霸王龙和鸡

Protein Sequences from Mastodon and Tyrannosaurus Rex Revealed by Mass Spectrometry这篇文章用质谱测定了6800万年前霸王龙化石中的胶原蛋白部分序列,方法很巧妙,恐龙基因组当然是没有测序完成的,呵呵,也很科幻:) 点击这里进入下载页面:进入下载页面......阅读全文

液质联用仪LCMS的性能指标

1、泵的最大工作压力 这是指柱塞泵能达到的最大的耐压值,需要提供多高的压力给输液主要取决于色柱填料的粒径,当然,在达到最佳柱效的前提下在实际操作中还与输送液体的性质,流量、柱温等因素有关,对于常规的HPLC/MS测试来说,使用5mm或更高粒径的填料则15-30MPa的压力可以满足工作要求,但如果使用

基于液质联用的单细胞蛋白质组学研究进展

摘要    蛋白质是细胞功能的主要执行者,由于其无法在体外进行扩增,单细胞蛋白质组学技术相较单细胞基因组学和转录组学技术而言发展相对滞后。传统的蛋白质组学技术可获得大量细胞蛋白表达的平均值,但忽略了细胞亚型及细胞异质性等信息。单细胞水平的蛋白质分析有助于阐明细胞不同表型与异质性的分子基础。随着质谱仪

蛋白质质谱测序

蛋白质谱一般来讲是用来对某个蛋白质进行鉴定的方法而蛋白质测序实际上就是检测蛋白质的多肽链数目,不一定要用到质谱技术简单说,蛋白质测序的方法有很多,一般是在构建完成后,通过测序来对比之前的预测的序列是否正确。而质谱检测一般是用在蛋白质表达纯化完成后,用来鉴定是否是最初设计的那个蛋白。

Nature:基因组测序解析这种与恐龙同时代的动物

喙头蜥(tuatara)是新西兰标志性的陆生脊椎动物,从三叠纪到现在一直没怎么进化,被人称为爬行动物中的“活化石”。在2.5亿年前,这种动物还有不少亲戚,但只有它们活到了现在。因此,对喙头蜥的深入研究有助于我们了解羊膜动物的进化。近日,新西兰奥塔哥大学、欧洲生物信息学研究所(EMBL-EBI)等机构

基因组测序

如果楼主指的是人类基因组计划,那时用的方法叫做双脱氧终止法,也叫做sanger法。它的原理是在DNA合成过程中,DNA聚合酶能够使用ddNTP(双脱氧核苷酸)来作为原料,但它的反应会在加入ddNTP的时候终止。具体实验是通过PCR来完成的,但与普通PCR不同,它只需要一个引物而不是一对。在4个相同的

Waters使用新的液质联用系统支持更严格的蛋白质组学研究

IdentityE 高精确度蛋白质组学系统——从复杂的生物基质样品中发现和鉴定更多的蛋白 (印第安纳波利斯印第安纳州,2007年6月3日)Waters沃特世公司(NYSE:WAT)在第55届美国质谱大会(55th ASMS)上,发布新型IdentityE 高精确度蛋白质组学系统。该系统是集成了超高

“组学国标”项目结硕果:最精准的mRNA测序与蛋白质组质谱

  二代测序、蛋白质组质谱,这些“高大上”的组学手段早已不是稀罕事,使人们对生命和疾病的理解进入了一个崭新的时代。这些组学技术大量用于科研的同时,在应用领域却陷入了巨大的困境。  蛋白质组质谱技术和RNA测序目前几乎没有任何值得一提的临床应用,即便是在临床应用得相对较多的DNA测序,也饱受重复性差、

蛋白质组学质谱分析

Proteomics Primer1. Proteomics2. 2-D PAGE3. Immobilised pH gradients (IPGs)4. Mass spectrometry5. Principles of mass spectrometry6. Matrix assisted la

蛋白质组学不能被基因组和转录组取代

基因和蛋白并不存在严格的线性关系ORF并不预示一定存在相应的功能性基因mRNA水平并非与蛋白质的表达水平对应翻译后修饰及同工蛋白质(isforms)等现象在基因水平无从表现

