遗传发育所揭示水稻RNA识别结构域蛋白抑制外源基因沉默的机制
植物是复杂的生物系统。植物体内基因的表达受到多种水平的调控，如转录水平、转录后水平、DNA甲基化/去甲基化等，从而对基因表达进行精密高效的调控。中国科学院遗传与发育生物学研究所张劲松研究组筛选OsEIN2过表达材料的抑制子，鉴定到一个包含RNA识别结构域（RRM）的蛋白SOE。SOE可以与剪接复合体组分互作，并结合到DNA去甲基化酶基因DNG701 mRNA上促进其剪接和稳定，从而维持DNG701介导的启动子去甲基化与转基因表达。基于水稻三千份测序数据的分析发现，SOE基因启动子及编码区的核苷酸多态性可分为7个单倍型，且Hap 1单倍型与粒重显著正相关。此外，研究发现SOE基因突变能够使水稻籽粒增大并提高单株产量。这一研究揭示了基因表达调控新机制，并为促进水稻和其他作物产量提升提供了优异的候选等位基因。3月20日，相关研究成果在线发表在《新植物学家》（New Phytologist，DOI：10.1111/nph.19686）上......阅读全文
DNA分析系统：基因甲基化研究的最佳工具
甲基化研究对于基因的 调控和肿瘤的发生有非常密切的关系。在一般正常的细胞中，基因调控区CpG岛处于非甲基化的状态。而当细胞发生癌变后，这些CG区域往往呈现甲基化状态。英国医学刊物《the Lancet》报道奥地利因斯布鲁克医学院的专家们早就可以通过检测大便中DNA的甲基化变化，把健康人的大便
类转录化学药物诱导型基因组编辑和转录激活系统
生物学变化多受到高度动态的分子事件调控，为了更精确的理解并研究这些过程，应用条件性可诱导的技术手段是十分必要的。此前，得到广泛应用的药物诱导技术之一是通过配体结合激发雌激素受体蛋白（ER）从细胞质到细胞核的转运。在没有激素配体的情况下，ER与热激蛋白（hsp90）结合定位于细胞质中；一旦与配体结
基因组所等RNA甲基化表观转录组学研究获进展
2014年1月，中国科学院北京基因组研究所基因组变异与精准生物医学实验室“百人计划”研究员杨运桂研究组，与中国科学院动物研究所“百人计划”研究员刘峰研究组合作开展的“m6A甲基转移酶复合物鉴定”研究，发现了WTAP(wilms'tumour 1-associating protein)
Pyrosequencing－DNA分析系统：基因甲基化研究的最佳工具
甲基化研究对于基因的调控和肿瘤的发生有非常密切的关系。在一般正常的细胞中，基因调控区CpG岛处于非甲基化的状态。而当细胞发生癌变后，这些CG区域往往呈现甲基化状态。英国医学刊物《the Lancet》报道奥地利因斯布鲁克医学院的专家们早就可以通过检测大便中DNA的甲基化变化，把健康人的大便与结肠癌患
基因转录后调控方式
真核生物的RNA被翻译之前需要通过核孔输出，因此核输出对基因表达有着显著影响。所有进出细胞核的mRNA的运输都是通过核孔进行的，受到各种输入蛋白和输出蛋白的控制。携带遗传密码的mRNA需要存活足够长的时间才能被翻译，因为mRNA在翻译之前必须经过很长距离的运输。在典型的细胞中，RNA分子仅在特异性保
基因转录调控的途径
可分为三种主要途径：1）遗传调控（转录因子与靶标基因的直接相互作用）；2）调控转录因子与转录机制相互作用，3）表观遗传调控（影响转录的DNA结构的非序列变化）。
揭露CG甲基化的遗传性和相互作用
将表观遗传标记（例如DNA甲基化）靶向特定位点的能力在基础研究和作物植物工程中都很重要。但是，靶向DNA甲基化的遗传性，其如何影响基因表达以及正确建立所需的表观遗传特征尚不清楚。 2021年5月25日，浙江大学刘琬璐及加利福尼亚大学洛杉矶分校Steven E. Jacobsen共同通讯在Nat
真核生物RNA的转录与原核生物RNA的转录的区别
真核生物RNA的转录与原核生物RNA的转录过程在总体上基本相同，但是，其过程要复杂得多，主要有以下几点不同： 1、真核生物RNA的转录有的是在细胞核内进行的，而蛋白质的合成则是在细胞质内进行的。且真核生物线粒体和叶绿体的遗传信息系统被称为真核细胞的第二遗传信息系统，或核外基因及其表达体系。这是
研究发现TNFα会刺激炎症基因响应，诱发DNA主动去甲基化
