N-端进行系统检测可获得蛋白水解断裂信息,但现有的N-端组学检测方法存在操作复杂、检测深度不高等缺陷,限制了蛋白水解相关研究的进展。研究团队发现,吡啶甲醛片段与N-端氨基酸可以选择性发生环化反应形成咪唑烷酮结构,还可发生羟醛缩合反应,并由此发现该类标记方法生成的新诊断片段。通过该诊断片段信息,可以规避以往此类探针标记时遇到的限制,即无法标记2位氨基酸为脯氨酸的多肽。利用该方法,研究团队对三对结直肠癌组织和癌旁组织的N-端组进行......阅读全文

靶向探针精确操纵蛋白质

北京大学化学与分子工程学院教授陈鹏正在实验中。 作为生物体内含量最多的一类生物大分子,蛋白质是生物功能的主要执行者,在各种生命活动中扮演着关键角色。科学家一直在探索适用于活体环境的蛋白质操纵工具,以实现对目标蛋白质结构和功能的深入研究,这已经成为当今化学生物学领域的前沿热点之一。 在

蛋白质芯片技术探针的制备方法

低密度蛋白质芯片的探针包括特定的抗原、抗体、酶、吸水或疏水物质、结合某些阳离子或阴离子的化学集团、受体和免疫复合物等具有生物活性的蛋白质。制备时常常采用直接点样法,以避免蛋白质的空间结构改变。保持它和样品的特异性结合能力。高密度蛋白质芯片一般为基因表达产物,如一个cDNA文库所产生的几乎所有蛋白质均

蛋白质的内源荧光与荧光探针

利用荧光光谱法研究蛋白质一般有两种方法。一是测定蛋白质分子的自身荧光(内源荧光),另一种是当蛋白质本身不能发射荧光时,通过非共价吸附或共价作用向蛋白质分子的特殊部位引入外源荧光(也称荧光探针),然后测定外源荧光物质的荧光。  蛋白质的内源荧光 含有芳香族氨基酸(色氨酸(tryptophan ,Trp

蛋白质的内源性荧光与荧光探针

  利用荧光光谱法研究蛋白质一般有两种方法。一是测定蛋白质分子的自身荧光(内源荧光),另一种是当蛋白质本身不能发射荧光时,通过非共价吸附或共价作用向蛋白质分子的特殊部位引入外源荧光(也称荧光探针),然后测定外源荧光物质的荧光。   蛋白质的内源荧光  含有芳香族氨基酸(色氨酸(tryptophan

无定形相变蛋白质探针理性设计方案

   近日,中国科学院大连化学物理研究所研究员刘宇团队与朴海龙团队、山东大学教授刘晓静合作,通过系统性研究晶体诱导荧光分子结构与荧光之间的构效关系,实现了活细胞内无定型聚集态蛋白质组的靶向识别,为进一步发展此类探针提供了理性设计和改造方案。相关研究成果发表在《德国应用化学》上。 蛋白质的错误折叠

李峰团队发现蛋白质AIE纳米点光学探针制备方法

  2001年,香港科技大学教授唐本忠团队发现了一种与传统聚集淬灭相反的现象,称为聚集诱导发光(aggregation-induced emission, AIE)现象,其主要原理是由于分子内运动受到限制,导致非辐射衰减渠道被抑制,辐射衰变增强而发光。与传统的有机染料相比,AIE荧光材料具有抗光漂白

新型蛋白质分子探针-核酸适配体-治疗高度恶性肺腺癌

  肺癌是发病率与死亡率最高的恶性肿瘤,而肺腺癌是肺癌的主要病理亚型。以EGFR抑制剂为代表的靶向治疗及以PD1/PDL1靶向性抗体为代表的免疫治疗极大地改善了肺腺癌病人的生存预后。然而,肺腺癌中恶性程度最高、以细胞快速增殖为主要特征的PP(Proximal-Proliferative)分子亚型肺腺

李峰团队发展新型蛋白质AIE纳米点光学探针制备方法

  2001年,香港科技大学教授唐本忠团队发现了一种与传统聚集淬灭相反的现象,称为聚集诱导发光(aggregation-induced emission, AIE)现象,其主要原理是由于分子内运动受到限制,导致非辐射衰减渠道被抑制,辐射衰变增强而发光。与传统的有机染料相比,AIE荧光材料具有抗光漂白

