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微生物所揭示梭菌适应胁迫新策略

梭菌(Clostridium)是一类与人类关系十分密切的革兰氏阳性细菌。理解梭菌适应环境胁迫的机制,无论是对在医学上控制梭菌,还是在工业上利用梭菌,都具有十分重要的意义。 梭菌属中在工业上最广泛应用的种是丙酮丁醇梭菌。丙酮丁醇梭菌的正常发酵过程要经过产酸和产溶剂两个阶段,其中从产酸向产溶剂阶段的过渡,通常被认为是该菌的一种解毒和适应机制。在这一转换过程中,许多与胁迫应答、溶剂合成相关的蛋白会上调表达,而与氨基酸和蛋白质合成相关的蛋白则会下调表达。 为了更好理解丙酮丁醇梭菌适应环境胁迫的机制,研究人员模拟自然界的进化过程,获得了一株能够在丁醇浓度提高50%的胁迫环境下正常生长的突变株。采用比较蛋白质组分析,研究人员发现突变株中70%本应在产溶剂阶段上调或下调表达的差异蛋白,在产酸期就提前上调或下调,在产溶剂期还会进一步增大上调或下调的幅度。这表明突变株进化出了一种适应环境胁迫的新策略,即其解毒和适应机......阅读全文

琥珀酰化修饰组代谢组揭示水产动物病原菌代谢调控机制

  随着组学研究步入后基因组时代,蛋白质组、修饰蛋白质组、代谢组、多组学研究逐步向生命科学研究的各个领域渗透。尽管,相对于发展迅速的医学等领域,水产科学中对修饰组等较新组学技术的应用起步较晚,但目前已有不少高质量文章发表,这为水产科学研究领域打开了新的研究视角。   本期,小编将为大家带来一篇1

琥珀酰化修饰组代谢组揭示水产动物病原菌代谢调控机制

   随着组学研究步入后基因组时代,蛋白质组、修饰蛋白质组、代谢组、多组学研究逐步向生命科学研究的各个领域渗透。尽管,相对于发展迅速的医学等领域,水产科学中对修饰组等较新组学技术的应用起步较晚,但目前已有不少高质量文章发表,这为水产科学研究领域打开了新的研究视角。   本期,小编将为大家带来一篇

iTRAQ定量蛋白质组学技术分析抗菌肽F1的抗菌机制研究

  本研究利用iTRAQ定量蛋白质组学分析技术,对抗菌肽F1处理的大肠杆菌及空白对照在不同时间段菌体的生长速率以及其产生的蛋白质进行了分析与鉴定,通过比较实验组与对照组蛋白质表达水平差异,以期了解抗菌肽F1的抗菌机制。  抗菌肽在农业和食品工业中受到越来越多的关注,因为它们具有控制病原体的潜力。然而

蛋白质谱分析方法特点及其在蛋白组学研究领域中的应用

褚福亮,王福生, 中国人民解放军第302医院全军艾滋病与病毒性肝炎重点实验室 北京市 100039项目负责人 王福生, 100039 ,北京市丰台路26号, 中国人民解放军第302医院全军艾滋病与病毒性肝炎重点实验室. fswang@public.b

修正基因组法有效提高非模式生物蛋白质组鉴定的新策略

  随着高通量测序技术的不断崛起,全基因组测序也逐步普及。越来越多的物种基因组予以公布。目前,主要有两种获得研究物种参考基因组的策略:de novo 基因组拼接和基于mapping算法的基因组序列修正,mapping是指将所有测序读段通过序列比对定位到参考基因组上。De novo 基因组拼接是利用短

蛋白质纯化所需的生物提取物制备的实验(四)

小规模大肠杆菌细胞裂解规程1.去垢剂为基础的裂解试剂10 mL 裂解试剂溶液的配方:10 mLB-Per 或 BugBuster,20/iLLysonaseBioprocessingReagent。如果需要减少蛋白质水解和增加目标蛋白质可溶性及稳定性可以添加,如 EDTA、蛋白酶抑制剂、

蛋白质组学的样品制备

想要研究蛋白质,首先要得到高度纯化且具有生物活性的目的物质,因此,蛋白样品的制备是重要前提。蛋白提取的质量和效果对后续的研究分析有重要影响。不同种类的样本在制备过程中,存在一些差异,要根据样本特征调整实验方案和操作细节。基本原则样品处理尽量简单,减少蛋白损失;尽量避免蛋白的降解;尽可能提高样品蛋白的

逐次修正基因组法:有效提高非模式生物蛋白质组鉴定...

