Nature子刊发布单细胞转录组开创性研究成果
来自苏黎世大学的生物学家们开发出了一种可在单细胞中显像基因活性的新方法。这种方法如此的高效,从而使得研究人员第一次在1万个人类单细胞中平行研究了 1000种基因,揭示出基因的活性和生成的转录分子的空间结构在单细胞之间存在显著差异。这一新方法可广泛应用于基础研究和医学诊断等领域。 当细胞激活一种基因时,它们会生成特异性的基因转录分子,从而使得细胞能够利用这一基因的功能。检测基因活性是医疗诊断,尤其是癌症医学中的一种常规程序。当前的技术是通过检测转录分子的数量来确定基因的活性。但这些技术既不能在1万个单细胞中测量1千个基因的转录分子量,也不能确定转录分子在单细胞中的空间结构。在Lucas Pelkmans教授的领导下,苏黎世大学的生物学家们开发出了这一全自动化的程序,第一次在1万个单细胞中平行测量了单个转录分子的数量和空间结构。研究结果发表在近期的科学杂志《自然方法》(Nature Methods)上,提供了关......阅读全文
酶的空间结构
空间结构它们通过多肽链的盘曲折叠,组成一个在酶分子表面、具有三维空间结构的孔穴或裂隙,以容纳进入的底物与之结合并催化底物转变为产物,这个区域即称为酶的活性中心。不过酶的活性中心(active center)只是酶分子中的很小部分。酶催化反应的特异性实际上决定于酶活性中心的结合基团、催化基团及其空间结
Nature子刊发布单细胞转录组开创性研究成果
来自苏黎世大学的生物学家们开发出了一种可在单细胞中显像基因活性的新方法。这种方法如此的高效,从而使得研究人员第一次在1万个人类单细胞中平行研究了 1000种基因,揭示出基因的活性和生成的转录分子的空间结构在单细胞之间存在显著差异。这一新方法可广泛应用于基础研究和医学诊断等领域。 当细胞
酶的空间结构特点
它们通过多肽链的盘曲折叠,组成一个在酶分子表面、具有三维空间结构的孔穴或裂隙,以容纳进入的底物与之结合并催化底物转变为产物,这个区域即称为酶的活性中心。不过酶的活性中心(active center)只是酶分子中的很小部分。酶催化反应的特异性实际上决定于酶活性中心的结合基团、催化基团及其空间结构。而酶
离子晶体的空间结构
对称性1) 旋转和对称轴 n重轴, 360度旋转, 可以重复n次。2) 反映和对称面:晶体中可以找到对称面。3) 反演和对称中心:晶体中可以找到对称中心。晶胞晶胞是晶体的代表, 是晶体中的最小单位, 晶胞可以无隙并置起来, 得到晶体. 晶胞的代表性体现在以下两个方面:一是代表晶体的化学组成;二是代表
肽键的空间结构特征
多肽分子中构成多肽链的基本化学键是肽键,肽键与相邻的两个碳原子所组成的基团(—C—CO—NH—C—)称为肽单元。肽链就是由许多肽单元连接而成的,它们构成多肽链的主链骨架。通过对一些简单的肽和蛋白质肽键的X射线晶体衍射法分析,证明肽单元的空间结构具有以下3个显著的特征:1. 肽单元是平面结构。组成肽单
肽单元的空间结构的特征
1. 肽单元是平面结构。组成肽单元的6个原子位于同一平面内,形成一个肽键的平面结构,称为肽键平面。 2. 肽键具有局部双键性质,不能自由旋转。肽键中的C一N键长为0.132nm,比相邻的C一N单键(0.147nm)短,而较一般的C=N(0.127nm)长,介于两者之间。这表明羰基的x电子发生离域现象
土壤养分速测仪进行空间结构的分析
为筛选出与油茶产量、质量相关的土壤养分指标,将油茶土壤15个养分指标与油茶仁含油率、棕榈酸、硬脂酸、油酸、亚油酸、亩鲜果重6个品质指标进行相关分析,根据土壤养分速测仪相关性结果筛选出对油茶品质较敏感的养分指标作为评价指标。 通过土壤养分速测仪的相关仪器应用对广西油茶林地土壤养分指标进行了系统研究,结
关于芋螺毒素的空间结构介绍
芋螺毒素(Cys残基排列方式-C-C-CC-C-C-)肽链由24~31个氨基酸组成,分别含有3对二硫键成4-Loop框架。Marian Price-Carter等研究了ω-芋螺毒素MVIIA中二硫键对该毒素的稳定性和肽段折叠的影响,发现每个二硫键均对毒素的稳定构象有重要贡献,缺少任何一个二硫键都
关于离子晶体的空间结构的介绍
一、对称性 1) 旋转和对称轴 n重轴, 360度旋转, 可以重复n次。 2) 反映和对称面:晶体中可以找到对称面。 3) 反演和对称中心:晶体中可以找到对称中心。 二、晶胞 晶胞是晶体的代表, 是晶体中的最小单位, 晶胞可以无隙并置起来, 得到晶体. 晶胞的代表性体现在以下两个方面:
蛋白质的空间结构包括哪些
蛋白质是一种生物大分子,基本上是由20种氨基酸以肽键连接成肽链。肽键连接成肽链称为蛋白质的一级结构。不同蛋白质其肽链的长度不同,肽链中不同氨基酸的组成和排列顺序也各不相同。肽链在空间卷曲折叠成为特定的三维空间结构,包括二级结构和三级结构二个主要层次。有的蛋白质由多条肽链组成,每条肽链称为亚基,亚基之
次氯酸的空间结构是怎样的?
