发布时间:2016-03-15 15:48 原文链接: 中国医学科学院最新文章:关键逆转录转座子与癌症

  “核心刊物”栏目创办于2002年,主旨在于向国内专业人士展示科研核心刊物,以及生命科学领域杂志每期重点内容,为读者呈现精彩纷呈的国内科研动向,和重大科研进展。目前包括《遗传》、《中国生物工程杂志》、《科学通报》等重点期刊,也欢迎生物类期刊联系合作(联系邮箱:journal@ebiotrade.com)。

  LINE-1是现今人体内存在的唯一具有自主转座活性的转座子,约有500 000个拷贝,占人类基因组总量的17%。LINE-1是通过转录和逆转录在内的转座过程产生新的DNA拷贝,并使新产生的DNA拷贝插入基因组的不同位置。LINE-1转座会影响基因组中其他基因的表达或调控,因而会对基因组的稳定性产生影响,从而导致基因疾病或肿瘤的发生。

  近期来自中国医学科学院&北京协和医学院的研究人员总结了近年来国际上对LINE-1转座与肿瘤的发生和发展之间关系的研究进展,为肿瘤的治疗和机制研究提供一些线索。

  在传统遗传学观念中,基因作为具有遗传效应的DNA片段在染色体上的位置是固定不变的,基因只能通过交换重组改变自己的相对位置。然而,在20世纪40年代,美国科学家Barbara McClintock在研究玉米种子的杂色成因时,发现了一类可在染色体内或不同染色体之间自由活动的遗传成分,当时称之为“跳跃基因”,这就是现在所说的转座子(Transposon),也称为转座元件 (Transposable elements,TEs)。转座子的发现,修正和提升了人们对基因的理解。

  根据转座方式的不同,转座子分为DNA转座子和RNA转座子两大类。DNA转座子是自身编码有转座酶的DNA片段,可将自身的DNA片段从原有的基因组位置上剪切下来插入到基因组的其他位点,这种复制方式被人们形象地形容为“剪切−粘贴”模式。DNA转座子只占人类基因组的3%,而且都处于失活状态。RNA转座子,又称为逆转录转座子(Retrotransposons),是以RNA为媒介进行转座的,其复制方式通常被形容为“复制−粘贴”模式,即首先通过转录合成RNA中间体,再以该RNA为模板逆转录合成DNA整合入基因组其他位置。逆转录转座子根据其末端是否含有重复序列又分为LTR(Longterminal repeats)和非LT R(Non-long terminal repeats)逆转录转座子。LT R逆转录转座子来源于古代整合入基因组的逆转录病毒,因此它的组成与复制方式与逆转录病毒极为相似,又被称为内源性逆转录病毒(Human endogenous retroviruses,HEVRs)。在长期的进化过程中这一类转座子在人体中已经失去了转座的能力。

  属于非LT R逆转录转座子的LINE-1(长散布元件,Long interspersed elements-1)是现今在人类基因组中唯一具有自主转座能力的转座子,它能够编码转座所必需的蛋白和酶,广泛分布于基因组中。LINE-1在人基因组中有近500 000个拷贝,约占基因组总量的17%,此外它还可以协助不具有自主转座能力的非LT R转座子SINEs(短散布元件,Short interspersed elements)进行转座。LINE-1转座会影响基因组中其他基因的表达或调控,对基因组的稳定性产生影响,因此对LINE-1的研究是目前转座子领域研究的热点。

  这篇文章本文主要介绍了LINE-1 的结构以及在人体细胞中复制转座的过程,讨论了体细胞对LINE-1的抑制以及LINE-1 在肿瘤细胞中的活性。同时,对LINE-1在肿瘤中可能发生的作用也进行了探讨,讨论了它影响宿主基因调控及基因组稳定性的方式。最后,对LINE-1与肿瘤的检测和治疗在临床上应用的最新进展进行了介绍,以期为肿瘤的治疗和机制研究提供一些线索。

  作者指出,越来越多的证据表明,在占人类基因组17%并具有潜在自主转座活性的LINE-1 是影响人类基因组稳定性的重要因素。在人类肿瘤细胞中会发生LINE-1的表达和转座,表明LINE-1的转座与癌症有着密切的关系。即便LINE-1不是通过转座插入和ORF2造成的基因损伤来诱生肿瘤发生,它可能在肿瘤发展的过程中促进相关基因表达,对肿瘤发生发展所需要的人体内环境具有重要的调控作用。

