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张建之教授PNAS解析RNA编辑

如果一些编码位点的RNA编辑受损,就会引起严重的疾病。因此,一些人认为编码性RNA编辑是对人体有利的。 近年来的基因组研究显示,人类基因组中有超过一千个编码位点受到了RNA水平上的A(adenosine)-to-I(Inosine)编辑。许多这样的RNA编辑事件属于非同义替换。 现在,科学家们在1,783个发生了上述RNA编辑的人类编码位点中,分析了编辑事件的频率和水平。他们指出,人类的编码性RNA编辑一般是非适应性的。该文章于二月二十四日提前发表在美国国家科学院院刊PNAS杂志的网站上。 领导这项研究的是美国密歇根大学著名华人学者张建之教授。张建之教授早年毕业于复旦大学。1998年美国宾西法尼亚州立大学遗传学博士毕业,师从著名的分子进化学家根井正利(Masatoshi Nei),现为美国密歇根大学生态学进化生物学系教授,是基因重复、适应进化等研究领域国际著名学者。 研究人员发现,随着编码位点重要......阅读全文

进化分析揭示编码区和非编码区RNA编辑的功能调控效应

  2017年3月,国际知名学术期刊PLOS Genetics在线发表了斯坦福大学Jin Billy Li课题组和中山大学生命科学学院张锐课题组共同研究的题为“Evolutionary analysis reveals regulatory and functional landscape of c

基因编辑成进化发育生物学领域“杀手级”技术

提塔利克鱼模型与化石,该过渡期化石有助于解释鱼类如何开始长出四肢。图片来源:Field Museum Library/Getty Images从1893年至今,几乎在每年的夏季,年轻的发育和进化生物学者都会涌向美国马萨诸塞州伍兹霍尔,钻研业内的技术。在该校全球有名的海洋生物学实验室中,参与其年度胚胎

张建之教授PNAS解析RNA编辑

  如果一些编码位点的RNA编辑受损,就会引起严重的疾病。因此,一些人认为编码性RNA编辑是对人体有利的。   近年来的基因组研究显示,人类基因组中有超过一千个编码位点受到了RNA水平上的A(adenosine)-to-I(Inosine)编辑。许多这样的RNA编辑事件属于非同义替换。   现在

上海生科院等揭示RNA编辑表观遗传位点的系统进化规律

  7月28日,PLOS Genetics 杂志发表了中国科学院上海生命科学研究院植物生理生态研究所李轩研究组题为The landscape of A-to-I RNA editome is shaped by both positive and purifying selection 的研究论文。

上海生科院等揭示RNA编辑表观遗传位点的系统进化规律

  7月28日,PLOS Genetics 杂志发表了中国科学院上海生命科学研究院植物生理生态研究所李轩研究组题为The landscape of A-to-I RNA editome is shaped by both positive and purifying selection 的研究论文。

章鱼藐视遗传“中心法则”-头足类动物RNA编辑程度令人吃惊

  章鱼、鱿鱼和乌贼经常并不严格地遵循其DNA中的遗传指令,相反,它们利用酶清除RNA中的特定碱基A(腺苷),并且利用一种不同的碱基I(肌苷)替代它们。大多数动物很少使用这种被称作RNA编辑的过程重新编码蛋白,但章鱼等头足类动物在超过半数的转录基因中编辑RNA。在一项新研究中,当研究人员定量和描述头

高效双碱基编辑器研发成功并在水稻中实现基因定向进化

  近日,中国农业科学院作物科学研究所作物精准育种技术创新团队成功开发了一种高效、编辑范围更广的胞嘧啶和腺嘌呤双碱基编辑融合系统,利用该系统对水稻内源基因编码区进行改造,获得了高抗草甘膦的水稻新型基因资源。相关研究成果在线发表在《植物学报(Journal of Integrative Plant B

遗传发育所利用非编码RNA揭示小麦多倍体形成与进化机制

  普通小麦是异源六倍体,染色体组分别为A组(来自乌拉尔图小麦)、D组(来自粗山羊草)和B组(未确定但可能来自与S组相关的山羊草)。普通小麦形成经历两次杂交和两次染色体组加倍过程。在这个过程中,染色体组加倍伴随基因组冲击而发生修饰或重组等。  中国科学院遗传与发育生物学研究所韩方普研究组长期从事小麦

