蛋白质组学研究中常见的问题
随着人类基因组计划的实施和推进,生命科学研究已进入了后基因组时代。在这个时代,生命科学的主要研究对象是功能基因组学,包括结构基因组研究和蛋白质组研究等。尽管现在已有多个物种的基因组被测序,但在这些基因组中通常有一半以上基因的功能是未知的。目前功能基因组中所采用的策略,如基因芯片、基因表达序列分析(Serial analysis of gene expression , SAGE) 等都是从细胞中mRNA 的角度来考虑的,其前提是细胞中mRNA 的水平反映了蛋白质表达的水平。但事实并不完全如此。从DNA →mRNA →蛋白质,存在三个层次的调控,即转录水平调控(Transcriptional control) 、翻译水平调控(Translational control) 、翻译后水平调控(Posttranslational control ) 。从mRNA 角度考虑，实际上仅包括了转录水平调控,并不能全面代表蛋白质表达水平。实验也......阅读全文
翻译后修饰
中文名翻译后修饰外文名Post-translational modification定义翻译后修饰是指蛋白质在翻译后的化学修饰。对于大部分的蛋白质来说，这是蛋白质生物合成的较后步骤。
水生所蛋白质翻译后修饰组学研究获进展
蛋白质的翻译后修饰，如磷酸化、乙酰化等，是调节蛋白质生物学功能的关键步骤，是蛋白质动态反应和相互作用的一个重要分子基础，也是细胞信号网络调控的重要靶点。由于翻译后修饰蛋白质在样本中含量低且动态范围广，其研究极具挑战性。近期，中国科学院水生生物研究所葛峰研究员学科组在蛋白质翻译后修饰组学及其功能方
蛋白质翻译后修饰的验证问题
Why are proteins, detected by mass spectrometry, not validated by site-specific antibodies?The modified motif could be detected by mass spectrometry (
关于翻译后修饰蛋白质的介绍
前体蛋白是没有活性的，常常要进行一个系列的翻译后加工，才能成为具有功能的成熟蛋白。加工的类型是多种多样的，一般分为以下几种：N-端fMet或Met的切除、二硫键的形成、化学修饰和剪切。当合成蛋白质时，20种不同的氨基酸会组合成为蛋白质。蛋白质的翻译后蛋白质其他的生物化学官能团（如醋酸盐、磷酸盐、
关于翻译后修饰的蛋白质的基本介绍
前体蛋白是没有活性的，常常要进行一个系列的翻译后加工，才能成为具有功能的成熟蛋白。加工的类型是多种多样的，一般分为以下几种：N-端fMet或Met的切除、二硫键的形成、化学修饰和剪切。当合成蛋白质时，20种不同的氨基酸会组合成为蛋白质。蛋白质的翻译后蛋白质其他的生物化学官能团（如醋酸盐、磷酸盐、
翻译后修饰蛋白质的定性和定量实验
蛋白质翻译后修饰 (PTM) 在细胞生物调节中发挥着基本作用。PTM 是 mRNA 翻译后蛋白质的酶促共价化学修饰。蛋白质化学修饰非常重要，因为它们会潜在地改变蛋白质的物理或化学性质、组成、活性、细胞定位或稳定性。实际上，在氨基酸或蛋白质的 N 端或 C 端加入或移除化学基团会导致大部分蛋白质发生变
翻译后修饰蛋白质的定性和定量实验
翻译后修饰蛋白质的定性和定量实验 实验步骤 一、引言 蛋 白 质 翻 译 后 修 饰 (P T
翻译后修饰蛋白质的定性和定量实验3
三、蛋白质的硝化修饰 酪氨酸、色氨酸、甲硫氨酸、半胱氨酸侧链的硝化与亚硝化作用构成了蛋白质硝化PT M 的主要部分。这些加成反应由发育、氧化应激及衰老过程中产生的活性氮介导。活性氮的增加是由一氧化氮和活性氧的过度反应或调控紊乱造成的（Yeo et al.，2008)。活性氮和活性氧能够靶向于DN
翻译后修饰蛋白质的定性和定量实验6
七、P T M 的定量分析当研究 P T M 的生物学意义时，如能了解一个特定修饰或一组P T M 的相对或绝对丰度通常会有帮助。这样可以将不同的生物样品间的目的修饰进行直接比较。例如, 将正常与疾病状态下细胞或组织内某一 P T M 的丰度进行比较。定量分析这些变化能够帮助深人了解 P T M 在
