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新蛋白质组学方法引领蛋白功能研究革命

人类细胞是通过成千上万个蛋白质的协同作用来控制它们生长和分化的。但是,到目前为止,大多数人类蛋白质的特定功能还不清楚。 疾病的发生常常是由于冠军细胞蛋白质功能的失常。目前,世界各地已经启动了大量大规模的研究计划以了解所有人类蛋白质的功能。 现在,来自IRCM(Instiut de recherches cliniques de Montreal)的研究人员在7月20日的Molecular Cell杂志上发布的一篇文章描述了一种强大的蛋白质组学方法,该方法可能对我们目前了解人类蛋白质组和个体蛋白功能产生深远影响。 在这项研究中,研究人员利用蛋白质本身固有的特性开发出一种用于推断蛋白质功能的方法。Montreal研究组利用的这种独特的蛋白质特征就是蛋白质很少能单独起作用,而是与其他蛋白质装配成复合体来执行它们的功能。 IRCM的研究人员的策略主要是利用先进的蛋白质组学研究技术和他们自行开发的计算机运算方法,确定出许多已知功能......阅读全文

大规模蛋白质相互作用研究方法进展(三)

           图1 TAP亲和层析纯化原理[14]  注:A:标签中的ProteinA 与固化的IgG 结合缓冲液淋洗去除不能结合的杂蛋白,TEV 酶切分离ProteinA &nbs

酵母三杂交系统检测和分析RNA-蛋白相互作用实验

实验方法原理 酵母三杂交系统(yeast three-hybrid system)可用于分析蛋白质与 RNA 间的相互作用。在酵母三杂交系统中,RNA 蛋白质相互作用导致报道基因的转录,可以通过细胞生长、克隆颜色或特异的酶活性检测蛋白质与 RNA 的相互作用。试剂、试剂盒 YPD 和 SD 培养基鲑

代谢组学与临床医学的研究进展

  人体是一个复杂的系统,存在于这一系统中的生物分子相互关联、互相依赖。近年来,人们已经意识到生物学的整体复杂性以及基因构成与环境因素之间的复杂交互作用,而对这些交互作用的理解已经不能单单从基因组学、蛋白质组学或转录组学水平去揭示。关注生物分子之间途径及网络的动态变化和关系的系统生物学(system

Western blotting蛋白印迹市场概况和主要品牌及产品

近日,MarketsandMarkets咨询公司发布了全球western blotting市场的分析报告。据MarketsandMarkets预测,全球western blotting的市场规模将从2016年的5.75亿美元增长到2021年的7.31亿美元,复合年均增长率达4.9%。另一家Futur

通过Sapphire平台研究基于荧光的一种蛋白质-RNA相互作用...

通过Sapphire平台研究基于荧光的一种蛋白质-RNA相互作用的小分子调节剂Azure Biosystems国立首尔大学化学系CRI化学蛋白组学Wan Gi Byun团队在《Chembiochem》发表了他们最新的研究成果,基于荧光的紧密结合分析发现了一种蛋白质-RNA相互作用的小分子调节剂。那为

研究基于荧光的一种蛋白质-RNA相互作用的小分子调节剂

  国立首尔大学化学系CRI化学蛋白组学Wan Gi Byun团队在《Chembiochem》发表了他们最新的研究成果,基于荧光的紧密结合分析发现了一种蛋白质-RNA相互作用的小分子调节剂。   那为什么要研究RNA-蛋白之间的相互作用呢?   RNA和蛋白是可以相互作用的生物分子,可以通过物理

CDI HuProt人类蛋白质组芯片对砒霜抗肿瘤机制的研究

  通过HuProtTM人类蛋白质组芯片(由博翀生物提供),上海交通大学的科研团队发现砒霜(三氧化二砷,As2O3)可以明显抑制肿瘤细胞中糖酵解通路限速酶己糖激酶2(HK2: hexokinase-20)的活性而影响细胞代谢,最终导致肿瘤细胞的凋亡。这一研究成果于11月23日在美国科学院院报(PNA

国家重大科学研究计划2011年度重要支持方向确定

各省、自治区、直辖市、计划单列市科技厅(委、局),新疆生产建设兵团科技局,国务院各有关部门办公厅(室):  国家重大科学研究计划是《国家中长期科学和技术发展规划纲要(2006-2020年)》(以下简称《规划纲要》)部署的、引领未来发展、对科学和技术发展有很强带动作用的基础研究发展计划。  

基于共价连接适合高通量应用的新型高精度CLIP方法

  1月31日,国际学术期刊《核酸研究》(Nucleic Acids Research)在线发表了中国科学院生物化学与细胞生物学研究所吴立刚实验室的研究成果:SpyCLIP: an easy-to-use and high-throughput compatible CLIP platform fo