逐次修正基因组法:有效提高非模式生物蛋白质组鉴定的新策略随着高通量测序技术的不断崛起,全基因组测序也逐步普及。越来越多的物种基因组予以公布。目前,主要有两种获得研究物种参考基因组的策略:de novo 基因组拼接和基于mapping算法的基因组序列修正,mapping是指将所有测序读段通过序列比对定

精准分析 量化释能——6位专家齐聚2019 SCIEX技术交流会

  分析测试百科网讯 2019年4月18日,在第一届中国生物物理学会代谢组学分会年会暨2019代谢组学国际研讨会召开前夕,2019 SCIEX技术交流会如期召开,此次交流会的主题为“精准分析、量化释能”,旨在推动精准医学的发展。中国科学院大连化学物理研究所许国旺研究员、北京大学郑乐民教授、中国科学院

2017多组学研究与临床转化前沿论坛在上海隆重开幕

  4月21日,由生物谷主办的2017多组学研究与临床转化前沿论坛在上海隆重开幕。本次会议多组学研究和临床转化研讨会以迈向临床精准医疗为主题,聚焦基因组学、转录组学、蛋白质组学和代谢组学等多组学技术联用研究临床疾病,以及多组学数据的整合交叉分析应用,会议涉及基因变异、测序分析、转录调控、代谢研究、R

日研究组证实蚜虫与细菌相互共生

  在院子里精心种植的花草,不知什么时候就会爬满蚜虫。作为恶名昭著的害虫,蚜虫只吸食营养很贫乏的植物汁液,就能实现爆发性繁殖。这是因为,蚜虫体内有为其制造营养成分的内共生菌。  没有内共生菌,蚜虫就无法繁殖,而在含菌细胞之外,内共生菌已无法生存,这种共生关系已经世代相传了约2亿年。日本研究人员日前发

蚜虫与细菌如何共生?

  在院子里精心种植的花草,不知什么时候就会爬满蚜虫。作为恶名昭著的害虫,蚜虫只吸食营养很贫乏的植物汁液,就能实现爆发性繁殖。这是因为,蚜虫体内有为其制造营养成分的内共生菌。   没有内共生菌,蚜虫就无法繁殖,而在含菌细胞之外,内共生菌已无法生存,这种共生关系已经世代相传了约2亿年。日本研究人员日前

蛋白质纯化所需的生物提取物制备的实验

实验步骤一、化学法和酶法细胞裂解微量的细胞裂解经常通过化学法或酶法或二者共同采用来完成。例如, 超声和弗式细胞压碎器 (Frenchpress 均质机) 都不便于用在收集小于或等于 5 mL 的培养液的情况,而且应用这些机械的方法经常会遇到过度的产热和样品被氧化等问题。微量细胞裂解的简化方面的重大进

用于外源蛋白质生产的细菌表达系统

细菌表达系统有各种各样的载体和宿主菌可供选择,大部分工程菌的增殖时间短, 不仅便于快速评价实验结果,而且降低了技术和设备无菌要求的严格性。经过简单的调整, 许多在实验室规模下具有的这些内在优点在大规模的自动生产过程中也具有 。实验步骤一、使用大肠杆菌生产外源蛋白有越来越多的细菌表达系统可用于外源蛋白

PPTD2018分论坛:体外诊断试剂研究和质量控制报告集锦

  分析测试百科网讯 2018年10月10日,“2018年蛋白和肽类药物及诊断试剂研发与质控国际研讨会(PPTD 2018)”在四川省成都市香格里拉大酒店召开(相关报道:PPTD 2018在蓉开幕 聚焦测量与标准、质量与安全)。在精彩的大会报告之后,会议还举办了体外诊断试剂研究和质量控制等分论坛,分

用于外源蛋白质生产的细菌表达系统

            实验方法原理 实验步骤 一、使用大肠杆菌生产外源蛋白 有越来越多的细菌表达系统可用于外源蛋白的生产。影

综述:代谢组学研究加快医学生物标志物的发现

  生物标志物(Biomarker)是指 “一种可客观检测和评价的特性,可作为正常生物学过程、病理过程或治疗干预药理学反应的指示因子”,作为个体化医疗的“关键词”之一,寻找和发现有价值的生物标志物已经成为当前医学领域的研究热点。Biomarker的研究现状和发展趋势:  第一个肿瘤标志物可追溯到18

蛋白质纯化所需的生物提取物制备的实验

实验步骤 一、化学法和酶法细胞裂解 微量的细胞裂解经常通过化学法或酶法或二者共同采用来完成。例如, 超声和弗式细胞压碎器 (Frenchpress 均质机) 都不便于用在收集小于或等于 5 mL 的培养液的情况,而且应用这些

综述:代谢组学研究加快医学生物标志物的发现

  生物标志物(Biomarker)是指“一种可客观检测和评价的特性,可作为正常生物学过程、病理过程或治疗干预药理学反应的指示因子”,作为个体化医疗的“关键词”之一,寻找和发现有价值的生物标志物已经成为当前医学领域的研究热点。  01研究现状和发展趋势  第一个肿瘤标志物可追溯到1846年由H Be

