三支独立研究小组不约而同发现了同一种会增加结肠癌患病率的常见遗传突变(common genetic variant,编者译),虽然研究样本数量有限,但他们估计全世界半数人口都存在这种突变。之前发现的结肠癌相关基因很少,这是首个常见DNA突变,而且其落在了基因之外的“垃圾DNA”中,因此此发现非常引人注目。所有三支研究小组研究成果刊登于7月8日《Nature Genetics》。
结肠癌某种程度上呈现家族遗传倾向,但科研人员寻找结肠癌常见基因都一直未果。现在,三支研究小组不约而同鉴别出一个不含任何已知基因的染色体区域,此区域曾经被证实与前列腺癌和乳腺癌有关。
英国爱丁堡Western 总医院遗传学家Malcolm Dunlop和加拿大安大略湖癌症研究所Thomas Hudson率领的研究小组,对来自北美和欧洲不同地区的14000位结肠癌患者和14000位非结肠癌人士的DNA样本进行分析,检测将近10万个单核苷酸多态性(single-nucleotide polymorphisms ,SNPs),寻找在这种疾病出现较为频繁的SNP。
由英国撒顿癌症研究所Richard Houlston率领的第二支研究小组采取相似手段,扫描了930位结肠癌患者(有家族遗传史)的和960名非结肠癌人士的50多万个SNP。与第一支研究小组一样,他们发现20%或者以上的结肠癌病例与8号染色体某个区域种的一个特定SNP有关。在7000名欧洲结肠癌患者和5000多名非结肠癌人士的基因组中进行重复实验,证实了这个SNP。
美国南加州大学流行病学家Christopher Haiman率领的第三支研究小组,从一开始就采取了更为集中的方法,关注前列腺癌相关DNA区域。他们采集包括美籍非洲人、美籍日本人、拉美人和美籍欧洲人等多个种族的1800个结肠癌患者和5500名健康志愿者的DNA样本。与前两组相似,这支小组发现了与此疾病相关的同一区域。因为此SNP位于不含已知基因的区域,即俗话所称的“垃圾DNA”,Haiman认为,这也许能够为研究垃圾DNA在基因组中的作用提供有利线索。
SNP并不是结肠癌发生所必需的,但能够随着相邻DNA一起遗传。关于此DNA区域影响结肠癌的确切机制还不清楚: SNP只是提高了患病的风险,在20%以上的所研究样本中都存在。这意味着,比如美国人终身患有结肠癌的风险平均为6%,当携带此有害SNP后患病风险上升到7.2%。但Houlston还发现此DNA区域和结肠癌腺瘤之间的一种发生在肿瘤形成之前的相关性,这种变量也许有助于启动癌症而不是驱动癌症演进(progression)。
Dunlop认为该有助于寻找“基因异常的原因”。尽管离临床应用还很遥远,但新标记也许将来能用于鉴别结肠癌发生率,指导医师进行早期治疗。“这真的很有用,”约翰霍普金斯大学分子遗传学家Bert Vogelstein说,结肠癌如果发现的早,经常是能够治愈的。
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