近期，中国科学院生物物理研究所生物大分子国家重点实验室研究员朱冰课题组在eLife上，在线发表题为Sustained TNF-α stimulation leads to transcriptional memory that greatly enhances signal sensitivit
真核生物的转录终止
真核生物的转录终止，是和这类转录后修饰密切相关的。真核mRNA3’端在转录后发生修饰，加上多聚腺苷酸(polyA)的尾巴结构。大多数真核生物基因末端有一段AATAAA共同序列，再下游还有一段富含GT序列，这些序列称为转录终止的修饰点。真核RNA转录终止点在越过修饰点延伸很长序列之后，在特异的内切核酸
什么是转录依赖的扩增系统？
转录依赖的扩增系统(Transcript-basedamplification system，TAS)，是Kwen等人于1989年研究报道的，主要用于扩增RNA.合成A、B引物，引物A的3‘末端与待扩增RNA互补，其5’端有T7RNA多聚酶的启动子信息.逆转录酶以A引物为起点合成cDNA;引物B与此
中国学者发表RNA甲基化重要成果
基因组DNA和组蛋白上存在可逆的表观遗传学修饰，这些修饰可以调控基因的表达，由此决定细胞的状态，影响细胞的分化和发育。近年来人们发现，mRNA和其他RNA也存在类似的表观遗传学调控，比如m6A（N6-methyladenosine）。 西北农林科技大学、中科院上海植物逆境生物学研究中心和美国普
中国学者发表RNA甲基化重要成果
基因组DNA和组蛋白上存在可逆的表观遗传学修饰，这些修饰可以调控基因的表达，由此决定细胞的状态，影响细胞的分化和发育。近年来人们发现，mRNA和其他RNA也存在类似的表观遗传学调控，比如m6A（N6-methyladenosine）。 西北农林科技大学、中科院上海植物逆境生物学研究中心和美国普
基因表达的转录机制介绍
转录过程由RNA聚合酶（RNAP）进行,以DNA为模板,产物为RNA。RNA聚合酶沿着一段DNA移动,留下新合成的RNA链。 基因组DNA由两条反向平行和反向互补链组成,每条链具有5'和3'末端。这两条链分别称为“模板链”（产生RNA转录物的模板）和“编码链”（含有转录本序列的
关于基因转录的基本介绍
基因转录是在细胞核和细胞质内进行的。它是指以DNA的一条链为模板，按照碱基互补配对原则，在RNA聚合酶作用下合成RNA的过程。基因转录有正调控和负调控之分。 如细菌基因的负调控机制是当一种阻遏蛋白(repressor protein)结合在受调控的基因上时，基因不表达；而从靶基因上去除阻遏蛋白
基因转录因子的相关介绍
转录因子(transcription factor)是起调控作用的反式作用因子。转录因子是转录起始过程中RNA聚合酶所需的辅助因子。真核生物基因在无转录因子时处于不表达状态，RNA聚合酶自身无法启动基因转录，只有当转录因子(蛋白质)结合在其识别的DNA序列上后，基因才开始表达。转录因子的结合位点
真核生物RNA的转录与原核生物RNA的转录过程差异
⒈ 真核生物RNA的转录有的是在细胞核内进行的，而蛋白质的合成则是在细胞质内进行的。且真核生物线粒体和叶绿体的遗传信息系统被称为真核细胞的第二遗传信息系统，或核外基因及其表达体系。这是因为研究发现，线粒体和叶绿体中除有DNA外，还有RNA（mRNA、tRNA、 RNA）、核糖体、氨基酸活化酶等。说明
m5C－RNA修饰表达谱文章教您如何另辟蹊径快速发文
文章导读随着RNA修饰在生物领域的持续火热，关于m6A修饰的研究已经广 泛开展并发表，至今已觉不新鲜；5-甲基胞嘧啶RNA甲基化（m5C）是一类新的修饰方式，参与调控细胞应激、发育和基因表达等方面，目前m5C研究正处 方兴未艾之际，大量的科学研究工作也亟待开展，非常适合有探索性和新颖性需求的老师。这
云序生物独家首发m5C－RNA甲基化测序
m5C RNA甲基化简介 通过分析近几年的国自然立项，可以发现RNA甲基化这两年的基金项目呈指数级增长的趋势：特别是从2015年的5项到2017年的25项，项目增长尤为显著。仅2018年1月的RNA甲基化文献就达到25篇，可以说RNA甲基化的发展已经到了井喷阶段，多篇文章荣登CNS级别期刊
研究揭示水稻RNA识别结构域蛋白抑制外源基因沉默的机制
