英国《自然》杂志及其子刊27日在线发表了基因组聚集数据库(gnomAD)团队的系列研究论文,介绍了研究人员对这个大型数据库的多方面分析,其结果有助人们深入认识人类基因功能,提升对罕见和常见遗传病的理解。
基因组聚集数据库(gnomAD)是一个大规模的人类遗传变异体数据库,汇集了来自不同人群的外显子组数据和全基因组数据,全球多国研究人员参与分析。研究人员将最新的分析结果汇集在7篇论文中,分别发表在《自然》《自然·通讯》及《自然·医学》上。
研究人员在《自然》发表的一篇概述性论文中介绍,他们从125748个外显子组和15708个全基因组测序数据中鉴定出了443769个预测的功能丧失型变异体。
同在《自然》上发表的其他论文还介绍了利用该数据库创建的结构变异资源库,可用于评估基因缺失、复制甚至是颠倒方向等所产生的影响。
一些论文还探讨了如何利用相关变异体评价候选药物靶点,提升对遗传变异体的临床解读等。例如,《自然·医学》上发表的一篇论文分析了与帕金森病风险增加相关的一个基因的变异体,结果显示靶向这个基因可能是一种安全的治疗方法。
美国布罗德研究所的丹尼尔·麦克阿瑟是gnomAD的领衔科学家。他在一份声明中说,这些研究代表了这个项目的首批重要成果,这个数据库的优势在于它的样本规模以及采集人群的多样性,这要感谢来自全球多地研究人员的贡献。每一篇新发表的论文都代表了研究人员从一个新角度去分析这些数据,从而为学界带来新的科研资源。
尽管gnomAD数据库取得了阶段性成果,但研究人员指出,他们距离鉴定出人类全部的预测功能丧失型变异体还有很长的路要走。
南亚地区的人们以酸奶、印度奶酪和印度酥油等乳制品为食。现在,这一地区正帮助解开一个长期存在的谜题:人类是如何获得消化牛奶的能力的。一项针对印度、巴基斯坦和孟加拉国现代及古代人类基因组的研究表明,一种能......
一项发表在最新一期《自然》杂志上的研究,通过对生活在10200至150年前的南非个体基因组进行分析,证实了在南部非洲,一群智人在半隔离的状态下生活了数十万年。这是迄今规模最大的对非洲古代DNA的研究,......
据统计,超过50%的上市小分子药物均直接或间接源自天然产物或其化学结构启发。这些由植物、动物、微生物在亿万年进化中淬炼出的天然分子,拥有人工合成难以企及的复杂结构与强大生物活性,是创新药物发现的源泉。......
近日,宁波市土壤生物普查项目通过专家验收,标志着浙江省首个市级土壤生物数据库正式建成。该项目由宁波大学牵头,联合中国科学院城市环境研究所、武汉工程大学共同完成,系统摸清了宁波市土壤生物"家底......
• 在美国人类遗传学会(ASHG)年会上,因美纳5碱基解决方案的早期试用客户——伦敦健康科学中心研究所将展示该技术在加速罕见病病例解析方面的强大潜力。• 因美纳专有的5碱基化学技术......
人类基因组中存在大量具有"跳跃"能力的逆转座子(retrotransposon)序列。在胚胎发育早期、免疫和神经系统等特定阶段和环境下,它们会被激活,发挥重要生理功能;在病毒感染、......
橡胶树是天然橡胶的主要来源。“橡胶树育种面临的主要困难在于周期长和效率低,通过常规育种方法将多抗、高产性状聚合往往需要30~40年。”中国热带农业科学院橡胶研究所研究员程汉告诉《中国科学报》。然而,目......
记者宋喜群、冯帆从山东农业大学获悉,该校农学院教授孔令让研究团队首次组装了小麦远缘杂交常用物种中间偃麦草和鹅观草染色体水平的高质量基因组序列,解析了二者基因组结构差异与独立多倍化演化路径,对两者携带的......
近日,中国农业科学院烟草研究所烟草功能基因组创新团队发现烟草分枝发育“开关基因”,预示着未来作物株型调控有了新靶点。相关研究成果发表在《植物生物技术》(PlantBiotechnologyJourna......
薇甘菊作为全球十大最具危害的恶性入侵杂草之一,以其惊人的繁殖速度和强大的环境适应性,在亚洲、太平洋地区及中国华南地区造成严重生态破坏。然而,其基因组层面的适应性进化机制长期未被系统解析,制约了科学防控......