HClO中,氧的电负性最大,所以氧是中心原子。次氯酸的价层电子对数为(6+2)/2=4。所以次氯酸的VSEPR模型是四面体型,氧是sp³杂化。次氯酸中有2个σ键,有2对成键电子对,所以有2对孤电子对。所以次氯酸的分子构型为V型。
马克俭:克勤克俭,开拓新空间结构
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/5/500508.shtm 马克俭,我国著名结构工程专家,2007年当选中国工程院院士。 1954年考入中南土木建筑学院(现湖南大学)营造建筑系工业与民用建筑专业。1958年被分配到贵州工学院土建系任教
新显微镜可追踪胚胎发育单细胞分裂过程
从一个受精卵发育成多种功能的胚胎,细胞要经过上千次分裂和复杂的排列重组。据物理学家组织网6月3日报道,霍华德·休斯医学研究院珍妮莉娅法姆研究学院开发出一种最新的成像技术,能以前所未有的速度和精确度看到这一过程,让人们能追踪胚胎成形时每个细胞在几天甚至几小时内的变化。相关
单细胞分离用于单细胞基因扩增
单细胞分离连接不同管径大小的毛细玻璃针,可分离捕获各种非贴壁状态的单细胞和微粒等,如细菌、酵母、藻类细胞、植物花粉、原生动物单细胞、悬浮细胞、血液细胞、免疫细胞、卵细胞、各种悬液中单细胞及特殊标记的单细胞等。 单细胞分离用于各种类型的细胞分离培养、纯化、检测;获得单克隆细胞;用于单细胞基因扩增,
简述丝裂原活化蛋白激酶的空间结构
1、大体结构: p38与ERK2具有约40%序列同源性。将p38和ERK2的两个结构域同时重叠在一起时,其根均平方(root mean square ,RMS)偏离为0.17nm。JNK与ERK2和p38的同源性分别为40%和51%,其总体结构也与ERK2和p38非常相似。将ERK2和p38的
双光子显微镜活体单细胞成像揭示生物钟发育过程
3月14日,PLOS Biology 期刊在线发表了题为《斑马鱼生物钟的活体单细胞成像》的研究论文。该研究由中国科学院脑科学与智能技术卓越创新中心(神经科学研究所)、上海脑科学与类脑研究中心、神经科学国家重点实验室严军研究组、何杰研究组与安徽医科大学附属第一医院教授李元海合作完成。该研究成功构建
Namocell单细胞分离仪应用——单细胞测序
2018年11月,Namocell与CZ-Biohub(Chan Zuckerburg Biohub)合作,在单细胞测序领域做出了新的尝试。CZ-Biohub利用Namocell单细胞分离仪分选出目的B细胞,并且将其进行单细胞测序,为抗体新药的发现迈出了重要一步。单细胞RNA测序(scRNA-s
CloneSelect 单细胞分离系统 OR 传统单细胞克隆方法
CloneSelect™ Single-Cell Printer™ f.sight™ ( f.sight )被开发用于满足这些需求, 它可以柔和地接种单个细胞至微孔,同时记录整个细胞接种过程,提供单克隆性的图像证据以及优异的接种后细胞生长用于细胞株开发在这个研究中,我们开展了六组实验,用无血清培养基
肝脏生物学中单细胞和空间组学技术的成果与挑战
近期,中国科学院上海营养与健康研究所李虹研究组在《肝脏病学杂志》(Journal of Hepatology)上,发表了题为Single-cell and spatially resolved transcriptomics for liver biology的综述文章。该文章阐述了前沿的单细胞
单细胞和空间组学技术在肝脏领域应用
近期,中国科学院上海营养与健康研究所李虹研究组在《肝脏病学杂志》(Journal of Hepatology)上,发表了题为Single-cell and spatially resolved transcriptomics for liver biology的综述文章。该文章阐述了前沿的单细胞