2019中国生命科学领域CNS盘点:曹雪涛 颜宁 施一公上榜

  截至2019年12月23日,中国学者在Cell,Nature及Science在线发表了107篇文章(2019年的Cell ,Nature 及Science 已经全部更新),iNature团队对于这些文章做了系统的总结:  按杂志来划分:Cell 发表了31篇,Nature 发表了44篇,Scie

“生物钟”不可小觑 突破性研究共同解读生物钟奥秘

  “日出而作,日落而息”,地球上大部分生物从几十万年前就开始就遵从这种大自然的特殊规律。当然日常生活中人们也并没有非常在意这中自然规律/现象,直到现代医学的发展进步才让我们将这种顺应自然的规律同生物钟画起了等号。当然随之而来的就是科学家们对生物钟的各种深度研究。  很多科学研究都发现,人类生活中各

选择重组蛋白表达的合适方法

重组蛋白是研究生物学过程的重要工具。需要使用表达系统来对其进行制备。合适表达系统的选择取决于重组蛋白的特性、重组蛋白的预期应用以及该系统能否生产足够量的蛋白质。作者: 伯吉斯等,主译:陈薇,本实验来自「蛋白质纯化指南」实验步骤一、引言选 择 合 适 醜 组 蛋 白 表 达 方 法 对 于 能 否 及

选择重组蛋白表达的合适方法

实验步骤 一、引言 选 择 合 适 醜 组 蛋 白 表 达 方 法 对 于 能 否 及 时 获 取 所 需 数 量 和 质 量 的 重z组蛋白非常关键。选 择 了 错 误 的表达宿主可 能 导 致 蛋 白 质错 误 折 叠 或

AB SCIEX三大质谱平台支撑蛋白质组学研究

  2010年10月18~19日,由国家自然科学基金委、中国化学会分析化学委员会主办,复旦大学、上海交通大学承办的2010年微纳尺度分离和分析技术学术会议暨第六届全国微全分析学术会议在上海复旦大学复宣大酒店隆重召开。来自全国高等院校、科研机构、企事业单位的300余名专家学者出席了本次会议。

为何说肠道微生物是人类的“健康保护伞”?

  近年来大量的研究表明肠道微生物对于机体健康的维持具有重要的作用,包括营养的摄取,免疫系统的正常功能以及代谢稳态的维持。作为基础医学最热门的领域之一,肠道微生物与人体健康之间的关系的研究也层出不穷。在此,我们简要梳理一下近一段时间来有关这一领域的研究进展,希望大家喜欢!  1. Science子刊

六部委会诊认定蒙牛特仑苏安全 杨文俊回应OMP质疑

       2月14日下午14时,蒙牛集团在北京国际饭店举行了新闻发布会,对近日来关于蒙牛特仑苏OMP奶的安全问题质疑进行了回应。以下是发布会全文。   杨再飞:各位尊敬的媒体朋友,大家下午好!很抱歉占用大家情人节这样一个特殊的时间我们

痕量分析实验室

高分辨分离分析及代谢组学组(1808组)是在许国旺研究员领导下的、在中科院大连化物所最具综合实力的课题组之一,其前身是国家色谱研究分析中心气相色谱组,2001年更名为高分辨分离分析及代谢组学组。课题组多年来一直致力于色谱理论及应用基础研究,优势研究领域为应用色谱及相关技术进行石油、化工、食品、

多篇文章共同解读免疫系统与肠道菌群的奥秘

  近年来,随着科学家们研究的不断深入,越来越多的研究证据将机体的免疫系统与肠道菌群联系了起来,当然我们很多人并不清楚免疫系统到底和机体肠道菌群有着怎样的关联?免疫系统能够被肠道菌群调节,抑或者其能够主动调节机体肠道菌群的多样性从而来影响健康?  本文中就对二者之间的关联性研究进行了整理,如下:  

笔架山论坛大咖齐聚共话临床质谱和精准诊疗

分析测试百科网讯,逢深圳经济特区成立40周年暨粤港澳大湾区及中国特色社会主义先行示范区建设关键之年,2020年12月18日,深圳市第二人民医院主办的“笔架山论坛:临床质谱在精准医疗中的应用发展论坛”在深圳隆重举办。笔架山论坛现场本次论坛采取线下会议与线上授课相结合的方式,由分析测试百科网提供全程网络

MALDI-TOF-MS 在病原微生物鉴定中的研究进展

       基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(Matrixassisted laser desorption ionization-time of flight mass spectrometry,MALDI-TOF-MS)技术是近年来发展起来的一种软电离新