探针台的高精度探针台

目前世界出货量第一的型号吸收了最新的工艺科技例如OTS,QPU和TTG相关技术,这种全新的高精度系统为下一代小型化的设计及多种测试条件提供保证。特性1:OTS-最近的位置对正系统(光学目标对准)  OTS通过对照相机相对位置的测量来保证其绝对位置的精度。这是非常引人注目的技术,来源于东京精密的度量技

基因探针基因探针的基本介绍

  基因探针基因探针(probe)就是一段与目的基因或DNA互补的特异核苷酸序列,它可以包括整个基因,也可以仅仅是/基因的一部分;可以是DNA本身,也可以是由之转录而来的RNA。  1.探针的来源 DNA探针根据其来源有3种:一种来自基因组中有关的基因本身,称为基因组探针(genomic probe

探针电流

探针电流           探针电流直接影响到束斑直径、图像信号强度、分辨率以及图像清晰及失真程度等参数,而这些参数间又存在矛盾。电流越大电子束的束斑直径越小,使分辨率增大,景深也增大。但是信号弱时,亮度有时会显得不足、信噪比降低。对于一些高分子材料、生物样品或一些不导电的样品采用较大的探针电流,

钙离子荧光探针:比值型荧光探针

前面我们介绍了荧光指示剂法可以将Ca2+检测的实验与其他技术结合使用,如可以与流式细胞仪、荧光分光光度计、或者荧光显微镜进行联合检测 。紫外光型主要包括Quin-2、Indo-1、Fura-2等,数量较少,可见光型数目较多,包括Fluo-3、钙黄绿素、Rhod-2等。荧光指示剂根据测光原理和数据

探针引物和探针有什么区别

如果你做的事荧光定量PCR,其引物和一般引物在构成上是没有什么区别的,只是要更加注意引物二聚体、PCR产物大小等问题。染料法不需要其他东西,探针法还需要taqman探针,这个探针的设计是比较有讲究的,并且上面有荧光集团和猝灭基团。具体设计,一般使用相关软件进行。

成探针克服

成探针克服,比如 Alexa Fluor 系列或 Cy 系列染料。这些专门设计的有机分子表现出很窄的发射光谱(与传统探针相比)、与弧光灯和激光线相匹配的较大的吸收系数、较高的量子产率、降低的光漂白,且荧光发射对环境变量的依赖性较低。此外,这些先进探针的激发光谱线横跨大约 400nm,从紫外到近红外

探针合成实验

实验材料基因试剂、试剂盒转录缓冲液DTTRNA酶抑制剂CTPATPGTPS-UTP乙酸铵乙酸铵乙醇仪器、耗材水浴锅离心机培养箱烘箱实验步骤1.  在一个含SP6、T3或T7启动子的载体中,插入目的基因。在编码序列下游酶切使质粒呈线性。DNA以酚/氯仿抽提,乙醇沉淀,70%乙醇洗后晾干。以无菌水重溶沉

探针合成实验

实验材料 基因试剂、试剂盒 转录缓冲液DTTRNA酶抑制剂CTPATPGTPS-UTP乙酸铵乙酸铵乙醇仪器、耗材 水浴锅离心机培养箱烘箱实验步骤 1.  在一个含SP6、T3或T7启动子的载体中,插入目的基因。在编码序列下游酶切使质粒呈线性。DNA以酚/氯仿抽提,乙醇沉淀,70%乙醇洗后晾干。以无菌

核酸探针标记

实验概要核酸探针根据核酸的性质,可分为DNA和RNA探针;根据是否使用放射性标记物与否,可分为放射性标记探针和非放射性标记探针;根据是否存在互补链,可分为单链和双链探针;根据放射性标记物掺入情况,可分为均匀标记和末端标记探针。实验原理分子生物研究中,最常用的探针即为双链DNA探针,它广泛应用于转基因

离子探针方法

离子探针方法是将质谱测定技术与离子发射显微镜技术相结合的现代仪器分析方法。能提供一般质谱分析所不能提供的试样微区质谱。由于它能对固体物质作微区、微量及深度成分分析,在某些条件下检测灵敏度可达ppb数量级,因此被广泛地应用于半导体、冶金、地质和生物研究等部门。其原理是利用聚焦的高能一次离子束轰击试样表