中科院PLOS发表RNA编辑新成果

  7月28日,来自中科院上海生命科学研究院植物生理生态研究所李轩研究组、上海巴斯德研究所郝沛研究组以及密歇根州立大学王红兵教授,在国际著名遗传学期刊《PLOS Genetics》发表一项合作研究,题为“The Landscape of A-to-I RNA Editome Is Shaped by

平行进化和趋同进化差异分析

平行进化和趋同进化有些类似,二者的主要区别是:平行进化一般指亲缘关系较近的植物种或植物类群,经过平行进化产生相似的特征;而趋同进化是指亲缘关系较远的植物种或

张亚平院士JMCB获人类大脑转录组进化研究进展

  人类在进化过程中,脑的大小和复杂程度得到了极大得增加。脑的结构使得人类有着区别于其他物种的极高的认知能力,比如语言能力、抽象思考能力等等。转录后修饰,如RNA编辑、可变剪切等能够由相同的DNA序列生成不同的RNA,进而翻译成不同的蛋白质构体,是扩大蛋白质多样性的重要机制。随着二代测序发展,转录后

你,还在进化

近700万年前,现代人类从黑猩猩祖先进化中分离出来,但今天人们仍在继续进化。在人类谱系中,已经有155个新基因被鉴定出来,这是由人类DNA的微小部分自发产生的。这些新基因中的一些可以追溯到哺乳动物的古老源头,其中一些“微基因”被预测与人类特有的疾病有关。相关研究近日发表于《细胞报告》。 “这个项

基因编辑技术可以编辑所有基因吗

即便当前不能,以后会能的。基因编辑技术指能够让人类对目标基因进行“编辑”,实现对特定DNA片段的敲除、加入等。在过去几年中, 以ZFN (zinc-finger nucleases)和TALEN (transcription activator-like effector nucleases)为代表

昆明动物所人类大脑转录组进化研究获进展

  人类在进化过程中,脑的大小和复杂程度得到了极大得增加。脑的结构使得人类有着区别于其他物种的极高的认知能力,比如语言能力、抽象思考能力等等。转录后修饰,如RNA编辑、可变剪切等能够由相同的DNA序列生成不同的RNA,进而翻译成不同的蛋白质构体,是扩大蛋白质多样性的重要机制。随着二代测序发展,转录后

碱基编辑技术治疗镰刀细胞贫血病

  镰状细胞病是一种常染色体隐性遗传病,由 HBB 突变引起,通常编码成人 β-珠蛋白(βA)。尽管同种异体造血干细胞 (HSC) 移植可以治愈 SCD,但通常无法获得最佳匹配的供体,并且该手术可能导致移植排斥或移植物抗宿主病。  2021年6月2日,博德研究所David R. Liu(刘如谦)等团

DNA碱基编辑:基因编辑工具“升级版”

  美国哈佛大学14日宣布,将授予光束疗法(Beam Therapeutics,下称BT)公司全球专利许可,对可用于治疗人类疾病的一套革命性DNA碱基编辑技术进行开发和商业化。  BT公司同日宣布,已经筹集了高达8700万美元由F-Prime资本和ARCH风投牵头的A轮融资。BT公司由基因编辑技术领

DNA碱基编辑:基因编辑工具“升级版”

  美国哈佛大学14日宣布,将授予光束疗法(Beam Therapeutics,下称BT)公司全球专利许可,对可用于治疗人类疾病的一套革命性DNA碱基编辑技术进行开发和商业化。   BT公司同日宣布,已经筹集了高达8700万美元由F-Prime资本和ARCH风投牵头的A轮融资。BT公司由基因编辑技

选对学术编辑和责任编辑多么重要

   公开评审的期刊都会为每个稿件指定一个学术编辑或者责任编辑来评估稿件质量,通过了学术编辑的初审然后就是外审同行专家进一步评估,等返回了规定的有效审稿意见(一般至少2份)后学术编辑会评估审稿人的审稿意见是否可靠,然后再做出推荐和裁决。   很多时候不少作者只关注审稿人提出的意见而忽略了责任编辑提出

