中国学者解析甜瓜全基因组变异图谱及进化机制

　　 近日，Nature Genetics线发表了中国农科院与其它机构合作完成的两篇重量级文章，文章分别构建了甜瓜全基因组变异图谱和解析了西瓜果实品质性状进化分子机制。

　　鉴于该两项研究的重要性，Nature Genetics杂志还同期发表了题为“Sweet genes in melon and watermelon”的专评文章和以“Sweet sequencing”为题的社论文章。

　　在第一篇文章“Resequencing of 414 cultivated and wild watermelon accessions identifies selection for fruit quality traits”中，北京市农林科学院许勇团队、中国农科院郑州果树所刘文革团队、美国康奈尔大学Boyce Thompson研究所费章君团队和中国农科院深圳基因组所黄三文团队等合作，完成了新一代西瓜基因组精细图谱绘制和驯化历史解析，首次系统揭示了西瓜果实品质性状进化的分子机制。

　　甜西瓜的水果特性在很大程度上是人类选择的结果。

　　在这篇文章中，作者报告了一个改良版的西瓜参考基因组和414份西瓜属所有现存物种代表材料的全基因组重测序。群体基因组学分析揭示了西瓜属的演化历史，说明了阿玛鲁西瓜（Citrullus amarus）和包含西瓜（Citrullus lanatus）和黏籽西瓜（Citrullus mucosospermus）支系的独立演化。

　　研究发现表明，在物种形成、驯化和改良过程中，影响西瓜果实大小的基因组上不同位点都受到了选择。起源于甜西瓜的非苦味等位基因在西瓜群体中很大程度上被固定下来。果肉甜度的选择起始于西瓜的祖先，并通过控制棉子糖分解代谢和糖运输基因座的现代育种持续选择。果肉着色和糖分积累可能通过包括糖转运蛋白基因在内的共有遗传成分共同演化。这一研究提供了宝贵的基因组资源，并为西瓜的物种形成和育种历史提供了新的视野。（内容来自科学网博客）

　　第二篇文章“A comprehensive genome variation map of melon identifies multiple domestication events and loci influencing agronomic traits”由中国农业科学院郑州果树研究所徐永阳团队、中国农业科学院深圳农业基因组研究所黄三文团队、西班牙巴塞罗那食品科学院JordiGarcia-Mas团队等合作完成。

　　这项研究标志着我国在甜瓜基因组学和群体遗传学研究领域取得重大进展，为深化葫芦科进化研究提供了重要依据，为甜瓜重要性状定向育种和遗传改良提供了较为精准的标记和基因资源。