探针台分类

  探针台从操作上来区分有:手动,半自动,全自动  从功能上来区分有:温控探针台,真空探针台(超低温探针台),RF探针台,LCD平板探针台,霍尔效应探针台,表面电阻率探针台  经济手动型  根据客户需求定制  chuck尺寸:4"*4" 6"*6" 8"*8" 12"*12" (可选)  X-Y移动

探针合成实验

基本方案             实验材料 基因 试剂、试剂盒

Alexa-Fluor-探针

Alexa Fluor 探针之间的光谱叠加程度会随着探针发射峰之间的距离增加而下降,如 Figure2(b)所示。在这种情况下, Alexa Fluor 488 和深红色染料 Alexa Fluor 633 与 Figure2 (a)比较,重叠区域明显降低。这两种染料人眼都很容易区分,光谱重叠程度低

离子探针原理

离子探针(IMA)的基本原理是,用高能负氧离子轰击样品表面,测定被飞溅活化出来并发生电离的原子(即离子)的同位素组成,以获得年龄。为一种得到迅猛发展的新型质谱计,它具有许多其他测年方法所没有的优点:不需要化学处理;具有高的分辨率,可同时获得几组年龄以确定被测对象同位素体系是否封闭,有无铅丢失;可对样

什么是探针台,探针台的分类有哪些?

  探针台主要应用于半导体行业、光电行业、集成电路以及封装的测试。 广泛应用于复杂、高速器件的精密电气测量的研发,旨在确保质量及可靠性,并缩减研发时间和器件制造工艺的成本。  探针台分类  探针台从操作上来区分有:手动,半自动,全自动  从功能上来区分有:温控探针台,真空探针台(超低温探针台),RF

探针台如何工作?

  探针台可以固定晶圆或芯片,并精确定位待测物。手动探针台的使用者将探针臂和探针安装到操纵器中,并使用显微镜将探针尖端放置到待测物上的正确位置。一旦所有探针尖端都被设置在正确的位置,就可以对待测物进行测试。对于带有多个芯片的晶圆,使用者可以抬起压盘,压盘将探针头与芯片分开,然后将工作台移到下一个芯片

手动探针台用途

  探针台主要应用于半导体行业、光电行业、集成电路以及封装的测试。 广泛应用于复杂、高速器件的精密电气测量的研发,旨在确保质量及可靠性,并缩减研发时间和器件制造工艺的成本。手动探针台的主要用途是为半导体芯片的电参数测试提供一个测试平台,探针台可吸附多种规格芯片,并提供多个可调测试针以及探针座,配合测

RNA探针的概念

RNA探针是一类很有前途的核酸探针,由于RNA是单链分子,所以它与靶序列的杂交反应效率极高。早期采用的RNA探针是细胞mRNA探针和病毒RNA探针,这些RNA是在细胞基因转录或病毒复制过程中得到标记的,标记效率往往不高,且受到多种因素的制约。

高精度探针台

  目前世界出货量第一的型号吸收了最新的工艺科技例如OTS,QPU和TTG相关技术,这种全新的高精度系统为下一代小型化的设计及多种测试条件提供保证。  特性1:OTS-最近的位置对正系统(光学目标对准)  OTS通过对照相机相对位置的测量来保证其绝对位置的精度。这是非常引人注目的技术,来源于东京精密

探针台如何工作

探针台可以固定晶圆或芯片,并精确定位待测物。手动探针台的使用者将探针臂和探针安装到操纵器中,并使用显微镜将探针尖端放置到待测物上的正确位置。一旦所有探针尖端都被设置在正确的位置,就可以对待测物进行测试。对于带有多个芯片的晶圆,使用者可以抬起压盘,压盘将探针头与芯片分开,然后将工作台移到下一个芯片上,

低温探针台用途

高低温真空探针台可以对器件进行非破坏性的测试。可以对材料或器件的电学特性测量、光电特性测量、参数测量、highZ测量、DC测量、RF测量和微波特性测量提供一个测试平台。优测国芯的高低温真空探台该设备已经成为测量纳米电子材料(碳纳米管、晶体管、单个电子晶体管、分子电子材料、纳米线),量子线、点、量子隧

无形“探针”,“洞见”人体

  更精准地实现人体器官和病灶部位无损害可视化,一直是人们追求的目标。  5月10日,在复旦大学庆祝建校118周年系列学术报告中,复旦大学化学系教授、上海市生物医学检测试剂工程中心主任张凡以《透视人体健康的新技术——近红外光化学探针用于生物医学诊断》为题,分享了自己深耕多年的近红外荧光分子“探针”研