大化所蛋白质和RNA复合物相互作用合作研究取得新进展

  中科院大连化学物理研究所海洋生物产品工程组薛松研究员在其2008年非编码RNA如何帮助蛋白质寻找特异底物分子研究工作(Nature Structural & Molecular Biology)基础上,再次与合作者利用结构生物学手段,揭示了另一类非编码RNA及其相关蛋白质和

CDI HuProt人类蛋白质组芯片对砒霜抗肿瘤机制的研究

通过HuProtTM人类蛋白质组芯片(由博翀生物提供),上海交通大学的科研团队发现砒霜(三氧化二砷,As2O3)可以明显抑制肿瘤细胞中糖酵解通路限速酶己糖激酶2(HK2: hexokinase-20)的活性而影响细胞代谢,最终导致肿瘤细胞的凋亡。这一研究成果于11月23日在美国科学院院报(

Cell:利用新方法绘制蛋白与代谢物之间的相互作用组

  在一项新的研究中,来自瑞士苏黎世联邦理工学院的研究人员利用一种新的方法来发现细菌细胞中的蛋白和小的代谢分子之间之前未知的相互作用。该技术也能够被用来测试药物的效果。相关研究结果发表在2018年1月11日的Cell期刊上,论文标题为“A Map of Protein-Metabolite Inte

2016CMSS中国质谱学会质谱网络研讨会 大咖抢先看第二弹

  为进一步加强国内外质谱界学术交流,并采用更新颖的互联网形式组织交流活动,将质谱新技术和研究应用拓展和普及到更多的人,共同提高我国质谱研究及应用水平,中国质谱学会将在2016年11月1日-4日,组织“2016 CMSS中国质谱学会质谱网络研讨会”。会议邀请30位质谱大咖与您在线对话,报告内容涵盖质

环状RNA研究深度剖析

  1.环状RNA为什么火?它到底是何方神圣?   2013年两篇Nature[1][2]文章的出世,彻底颠覆了我们对RNA的传统认知,同时也迅速引爆了整个生物医学界!经过严格统计汇总后,2017年国家自然科学金获批的项目中环状RNA研究相关的项目总数高达176项,其中有两项杰出青年基金,一项优秀

研究蛋白质相互作用的新技术

  近期,来自多伦多大学Lunenfeld-Tanenbaum Research Institute (LTRI)和Donnelly中心的一组研究人员,开发出一种新技术,可以将细胞内的DNA条形码拼接在一起,以同时搜寻数百万个蛋白质配对,用以分析蛋白质相互作用。相关研究结果发表在4月22日的《Mol

筛选或验证RNA修饰直接靶点,研究RNA修饰靶基因的调控...

筛选或验证RNA修饰直接靶点,研究RNA修饰靶基因的调控机制技术简介用体外转录法标记生物素RNA探针,然后与胞浆蛋白提取液孵育,形成RNA-蛋白质复合物。该复合物可与链霉亲和素标记的磁珠结合,从而与孵育液中的其他成分分离。复合物洗脱后,通过Western Blot检测特定的RNA结合蛋白是否与R

2018国自然研究热点一:环状RNA研究深度剖析

  1.环状RNA为什么火?它到底是何方神圣?   2013年两篇Nature[1][2]文章的出世,彻底颠覆了我们对RNA的传统认知,同时也迅速引爆了整个生物医学界!经过严格统计汇总后,2017年国家自然科学金获批的项目中环状RNA研究相关的项目总数高达176项,其中有两项杰出青年基金,一项优秀

华东色谱质谱会学术报告荟萃

浙江大学化学系的朱岩教授,报告题目:高效液相-离子色谱柱切换方法分析反恐爆炸物残留组分  来自浙江大学化学系的朱岩教授做了题为“高效液相-离子色谱柱切换方法分析反恐爆炸物残留组分”的报告。朱教授首先介绍了国际上从事反恐研究的意义,随着国际恐怖事件的不断升级和国内外形势的复杂化,各国军/警方都投入大量

circRNA再发IF=18.88高分文章--circRNA机制研究汇总

超强子调控circRNA-Nfix缺失诱导成年小鼠心肌梗死后再生 circRNAs正在成为心脏发育和疾病强有力的调节因子,但其在心脏再生中的作用仍然未知。鉴于此,作者与他的团队探究了与超增强子(SEs)相关的circRNA-Nfix在小鼠心肌梗死后再生过程中的功能,并探究了其调节心脏重塑的分子机制