翻译后修饰蛋白质的定性和定量实验4
五、质 谱 分 析质谱仪器的多种设计和配置都支持蛋白质组的动态性质及其相关 P T M 的研究工作 。对 鉴 定 PTM 而言，质谱仪的最重要的两个特征（feature) 就是其质量准确度和分辨率 。与蛋白质鉴定不同 (其通常是基于鉴定同一蛋白质中的多个独立肽段)P T M 必须通过单独的 MS/M
翻译后修饰蛋白质的定性和定量实验6
七、P T M 的定量分析 当研究 P T M 的生物学意义时，如能了解一个特定修饰或一组P T M 的相对或绝对丰度通常会有帮助。这样可以将不同的生物样品间的目的修饰进行直接比较。例如, 将正常与疾病状态下细胞或组织内某一 P T M 的丰度进行比较。定量分析这些变化能够帮助
翻译后修饰蛋白质的定性和定量实验（五）
六、CID、ECD和 ETD的对比基于质谱的蛋白质组学分析依赖于气相中肽段在低碰撞能量下断裂, 在质量谱图中形成峰。进而通过峰图确定肽段序列，再推断出相关蛋白质。完成肽段断裂最主要的方法就是碰撞诱导解离（collision induced dissociation，C I D ) ( S w
翻译后修饰蛋白质的定性和定量实验5
六、CID、ECD和 ETD的对比基于质谱的蛋白质组学分析依赖于气相中肽段在低碰撞能量下断裂, 在质量谱图中形成峰。进而通过峰图确定肽段序列，再推断出相关蛋白质。完成肽段断裂最主要的方法就是碰撞诱导解离（collision induced dissociation，C I D ) ( S w a n
Molecular－Cell：蛋白质翻译后修饰调控植物胁迫反应
甲基化修饰与一氧化氮(nitric oxide； NO)依赖的亚硝基化修饰是高度保守的蛋白质翻译后修饰，这两类修饰参与调控众多生物学过程，包括调控非生物胁迫反应。但二者调控非生物胁迫的分子机制不甚清楚。 中国科学院遗传与发育生物学研究所左建儒研究组在亚硝基化蛋白质组学研究中发现拟南芥蛋白质
翻译后修饰蛋白质的定性和定量实验（二）
二、用 于 鉴 定 P T M 的富 集 技 术2.1 磷酸化丝氨酸、苏氨酸、酪氨酸残基的可逆磷酸化也许是研究最为深人的 PT M 。蛋白质磷酸化信号网络介导细胞对与不同的应激因子、生长因子、细胞因子以及细胞间相互作用作出响应。憐酸化还影响多种细胞进程，如增殖、凋亡 、迁移 、转录和蛋白
翻译后修饰蛋白质的定性和定量实验（四）
三、蛋白质的硝化修饰酪氨酸、色氨酸、甲硫氨酸、半胱氨酸侧链的硝化与亚硝化作用构成了蛋白质硝化PT M 的主要部分。这些加成反应由发育、氧化应激及衰老过程中产生的活性氮介导。活性氮的增加是由一氧化氮和活性氧的过度反应或调控紊乱造成的（Yeo et al.，2008)。活性氮和活性氧能够靶向于D
翻译后修饰蛋白质的定性和定量实验（三）
2.2 糖基化糖 基 化 是 一 种 常 见 的 P T M , 并 且 已 经 证 明 能 够 影 响 酶 的 活 性 、蛋 白 质 定 位 、稳 定 性 、信 号 转 导 、细 胞 黏 附 和 蛋 白 质 相 互 作 用 (Spiro, 2002k 目 前 已 经 发 现 在 肿 瘤 恶
翻译后修饰蛋白质的定性和定量实验2
二、用 于 鉴 定 P T M 的富 集 技 术2.1 磷酸化丝氨酸、苏氨酸、酪氨酸残基的可逆磷酸化也许是研究最为深人的 PT M 。蛋白质磷酸化信号网络介导细胞对与不同的应激因子、生长因子、细胞因子以及细胞间相互作用作出响应。憐酸化还影响多种细胞进程，如增殖、凋亡 、迁移 、转录和蛋白质翻译（W
翻译后修饰蛋白质的定性和定量实验（一）
一、引言蛋 白 质 翻 译 后 修 饰 (P T M ) 在 细 胞 生 物 调 节 中 发 挥 着 基 本 作 用 。 P T M 是 m R N A 翻译 后 蛋 白 质 的 酶 促 共 价 化 学 修 饰 。蛋 白 质 化 学 修 饰 非 常 重 要 ，因 为 它 们 会 潜 在 地
翻译后修饰蛋白质的定性和定量实验（五）
六、CID、ECD和 ETD的对比 基于质谱的蛋白质组学分析依赖于气相中肽段在低碰撞能量下断裂, 在质量谱图中形成峰。进而通过峰图确定肽段序列，再推断出相关蛋白质。完成肽段断裂最主要的方法就是碰撞诱导解离（collision induced dissociation，C I