著名华人科学家Science重大成果:首张全面的基因适应度景观图

   假设你正在试图设计一种疫苗来对抗下一季的流感病毒。获得一张能够告诉你各种流感病毒株将如何进化的明细图将会非常有帮助。  构建这类的图谱是研究适应度景观(fitness landscape)的进化生物学家们的一个目标,这一概念性工具为可视化及预测进化提供了一种方法。  适应度景观这一概念出现于2

STEME技术体系助力作物基因组编辑育种技术方法研究

  遗传与变异是物种进化的基础。通过物理、化学方法(如辐射诱变、EMS诱变)产生全基因组的随机突变已经成为农作物育种的常规手段,但其中具有新型农艺性状突变体的筛选较为费时、费力。定向进化(Directed Evolution)则通过创制目标基因的突变文库,在施加一定选择压力下能够快速获得目的突变体。

STEME实现植物基因的定向进化和功能筛选

  遗传与变异是物种进化的基础。通过物理、化学方法(如辐射诱变、EMS诱变)产生全基因组的随机突变已经成为农作物育种的常规手段,但其中具有新型农艺性状突变体的筛选较为费时、费力。定向进化(Directed Evolution)则通过创制目标基因的突变文库,在施加一定选择压力下能够快速获得目的突变体。

揭示伴侣进化之谜

  无论是配对还是成组,灵长类动物社会系统的成功也可能为人类社会生活的组织提供洞见。  研究人员分析了不同灵长类社会是如何进化的,以及哪些因素可能导致它们之间的转变。研究结果表明,从独居到群居的进化通常是从结对生活开始的。因此,结对生活是群体生活的基础,在社会制度演变中起着至关重要的作用。相关论文近

进化枝的概念

进化枝(Clade)是指生命进化树上包括祖先分枝和所有子代分枝(branch)总和的一个群体分枝。比如说,概述图中蓝色和红色区域可以称为clade,而绿色区域不可以,因为他是一个不完整的群体,蓝色群体也是其子代。

分子进化的概念

分子进化(molecular evolution),生物进化过程中生物大分子的演变现象。主要包括蛋白质分子的演变、核酸分子的演变和遗传密码的演变。

进化节奏的定义

中文名称进化节奏英文名称tempo of evolution定  义进化过程中,物种在各个不同阶段有不同的进化速率。应用学科遗传学(一级学科),进化遗传学(二级学科)

进化趋势的概念

中文名称进化趋势英文名称trend of evolution定  义在相对较长的时间尺度上,一个线系或一个单源群的成员表型进化改变的趋向。应用学科遗传学(一级学科),进化遗传学(二级学科)

种系进化的定义

中文名称种系进化英文名称phyletic evolution定  义一个物种没有经过系谱分裂而整体逐渐形成新种的进化模式。应用学科遗传学(一级学科),进化遗传学(二级学科)

共进化假说介绍

共进化假说提出传统的密码是从原始的简单密码进化而来,密码子的进化与氨基酸生物合成的进化是并列的。主要证据是这个原始的密码可能是由64个密码子通过高度简并只编码少量的氨基酸,而后的进化中,那些来自相关合成路径的物理化学性质不同的氨基酸却具有相似的密码子,表明密码子的进化与氨基酸生物合成具有密切相关性。

肠道的进化起源

  消化系统、皮肤、肌肉组织是如何进化的呢?这个问题困扰了科学家一个多世纪。维也纳大学的研究人员对海葵(一种非常古老的动物)胚胎发育的研究结果质疑了150年前提出的形成所有器官和组织的胚层具有同源性的假说。   该假说认为,身体中所有的器官和组织都来源于三个胚层之一,这些胚层在胚胎形成早期出现。这

分子进化的起源

在漫长的进化过程中生物的 DNA经历了各种各样的变化。包括基因突变、基因重组、染色体易位等。碱基置换突变常导致蛋白质中一个氨基酸的改变。例如正常血红蛋白第 6位的谷氨酸改变为缬氨酸便成为镰形细胞贫血症的血红蛋白 HbS,为赖氨酸替代则成为HbC,前者的碱基是从GAA(谷氨酸)→GUA(缬氨酸),后者