精确医学:不仅是简单的基因组测序

  国内在介绍和讨论精确医学时,大多只强调基因组序列分析的重要性,给人造成一种“基因组测序”是精确医学必由之路的幻象。但事实上,“十八般武艺齐上阵”的策略才是精确医学真正倡导的。2015年初,美国国立卫生研究院 (NIH)主任弗朗西斯·柯林斯 (Frans Collins)和美国曾任国立癌症研究所所

2015年北京色谱年会 精彩继续

  分析测试百科网讯 2015年北京色谱年会在京东宾馆召开。本届色谱年会的主题是“色谱技术在生命科学、环境和食品安全分析中的应用”,在2015的色谱年会上,刘虎威继任成为新一任色谱学会理事长,(详见本网报道:2015年北京色谱年会

体内甲醛交联及染色质免疫沉淀--研究DNA和蛋白质作用

染色质由真核基因组包装而成,它参与了转录、复制、重组、修复等许多以DNA一蛋白质相互作用为基础的生化过程。研究者感兴趣的是这些过程涉及到哪些特异的基因或DNA序列,有哪些蛋白质参与。尽管有许多人对染色质进行分类,就像Holde将其分为转录活性或非活性位点,但染色质构本身是动态的,并且DNA与非组蛋白

“干细胞及转化研究”等6个重点专项2018年项目申报发布

  5月22日,科技部官网发布了《关于对国家重点研发计划干细胞及转化研究等6个重点专项2018年度项目申报指南征求意见的通知》,其中,“干细胞及转化研究”重点专项、“蛋白质机器与生命过程调控”重点专项、“纳米科技”重点专项 与生物医学领域相关。  关于对国家重点研发计划干细胞及转化研究等6个重点专项

赛尔迪(SELDI)蛋白指纹技术的临床应用与前景

  蛋白质组学(Proteomics)是近年来生物学领域中发展起来的一门新兴学科,它是研究蛋白质的起源、特征、表达功能以及它与生命发生、发展关系等的一门学科。在医学领域中,通过对蛋白质组学的研究,对了解人类生命的起源、疾病的发生发展规律、疾病的诊断与治疗以及疾病的预防有着重要的意义。随着该

探索RNA与蛋白的相互作用,你需要这两种检测

  从DNA到蛋白质,这是一个相当复杂的过程。转录DNA的代码,这只是万里长征的第一步。随后,大量蛋白质编辑RNA,带领它从细胞核到细胞质,控制其稳定性,并指导其翻译。  据印第安纳大学的副教授Sarath Chandra Janga介绍,数百个RNA结合蛋白(RBP)参与了这个过程。Janga正在

赛尔迪(SELDI)蛋白指纹技术的临床应用与前景

蛋白质组学(Proteomics)是近年来生物学领域中发展起来的一门新兴学科,它是研究蛋白质的起源、特征、表达功能以及它与生命发生、发展关系等的一门学科。在医学领域中,通过对蛋白质组学的研究,对了解人类生命的起源、疾病的发生发展规律、疾病的诊断与治疗以及疾病的预防有着重要的意义。随着该学科的迅速发展

加州大学钟声团队:用“一滴血”检测胞外RNA液体活检方法

  细胞外RNA(exRNA)作为一种新型液体活检标志物,因其广谱性及多样性近些年引起了科学家的广泛关注。此前研究发现,包括miRNA在内的小exRNA与某些疾病的临床治疗反应相关,但关于其他类型exRNAs的存在情况及其临床相关性研究仍十分有限。此外,血清中的exRNA经过提取步骤后,含量往往非常

蛋白质谱分析方法特点及其在蛋白组学研究领域中的应用

褚福亮,王福生, 中国人民解放军第302医院全军艾滋病与病毒性肝炎重点实验室 北京市 100039项目负责人 王福生, 100039 ,北京市丰台路26号, 中国人民解放军第302医院全军艾滋病与病毒性肝炎重点实验室. fswang@public.b

微量热技术(Microcalorimetry)

微量热法(包括等温滴定量热和差示扫描量热)是近年来发展起来的一种研究生物热力学与生物动力学的重要结构生物学方法,它通过高灵敏度、高自动化的微量量热仪连续和准确地监测和记录一个变化过程的量热曲线,原位(in situ)、在线(on-line)和无损伤地同时提供热力学和动力学信息。 

章冰博士:首次阐析人类癌症“蛋白组-基因组学”特征

  由范德堡大学领导的一个研究小组鉴别出了驱动大肠癌的一些遗传突变的蛋白质“标签”。这项发表在《自然》(Nature)杂志上的重要研究,第一次综合阐析了人类癌症的“蛋白组-基因组学”(proteogenomic)特征,这将推动结直肠(大肠癌)癌诊断和治疗取得新的进展。在美国,结直肠癌是仅次于肺癌的第