《基因组生物学》：中外猪种骨骼肌研究

8月6日出版的英国《基因组生物学》（Genome Biology）期刊发表了中国农业科学院北京畜牧兽医研究所李奎教授课题组唐中林博士、李勇硕士等关于中外猪种骨骼肌生长发育生长差异分子机制的重要研究成果。
 
猪肉是人类动物蛋白的主要来源，我国是世界上生猪生产和猪肉消费的第一大国。我国种猪长期依赖进口，西方猪种虽生长快和瘦肉率高，但口感风味较差。该问题已经引起普遍关注。我国地方猪种具有肉质优良的特点，以“鲜嫩多汁”驰名中外。解析中外猪种骨骼肌生长发育差异分子机制是培育优良猪种的基础。
 
该研究以我国地方优良猪种—通城猪和著名瘦肉型猪—长白猪为研究对象，选取三个重要时间点（妊娠33天、65天和90天）的胚胎骨骼肌，利用LongSAGE技术比较分析其全基因组转录谱，从检测的317115个表达标签中鉴定了2648个差异表达基因。系统聚类分析发现两品种在妊娠65天时基因表达差异最大，且通城猪妊娠65天的胚胎骨骼肌具有独特的表达谱特征。对差异表达基因进行表达模式和本体论分析，发现骨骼肌发育过程中差异表达基因呈现8种不同表达模式，每种表达模式都分别富集了不同类别的功能基因。无论在表达模式还是富集的功能类别上，两品种的表达基因都存在很大差异。细胞生物学合成、细胞增殖调控、有机酸代谢、大分子生物合成、调节细胞大小等相关基因多在通城猪骨骼肌发育过程中差异表达。此外，还发现通城猪骨骼肌的发育涉及到了更多类别功能的功能基因。
 
该研究认为，通城猪和长白猪的基因表达表型差异显著，通城猪胚胎骨骼肌具有相对缓慢的生长速度和更复杂的分子机制，而增加细胞生长和成肌细胞生存的基因在长白猪中表达上调。他们还推测，妊娠65天可能是导致两品种生长性状差异显著的重要时间点。
 
该研究由中国农业科学院北京畜牧兽医研究所、华中农业大学动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室、上海华冠生物芯片有限公司共同完成，全部工作均在国内完成。此项研究是国家自然科学基金重点项目资助课题，并得到国家863和973计划资助。