植物是复杂的生物系统。植物体内基因的表达受到多种水平的调控，如转录水平、转录后水平、DNA甲基化/去甲基化等，从而对基因表达进行精密高效的调控。 中国科学院遗传与发育生物学研究所张劲松研究组筛选OsEIN2过表达材料的抑制子，鉴定到一个包含RNA识别结构域（RRM）的蛋白SOE。SOE可以与剪
Cancer－Cell首次揭示lncRNA在20种癌症中的DNA甲基化改变图谱
近日，匹兹堡大学杨达课题组在Cancer Cell杂志上发表了最新研究论文，系统地揭示了20种癌症中长非编码RNA（lncRNA）的DNA甲基化改变图谱。 image.png 论文题为“lncRNA Epigenetic landscape analysis identifies E
外源基因在真核细胞中的表达系统
1. 真核生物表达的优越性和必要性① 真核生物具有转录后加工系统，可识别并删除基因中的内含子，剪切加工为成熟mRNA.②具备完善的翻译后加工系统，可进行糖基化、乙酰化等修饰，使蛋白形成正确的天然构型，因而真核生物表达系统产生的蛋白更接近天然状态，有利于其功能、生物活性的研究。③某些真核细胞可将基因表
m5C－RNA甲基化测序介绍
m5C RNA甲基化简介通过分析近几年的国自然立项，可以发现RNA甲基化这两年的基金项目呈指数级增长的趋势：特别是从2015年的5项到2017年的25项，项目增长尤为显著。仅2018年1月的RNA甲基化文献就达到25篇，可以说RNA甲基化的发展已经到了井喷阶段，多篇文章荣登CNS级别期刊。RNA甲基
dna甲基化抑制剂－aza和dec的区别
DNA甲基化在诸如胚胎发育、基因转录、染色质的结构和稳定性、X染色体的失活、基因组印记、细胞的癌变和衰老等生物过程中起到关键作用。DNA甲基化模式和水平取决于DNA甲基转移酶和去甲基化酶的作用。DNA去甲基化包括DNA主动去甲基化和被动去甲基化。其中,DNA去甲基化酶在DNA主动去甲基化中起关键作用
真核生物RNA的转录与原核生物RNA的转录过程的区别
⒈ 真核生物RNA的转录有的是在细胞核内进行的,而蛋白质的合成则是在细胞质内进行的。且真核生物线粒体和叶绿体的遗传信息系统被称为真核细胞的第二遗传信息系统,或核外基因及其表达体系。这是因为研究发现,线粒体和叶绿体中除有DNA外,还有RNA(mRNA、tRNA、 RNA)、核糖体、氨基酸活化酶等。说明
克隆基因的表达（expression－of－cloned－gene）3
（3）原核生物的基因组基本上是单倍体，而真核基因组是二倍体。（4）如前所述，细菌多数基因按功能相关成串排列，组成操纵元的基因表达调控的单元，共同开启或关闭，转录出多顺反子(polycistron)的mRNA；真核生物则是一个结构基因转录生成一条mRNA，即mRNA是单顺反子(monocistron)
云序生物独家首发m5C－RNA甲基化测序
m5C RNA甲基化简介 通过分析近几年的国自然立项，可以发现RNA甲基化这两年的基金项目呈指数级增长的趋势：特别是从2015年的5项到2017年的25项，项目增长尤为显著。仅2018年1月的RNA甲基化文献就达到25篇，可以说RNA甲基化的发展已经到了井喷阶段，多篇文章荣登CNS级别期刊
云序生物为你解密ATACseq研究方案
ATAC-seq最近几年是比较火的一种测序技术。那ATAC-seq技术到底什么呢？ATAC-seq的全称是Assay for Transposase Accessible Chromatin using sequencing, 运用测序手段研究转座酶可接近的染色质的一种技术。该技术通过转座酶对某
生化与细胞所揭示组蛋白H3K4甲基化抑制转录的新机制
真核生物染色质的组蛋白末端会发生多种的化学修饰（包括乙酰化和甲基化修饰等），这是真核生物细胞随环境变化而改变基因表达谱式的重要调控方式。之前的研究发现，组蛋白H3K4甲基化分布于基因的启动子区，对基因转录主要起正调控作用。然而，有研究表明H3K4甲基化对某些基因表达起到抑制作用，其
Cell：染色体水平油松基因组组装和甲基化研究取得进展
近期，北京林业大学生物科学与技术学院联合安诺优达在国际知名期刊Cell（IF：41.582）在线发表了题为“The Chinese pine genome and methylome unveil key features of conifer evolution”的研究文章，研究者对油松进行了