常用分子生物学软件讲解
分子生物学软件介绍 一、实验准备阶段Reference Manager 9.0Endnote 3.1.2 二、实验实施阶段 1、综合软件Omiga 2.0DNASIS 2.5DNATools 5.12、限制酶切位点分析 DNAssist 1.03、引物设计Primer Premier5.04、序列的同源比较GeneDoc 3.2 MACAW 2.05Clustal X5、质粒绘图Gene Construction Kit 2.0Plasmid Premier2.026、结构域（motif）查找Primer Premier 5.07、RNA二级结构预测RNAdrawRNAStructure 3.5 8、蛋白二级结构分析 Antheprot 4.59、三维结构显示 RasMol 2.7.1Cn3D10、格式转换Seqverter 1.311、电泳图谱分析band leader 3.0 三、实验结果输......阅读全文
毕赤酵母表达（pichia pastoris expression ）实验手册（6）
随着PCR技术的不断发展成熟（扩增长度、保证性、产量和特异性等），质粒构建过程的大多数细胞内的DNA复制将被PCR这一细胞外的DNA复制所代替，质粒构建效率将有质的飞跃。4.4密码子的偏好性的原则酵母菌对外源基因的表达也和外源基因密码子的选用有关。了解表达系统宿主在密码子使用上的偏爱性对从翻译水平分
原创]分子生物学软件集总结
1. DNASIS 2.5 DNASIS for Windows 2.5版是日立软件公司（Hitachi Sofeware Engineering Co.,Ltd.）97年推出的一个功能强大的序列分析软件。包含有大部分分子生物学软件的常用功能，可进行DNA，RNA，蛋白质序列的编辑和分析，甚至还能进
质粒DNA限制性酶切图谱分析
一、DNA的限制性酶切实验原理核酸限制性内切酶 是一类能识别双链ＤＮＡ中特定碱基顺序的核酸水解酶，这些酶都是从原核生物中发现，它们的功能犹似高等功物的免疫系统， 用于抗击外来ＤＮＡ的侵袭。限制性内切酶 以内切方式水解核酸链中的磷酸二酯键， 产生的ＤＮＡ片段５’端为Ｐ，３’端为ＯＨ。1. 限制性内切酶
常用生物软件（windows）全面介绍
常用生物软件（windows)全面介绍一、基因芯片1、基因芯片综合分析软件。 ArrayVision 7.0 一种功能强大的商业版基因芯片分析软件，不仅可以进行图像分析，还可以进行数据处理，方便protocol的管理功能强大，商业版正式版：6900美元。 Arraypro 4.0 Media Cyb
RNA引物设计怎么设计
一般就是设计引物能够跨越至少一个exon-exon junction的，就是引物在两个exon的交界处，这样pcr的时候就不会有DNA污染现在NCBI可以直接有引物设计，还可以选择上述的设计方式或者可以通过找到cDNA序列然后自己在primer3上设计也可以
质粒DNA的限制性内切酶（restriction endonuclease, RE）酶切及..
实验原理： 限制性内切酶（restriction endonuclease, RE）能特异地结合于一段被称为限制性酶识别序列的DNA序列之内或其附近的特异位点上，并切割双链DNA。限制性内切酶可分为三类：I、Ⅱ和III类。I类和III类酶在同一蛋白质分子中兼有修饰（甲基
聚合酶链式反应（PCR）引物设计软件介绍
Primer Premier5.0 （自动搜索）vOligo6 （引物评价）vVector NTI SuitvDNAsisvOmigavDNAstarvPrimer3 （在线服务）
SsrB对伤寒沙门菌氧应激早期基因表达的调节
【摘要】 目的： 研究伤寒沙门菌ssrB基因在氧应激早期对其他基因表达的调节。方法： 通过同源重组的方法利用自杀质粒制备伤寒沙门菌ssrB基因缺陷变异株;采用伤寒沙门菌全基因组芯片比较野生株和ssrB基因缺陷变异株在氧应激早期的基因表达差异，并对其中部分表达差异基因进行实时定量PCR验证;
质粒DNA的限制性内切酶酶切分析
实验目的学习和掌握限制性内切酶的特性掌握对重组质粒进行限制性内切酶酶切的原理和方法并理解限制性内切酶是DNA重组技术的关键工具。相关基础知识限制性核酸内切酶：是一类能识别双链DNA分子特异性核酸序列的DNA水解酶。它是基因工程中用于体外剪切基因片段的重要工具酶。上世纪七十年代，当人们在对噬菌体的宿主
限制性内切酶酶切反应实验原理
限制性内切酶已有百余种，每种酶有其特定的核苷酸序列识别特异性，酶的活性需Mg2+来激活。不同的酶也有许多差别：有些酶除需Mg2+外，还需ATP等其他辅助因子的激活；切割位点和识别序列间的距离不同；某些内切酶同时具有甲基化作用。根据这些差别，可将限制性内切酶分为Ⅰ、Ⅱ和Ⅲ型。Ⅱ型限制性内切酶只需要