  针对LINE-1甲基化检测的应用以及针对ORF2的逆转录酶抑制剂的开发为肿瘤的检测和治疗提供了新的方法和新的思路。此外近些年通过对多种针对LINE-1的宿主限制因子如MOV10、APOEBC3G等蛋白的深入研究和新功能的不断发现,使人们对宿主细胞在多层次、多方面打造的内在免疫系统有了更深的认识。这为通过调整细胞的内环境、激活细胞内固有的免疫系统抑制LINE-1的复制和转座,最终达到对肿瘤和癌症的治疗作用的终极目的提供了新的思路。

相关文章

基因组密码被解锁:深度学习模型破解非编码区奥秘

人类基因组中超98%的遗传变异位于非编码区,这些变异通过调控染色质可及性、三维构象、剪接加工等多种分子机制影响基因表达,最终导致疾病发生。由于调控机制的复杂性和细胞类型特异性,目前解读非编码变异的分子......

“女娲”基因组计划发布第八项成果

近日,中国科学院生物物理研究所徐涛研究组和何顺民研究组在《基因组、蛋白质组与生物信息学报》杂志发表论文。两位科学家牵头的“女娲”中国人群基因组计划旨在构建中国人群的全基因组数据资源,支撑中国人群的疾病......

适应雨林?古人类混血?东南亚人群基因组被破译

中外团队历时10年,在东南亚人群基因组研究领域取得里程碑式突破。北京时间14日晚,“东南亚人群基因组计划”首期成果发表在国际期刊《自然》上,东南亚人群的遗传演化之谜被揭开。论文通讯作者之一、中国科学院......

东南亚人群基因组计划首期成果发表

东南亚是全球最重要的人类演化区域之一。该地区人群拥有极高的遗传多样性,但基因组学研究长期缺失,制约了人类环境适应性进化与疾病遗传机制的深度解析,因而被称为全球人类基因组研究“最后一块拼图”。中国科学院......

首个石榴端粒到端粒参考基因组图完成

近日,中国农业科学院郑州果树研究所(以下简称郑果所)特色浆果与干果种质改良课题组在国际期刊《植物生物技术杂志》(PlantBiotechnologyJournal)上发表研究论文,该研究组装了首个石榴......

中国农大团队构建首个苹果属图形泛基因组

中国农业大学教授韩振海团队基于30份苹果属植物高质量基因组,系统解析了苹果属数千万年的演化历程,并构建了首个苹果属图形泛基因组,发布了苹果属遗传多样性全景图。日前,相关研究成果发表于《自然-遗传学》。......

假根羽藻适应潮间带环境的基因组进化研究获进展

假根羽藻(Bryopsiscorticulans)是在北温带海洋潮间带广泛分布的大型绿藻。假根羽藻生存需适应不断变化的潮汐、温度和紫外线辐射等环境因素。涨潮时,假根羽藻的光合蛋白可在蓝绿光和绿光为主的......

科学团队发布首个全红型四倍体软枣猕猴桃参考基因组近完成图

近日,中国农业科学院郑州果树研究所猕猴桃资源与育种创新团队组装构建了首个全红型四倍体软枣猕猴桃参考基因组近完成图,利用该图鉴定了新的色泽调控模块,为猕猴桃色泽改良奠定基础。相关研究成果发表在《分子园艺......

利用完整质体基因组精准鉴定天冬及其9种混伪品

在传统医学的宝库中,天冬(Asparaguscochinchinensis)作为一味重要的中药材,其加工后的块根——天门冬,在东亚地区尤其是中国,有着悠久的药用历史。它不仅能治疗多种疾病,如胃痛、便秘......

我国科学家发布海带高质量染色体水平参考基因组

近日,中国科学院海洋研究所海藻种质库团队在大型海藻基因组学研究方面取得重要突破,成功构建了海带的高质量染色体水平参考基因组。该成果发表在国际期刊《科学数据》。这是该团队在海洋经济藻类基因组研究领域取得......