科学家探讨蛋白质翻译后修饰对肉品质影响
我国生鲜肉加工、贮藏、流通过程存在品质劣变快、损耗高的突出问题。从分子水平揭示生鲜肉品质形成与劣变的代谢通路，精准控制生鲜肉劣变和靶向调控肉品质，是我国肉类产业亟待攻克的重大难题。 中国农科院肉品加工与品质调控创新团队近十年来聚焦宰后早期能量代谢与蛋白质翻译后修饰关联调控肉品质的分子机制，取得系
关于质谱的翻译后修饰蛋白质组分析新方法
分析测试百科网讯 由中国化学会和国家自然科学基金会主办，西北大学和南京大学承办的第十三届全国分析化学年会于2018年6月15日在西安曲江国际会议中心召开（相关报道：第十三届化学会 分析化学的进展与未来）。6月16日在“蛋白质分析与质谱分析”分会场上，由复旦大学的陆豪杰带来了《关于质谱的翻译后修饰
赖氨酸翻译后修饰及对蛋白质功能调控作用中期总结召开
7月29日，科技部重大科学研究计划“赖氨酸翻译后修饰及对蛋白质功能的调控作用”项目中期总结会议在中国科学院上海生命科学研究院健康科学研究所学术报告厅召开。会议由项目首席科学家、健康所研究员秦樾主持。科技部基础研究管理中心朱庆平副处长和健康所主持工作的副所长孔祥银研究员出席会议并讲话。 孔祥银
蛋白质翻译后修饰通过泛素化降解途径调节脂肪酸合成
2月7日，国际学术期刊《自然-通讯》（Nature Communications）在线发表了中国科学院上海营养与健康研究所李于研究组的最新研究成果“Post-translational regulation of lipogenesis via AMPK-dependent phosphoryl
ThermoFisher推出Proteome－Discoverer蛋白质组学软件
Thermo Fisher推出Proteome Discoverer：前沿蛋白质组学研究的突破性生物软件 质量信息学平台提供了强大的分析、开放和灵活架构，易于使用的界面 2008年5月30日，圣何塞，服务科学，世界领先的赛默飞世尔科技公司，今天宣布将在ASMS 2008（第56届美国质谱大会）上
蛋白质易位之翻译后易位
尽管大多数分泌蛋白是共翻译易位的，但有些分泌蛋白在胞质溶胶中翻译，然后通过翻译后系统转运到ER/质膜。在原核生物中，这一过程需要某些辅助因子，例如SecA和SecB，并由Sec62和Sec63（两种膜结合蛋白）促进。嵌入ER膜中的Sec63复合物导致ATP水解，使伴侣蛋白与暴露的肽链结合，并将多肽滑
中外学者合作Cell子刊解析蛋白翻译后修饰
来自密西根大学，中科院上海药物研究所，芝加哥大学等处的研究人员发表了题为“SIRT5-Mediated Lysine Desuccinylation Impacts Diverse Metabolic Pathways”的文章，首次在哺乳动物细胞中对去乙酰化调控酶Sirt5调控的琥珀酰底
蛋白翻译后修饰的基金申请解析与研究注意点（一）
每年三月初，都是科研界的“高考”倒计时，因为距离国自然基金申请的截止日期已不到半月。纵观历年国自然申请情况，蛋白的翻译后修饰都是申请中重大研究方向之一。2018年国自然统计表明，磷酸化、泛素化、乙酰化等修饰的相关基金项目，总研究资助金额超过2亿。 继上周的肠道微生物研究方案解析
蛋白翻译后修饰的基金申请解析与研究注意点（一）
每年三月初，都是科研界的“高考”倒计时，因为距离国自然基金申请的截止日期已不到半月。纵观历年国自然申请情况，蛋白的翻译后修饰都是申请中重大研究方向之一。2018年国自然统计表明，磷酸化、泛素化、乙酰化等修饰的相关基金项目，总研究资助金额超过2亿。继上周的肠道微生物研究方案解析后（国自然冲刺：打通菌群
新方法分析临床样本中的组蛋白翻译后修饰
欧洲肿瘤研究所（EIO）等机构的研究人员开发出一种基于质谱的流程，可分析FFPE临床样本中的组蛋白翻译后修饰。他们于上周在《Molecular & Cellular Proteomics》上详细介绍了这种技术。 利用这种技术，研究人员分析了一系列乳腺癌样本，发现Luminal A型乳腺癌和三阴