发布时间:2015-09-07 16:39 原文链接: 基因检测:从价格战打到医用价值战!

  2003年完成第一个人类基因组测序需要27亿美元。基因测序可根据医疗护理的需要切实可行地阅读所有基因,因而即便在当时,科学家们也认为这个数字总有一天会降到1000美元。

  2014年1月,Illumina公司表示他们的 HiSeq Ten测序系统基本上达到一个里程碑:仅需1000美元就可清楚描述一个基因组。但这个数字有点误导性,阅读一个基因组,1000美元可能只是一个粗略的平均成本,因为阅读一个基因组数据需要10台并联测序仪器,每台仪器的费用为100万美元,因此没有多少测序中心能负担得起10台仪器的成本。

  硬成本

  Illumina HiSeq Ten系统(由10台仪器组成)的第一批买家之一为哈弗大学布罗德研究所和麻省理工学院,布罗德研究所目前可在一个月内完成2000个人类基因组测序,即使在这种规模下,测序成本也不只是1000美元,但很接近,布罗德研究所基因组学平台高级主管表示。

  我们要时刻记住测序设备的成本通常是低于商家对客户的要价。布罗德研究所对一个基因组测序的要价为1800美元,其他大型服务商要价与之类似。例如,总部在韩国的Macrogen公司要价为1600美元,一次性服务的供应商对基因组测序的费用收取会更高。

  布罗德研究所表示,测序成本包括阅读DNA所需的化学试剂以及其他材料、劳力、基础数据分析(从端到端将整个序列整合成可读格式)、管理开销(如建筑和电力),这个成本不包含数据存储的成本。

  美国国家人类基因组研究所基因组科学主任Jeffery Schloss说,即使需要这些硬成本,不断改进的技术可将测序费用在不到一年时间内降低至1000美元。例如,更快的成像系统以及拇指大小的驱动芯片,可大幅度减少每个基因组测序的时间。

  进一步降低成本

  客户支付1600到1800美元可获得30次DNA碱基阅读。DNA序列的可读性越高,测序的精准度越高。测序基因组阅读30次已足够用于一些医疗用途,如了解参与疾病的一些基因。一些单基因遗传疾病如先天性耳聋、地中海贫血等由于致病基因位点单一明确,比较容易通过测序进行筛查;但癌症等复杂疾病是多种基因异常导致的,需要大规模样本量的重复测分析序比对,才能找到相对准确的疾病与基因的相关性。因而对复杂疾病来说,需要成千上万的序列,这意味着1000美元/每个基因组的价格是昂贵的。

  再如,对于某些癌症的研究来说,不同个体细胞可能有不同的突变,研究人员推荐阅读60-80次,这显然意味着需要更高的价格。因此,一些应用程序的价格需要便宜10倍:如100美元或200美元。Illumina公司的Fellis表示无法预测这种情况会何时发生,但他说成本的削减应与现有测序系统的改进并行,不需要一个全新的技术。

  医用价值成为普及基因测序的障碍

  如果做大批量基因组测序,那么一个基因组测序的成本不超过1000美元。普及基因组测序的障碍将不再是成本价格,而是它的医用价值。对医疗来说,外显子测序以及足够,且成本不超过1000美元。

  如果一个人获得了自己的全基因组测序数据,是否就能预测各种疾病的罹患几率?不同于对已知的癌症易感基因的检测(如BRCA1/2基因),普通基因剖析也能检测到DNA突变,但通常风险比较小(仅占癌症遗传的一小部分),当然在此不考虑家族史或其他已知的危险因素。虽然有些人认为,基因测序对健康有积极的影响,但个人基因组检测对疾病风险预测的临床有效性和实用性在很大程度上未被确定。

相关文章

中国银河给予诺禾致源买入评级,目标价位30.0元

中国银河证券股份有限公司程培近期对诺禾致源进行研究并发布了研究报告《平台切换影响短期业务节奏,看好核心业务长期成长》,本报告对诺禾致源给出买入评级,认为其目标价位为30.00元,当前股价为20.61元......

中国科研团队研发出精准检测评估基因组组装新工具

近年来,随着基因测序技术和算法不断发展,大量物种基因组被陆续测序和组装,为相关研究和应用提供重要遗传信息。因此,如何精准检测评估基因组组装质量高低、避免组装错误等非常关键,也备受关注。记者19日从中国......

首个DNA损伤修复测序数据资源库被开发

10月13日,《核酸研究》(NucleicAcidsResearch)在线发表了中国科学院分子细胞科学卓越创新中心吴薇研究组与广州国家实验室完成的最新合作研究成果(DNADamageAtlas:ana......

清华脑与智能实验室团队:揭示基因信息如何利用细胞形成组织空间形态

近日,清华大学脑与智能实验室与北京大学前沿交叉学科研究院组成的国际科学家团队开发了一种新的计算方法,可以利用单细胞转录组数据重构细胞的空间组织。研究表明,这种名为DeNovoCoalescentEmb......

中国科研团队研发出新工具,精准检测评估基因组组装质量

京10月19日电(记者孙自法)近年来,随着基因测序技术和算法不断发展,大量物种基因组被陆续测序和组装,为相关研究和应用提供重要遗传信息。因此,如何精准检测评估基因组组装质量高低、避免组装错误等非常关键......

科学家分析禽流感在21世纪的流行

10月18日发表在《自然》的一项研究报道了高致病性H5禽流感病毒在生态与演化上的主要变化,包括全球分布的变化。研究结果显示,这些病毒的暴发中心已经扩展到亚洲以外,传播到了非洲和欧洲的部分地区。2021......

Science:全基因组遗传筛选揭示了人类色素沉着的决定因素

斯坦福大学JoannaWysocka团队在Science在线发表题为“Agenome-widegeneticscreenuncoversdeterminantsofhumanpigmentation”......

研究发现广谱抗黑条矮缩病毒新基因

近日,中国农业科学院作物科学研究所玉米遗传改良与新品种选育创新团队发现了一个玉米抗粗缩病新基因ZmGLK36,并深入揭示了该基因编码的转录因子调控玉米抗粗缩病的分子机制,为抗粗缩病玉米育种等作物抗病改......

病毒入侵时,生命体如何自我保护?

在生命体内存在在这样的一种英雄主义:细菌在杀死入侵病毒的那一刻“壮烈牺牲”,与其“同归于尽”,以完成保护生命体的重任。早在20世纪50年代,科学家们就通过间接的手段检测到了一种同归于尽的自我保护行为,......

昆明植物所完成勐腊毛麝香高质量基因组的组装和萜类物质合成相关基因鉴定

近年来,热带传染病登革热盛行,对热带地区群众的生命健康造成威胁。然而,目前用于大面积喷洒以趋避和杀灭蚊虫的化工合成药品对人体和环境均存在二次伤害的风险,因而亟需发展能够有效驱避埃及伊蚊的天然绿色驱蚊产......