液质联用技术

在分析仪器行业中,质谱仪(mass spectrometer, MS)是灵敏度最高,对未知化合物的结构分析及定性最准确,要求相应标准样品或对测定化合物的了解最少的定性手段。而高效液相色谱(HPLC)则是分离化合物范围最广、准确度高、对化合物破坏性小的快速分离方法,特别适用于生物提取物的分离。随着电喷

液质联用仪

液质联用仪是实现样品液相分离并检测过程的仪器,无论液质联用仪的类型如何变化,构成质谱系统的5个基本组成部分皆是相同的,它们是接口、电离源、真空系统、检测系统及数据处理系统。

液质联用技术

液质联用(HLPC-MS)又叫液相色谱-质谱联用技术,它以液相色谱作为分离系统,质谱为检测系统。样品在质谱部分和流动相分离,被离子化后,经质谱的质量分析器将离子碎片按质量数分开,经检测器得到质谱图。液质联用体现了色谱和质谱优势的互补,将色谱对复杂样品的高分离能力,与MS具有高选择性、高灵敏度及能够提

岛津公司推出新型超高速扫描LCMS2020液质联用仪

     LCMS-2020质谱仪,提供最佳的测量速度和灵敏度,更快的测量和更高的检测灵敏度,更快更准确地检测微量杂质,环境污染物和其他污染物。与性能卓越的超快速液相色谱(UFLC/ UFLCXR)联用后,将达到分离性能和生产力的最大化。            特征   UFs

LCMS在脂质组学中的应用

  脂质组学(lipidomics)已经作为一门独立的学科与非靶代谢组学、靶向代谢组成为代谢组学中“三大主要研究领域”。为什么脂质组学会成为研究热点中的新宠?请听我一一道来。  还记得上面这张18年初风靡全生物圈的“小鼠拔罐”图吗?今年2月,陆军军医大学新桥医院李咏生团队发表在【Cellular P

基因组测序仪简介

  基因组测序仪是一种用于生物学领域的分析仪器,于2012年12月19日启用。  技术指标  个体化基因组测序仪主机/ION TORRENT主机。  主要功能  样品处理、快速的运行时间以分析单个或多个样品 支持多重文库,从而实现最大的效率和经济性 可在必要时禁用个别测序通道,以节约试剂用量。

PNAS:甜瓜基因组测序

  甜瓜在世界范围具有很高的经济价值,日前西班牙的九个研究中心通力合作,利用罗氏454平台完成了甜瓜基因组的测序。除了甜瓜的全基因组,科学家还得到了 7个特定甜瓜品种的基因组,文章发表在Proceedings of the National Academy杂志上。   联合国粮农组织2009年

认识泛基因组测序

什么是泛基因组?2005年,Tettelin等人提出了微生物泛基因组概念(pangenome,pan源自希腊语‘παν’,全部的意思),泛基因组即某一物种全部基因的总称。2009 年,Li等人首次采用新全基因组组装方法对多个人类个体基因组进行拼接,发现了个体独有的DNA序列和功能基因,并首次提出了“

蛋白质组学之逆袭,深度注释基因组

  申请课题缺创新点?撰写论文没思路?急着毕业时间紧?别怕,对于吉凯,一切都是套路!更有甚者,对于宇宙终极难题:“屌丝如何逆袭白富美?”老司机黄博也有一套经典案例分享给大家。   从前,在生物学研究领域,有一个白富美叫基因组学(Genomics),她有一项强大的技能:DNA测序,凭借这项技能,她完

蛋白质测序

一、概念当前,所谓蛋白质测序,主要指的是蛋白质的一级结构的测定。蛋白质的一级结构(Primary structure)包括组成蛋白质的多肽链数目。很多场合多肽和蛋白质可以等同使用。多肽链的氨基酸顺序,它是蛋白质生物功能的基础。  蛋白质氨基酸顺序的测定是蛋白质化学研究的基础。自从1953年F.San

蛋白质测序

  进行蛋白质测序的方法包括:  埃德曼降解  肽质量指纹图谱  质谱分析  蛋白酶水解法  如果编码蛋白质的基因是已知的,那么目前测序和推断蛋白质序列要容易得多。通过上述方法之一确定蛋白质氨基酸序列的一部分(通常是一端)可能足以鉴定携带该基因的克隆。

