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基因组所成功开发整合网络工具iBIG

近日,中科院北京基因组研究所基因组科学与信息重点实验室“百人计划”研究员雷红星,带领其团队成功开发网页版整合网络工具——iBIG (integrative BIoloGy),该研究成果iBIG: An Integrative Network Tool for Supporting Human Disease Mechanism Studies发表在Genomics, Proteomics & Bioinformatics (GPB)2013年第3期Gene Regulatory Networks(GRN,基因调控网络)专刊上。该工具整合了多种基因相互作用和调控信息,生成的基因网络可以进行各类信息注释并在线直接完成可视化,这种网页版的可视化方式为网络的完善提供了极大的方便。 此外,该工具还提供了一个附件R软件包ArrayPro。利用该软件包中提供的一系列函数可以对微阵列数据进行预处理;可以寻找差异......阅读全文

基因组所成功开发整合网络工具iBIG

  近日,中科院北京基因组研究所基因组科学与信息重点实验室“百人计划”研究员雷红星,带领其团队成功开发网页版整合网络工具——iBIG (integrative BIoloGy),该研究成果iBIG: An Integrative Network Tool for Supporting Hum

基因组所完成开发RiceWiki数据库

  近日,中国科学院北京基因组研究所章张研究员课题组与北京理工大学、中国林业科学研究院及华中农业大学合作开发完成RiceWiki数据库。该数据库是基于维基百科的水稻基因信息平台,是可编辑且内容公开的公众注释系统。研究成果在Nucleic Acids Research杂志发表。   水稻是人类重

天津工生所等基因组数据整合研究获系列进展

  随着人类基因组计划(Human genome project, HGP)和高通量生物芯片技术的成功研发,人们广泛利用高通量全基因组生物芯片的技术手段,采用全基因组关联研究(Genome-Wide Association Studies, GWAS)的方法筛选复杂疾病易感多态(Single Nuc

成功整合称重数据

高效传输称重数据可提高制造过程的透明度,但是找到和实施最有效的方法却是一道难题。 了解确定称重过程时应当考虑的因素。 下载《称重数据整合》白皮书 下载《质量源于设计》白皮书 这个信息对您有帮助吗?

成功整合称重数据

高效传输称重数据可提高制造过程的透明度,但是找到和实施最有效的方法却是一道难题。 了解确定称重过程时应当考虑的因素。下载《称重数据整合》白皮书下载《质量源于设计》白皮书

遗传发育所开发完成植物小分子RNA整合分析软件psRobot

  植物小分子RNA主要包括microRNA和小干扰RNA,在基因的转录和转录后调控过程中具有重要作用。第二代测序技术的逐渐成熟和广泛应用极大地推动了小分子RNA相关研究的发展,对不同组织和材料中的小分子RNA进行深度测序已成为研究小分子RNA的常规手段。因此,针对这些数据的生物信息学分析成为了研究

遗传发育所开发水稻分子育种整合组学知识库

  10月18日,中国科学院遗传与发育生物学研究所植物基因组学国家重点实验室梁承志研究组开发的分子育种整合组学知识库水稻子库在线发表于学术期刊《核酸研究》(Nucleic Acids Research)。文章题目为MBKbase for rice: an integrated omics knowl

昆明植物所等首次成功破译茶树基因组

  茶是世界上最为古老也是最为广泛饮用的含咖啡因软饮料,目前全球160多个国家的30亿人喝茶爱茶。普遍认为,茶树起源于中国的云南、四川等地;作为传播中国文化的使者,在茶从中国起身向世界各地传播的数千年的漫长历程里,与全球100多个国家多元的文化邂逅交融,发展形成了地球上复杂而美妙的茶文化。除了因为迷

天津工业生物所通过信息整合获得更可靠的基因组注释

  不同来源的数据信息的比较整合是提高数据质量,获得对特定生物更准确认识进而进行设计改造的常用方法。目前已有多种基于web的基因组注释服务(如RAST, JCVI, IMG, IGS等),通过这些服务提交序列信息即可得到基因注释结果,但不同服务得到的结果往往有较大不同,因此对不同来源的基因注

北京基因组所开发系列特色科学数据库

  近日,中国科学院北京基因组研究所生命与健康大数据中心(BIG Data Center,BIGD)有七篇数据库文章在国际学术期刊《核酸研究》(Nucleic Acids Research)杂志在线发表,并将于该刊2019年1月出版的数据库专刊中集中刊发。包括表观组关联分析知识库EWAS Atlas