兔朊病毒蛋白的空间结构和动力学特征
上海药物所再发论文阐述兔朊病毒蛋白的空间结构和动力学特征 中科院上海药物研究所林东海课题组博士生文祎等近年来用多维NMR技术研究兔朊病毒蛋白PrPC(91-228)及其S173N,I214V等点突变体蛋白的溶液结构和动力学,不久前在J. Biol. Chem. (2010,
Namocell单细胞分离仪应用介绍——藻类单细胞分离
Namocell单细胞分离仪最新应用:随着人们对环境研究的不断深入,研究人员逐渐将目光转向藻类的单细胞层面:有些需要对藻类进行单细胞级别的分析(如藻类单细胞测序等),也有需要对单细胞藻类进行培养。这样就面临一个棘手的问题,那就是如何获取藻类的单个细胞。通常实验室里的方式,是在显微镜下用毛细管吸取。这
单细胞凝胶电泳法检测单细胞DNA损伤
单细胞凝胶电泳(single-cell gel eiectrophoresis,SCGE)又称慧星试验(comet assay)是一项较新的电泳方法。自1978年被Rydcbert B.等人成功地用于检验DNA单链断裂以来,经过不断的改进,已成为一种快速、灵敏、简便的检测DNA损伤的方法,广泛地应用
单细胞和空间组学技术在肝脏领域的应用
近期,中国科学院上海营养与健康研究所李虹研究组在《肝脏病学杂志》(Journal of Hepatology)上,发表了题为Single-cell and spatially resolved transcriptomics for liver biology的综述文章。该文章阐述了前沿的单细胞
什么是单细胞
单细胞生物 生物可以根据构成的细胞数目分为单细胞生物(Protozoa)和多细胞生物(Metazoa)。单细胞生物只由单个细胞组成,个体微小,用肉眼很难看的见,大多数单细胞生物生活在水域环境中,有些寄生在我们身上。单细胞生物靠分裂繁殖(酵母菌在适宜的环境下出芽繁殖)单细胞生物包括所有古细菌和真细菌和
单细胞分离技术
单细胞测序日趋火爆的原因很大程度上得益于单细胞分离技术的不断完善。这一讲,我们将跟大家一起回顾传统的单细胞分离技术,并重点介绍单细胞分离技术的新宠微孔芯片技术及微流控技术。图1为目前常见单细胞分离设备。图1:目前常见单细胞分离设备传统单细胞分离技术相信许多实验人员,都见过下面我们要介绍的传统的单细胞
单细胞是什么
单细胞既可以指单细胞生物,比如细菌等,也可以指从多细胞生命体分离的单个细胞,比如实验室培养的人体细胞等。此外,受精卵也是单细胞,属于可以发育成完整生命体的全能干细胞。
单细胞分离对单细胞测序领域有着很大的帮助
单细胞分离可以采用特制的毛细管在载玻片的琼脂涂层上选取单孢子并切割下来,然后移到合适的培养基进行培养,分离法对操作技术有比较高的要求,多限于高度专业化的科学研究中采用。 它不仅仅可以用于分离单细胞,还可以用于nl级别试剂的分配和磁珠的分选,对于单细胞测序领域有着很大的帮助。快速高效接种单个活细胞
Namocell单细胞分离仪在单细胞测序领域的应用
9月26至27日2019年细胞产业大会暨2019第四届(上海)细胞与肿瘤医疗高峰论坛在上海新南雅酒店举行。本届会议,邀请了全国30位专家学者、人物演讲、40家企业参展,400余人报名参会,逾500人参加了会议,就细胞储存、细胞治疗、细胞培养、细胞工程、细胞银行、细胞能量与代谢、细胞免疫学、细胞生理学
蛋白质三级机构(空间结构)预测-从头预测法
H-P模型是基于三种简化的,即蛋白质中各个氨基酸残基的α碳原子都位于二维网格或三维网格的格点上,疏水作用是蛋白折叠中唯一的重要因素,同时通过计算疏水残基接触的数目代替构象的能量计算。虽然这样的处理非常简单,但是,通过H-P模型的计算分析,能够发现蛋白质折叠的一些机制。如果在蛋白质模型中取消氨基酸定位