蛋白质测序

一、概念当前,所谓蛋白质测序,主要指的是蛋白质的一级结构的测定。蛋白质的一级结构(Primary structure)包括组成蛋白质的多肽链数目。很多场合多肽和蛋白质可以等同使用。多肽链的氨基酸顺序,它是蛋白质生物功能的基础。  蛋白质氨基酸顺序的测定是蛋白质化学研究的基础。自从1953年F.San

蛋白质测序

Edman降解法             实验方法原理 主要有质谱法,利用蛋白质测序仪进行测序以及利用蛋白质对应DNA或mRNA进行间接测序。传统的蛋白质测序实验一般包括以下步骤:1

蛋白质测序

一、概念当前,所谓蛋白质测序,主要指的是蛋白质的一级结构的测定。蛋白质的一级结构(Primary structure)包括组成蛋白质的多肽链数目。很多场合多肽和蛋白质可以等同使用。多肽链的氨基酸顺序,它是蛋白质生物功能的基础。  蛋白质氨基酸顺序的测定是蛋白质化学研究的基础。自从1953年F.San

岛津发布新款三重四极杆液质联用仪LCMS8060NX

Nexera LC-40+LCMS-8060NX  6月1日,岛津公司发布LCMS-8060NX三重四极杆液相色谱质谱联用仪。 LCMS-8060NX是岛津三重四极杆液质联用仪旗舰机型的巅峰之作,在实现优异的灵敏度和分析速度的同时,进一步提升了仪器的稳定性、耐用性和操作性。  近年来,随着对降低运行

《基因组蛋白质组与生物信息学报》:蛋白质组学技术面临

《基因组蛋白质组与生物信息学报》:蛋白质组学技术面临挑战 2003年4月人类基因组图谱基本绘制完成,但对基因的调节与功能问题仍未能解读。由于基因的功能主要是通过其编码的蛋白质来实现,蛋白质才是生命活动真正的执行者,所以越来越多的科学家致力于蛋白质的研究,试图找出人类疾病的致病机理,最终解决人类

杨芃原:色谱质谱联用中的保留时间校正和蛋白质组定量

  2014年4月20日上午,第十届全国生物医药色谱及相关技术学术交流会大会报告在威海盛大召开。来自复旦大学的杨芃原教授作为本次大会的嘉宾,带来了题为《色谱-质谱联用中的保留时间校正和蛋白质组定量》的报告。 复旦大学 杨芃原教授   杨芃原教授首先说道现今蛋白质组的色谱分离和分析已经产

首张人类蛋白质组测序草图绘成

据物理学家组织网19日报道,在人类基因组图谱(人类生命的基因“蓝图”)发布20年后,国际人类蛋白质组组织宣布,他们绘制出了人类蛋白质组首张测序草图,有望帮助科学家更好地理解生命并治疗疾病。 研究发表于最新一期《自然·通讯》杂志。研究成员之一、加拿大英属哥伦比亚大学血液研究中心的克里斯托弗·奥威尔

Nature-Methods-|-朝思暮想:单细胞蛋白质组测序之梦

  近期,Nature Methods 杂志技术编辑Vivien Marx发表文章 A dream of single-cell proteomics,探讨了单细胞蛋白组学的发展,提出了该技术有可能会面对的问题和潜在解决方案。单细胞蛋白质组测序的梦想并不遥远(Credit: S. Larochell

液质联用仪液质日常定期维护

  1、使用的稳压电源UPS,保证仪器电源电压稳定持续(特别是停电时对仪器的影响)。  2、每天用异丙醇溶液冲洗系统和清洁雾化室,定期开震气阀震气(对于ESI源,至少每星期做一次;对于APCI源,每天做一次),保证毛细管洁净。  3、流动相流速不要过高,ESI离子源不要超过0.5ml/min,APC

液质联用经验汇总

经验总结一:液质使用经验与禁忌1、酸性物质适合做负离子检测,所以流动相偏碱性较合适,促使其解离,碱性物质适合做正离子检测,流动相中适当的加入酸,促使其形成正离子,流动相中适当加一些醋酸钠(或者醋酸铵),可形成加钠的正离子或者加铵的正离子。液质分析中推荐使用的流动相和添加剂推荐使用不推荐使用/尽量不用