全基因组选择,是近年来畜禽分子育种的全新策略,已成为动、植物分子辅助育种的热点和趋势。它突破了对候选个体从表型选择到基因组选择,解决了畜禽肉质和抗性等难以选育性状的障碍,提高了遗传评定的准确性,实现了低成本早期选择。
在国家863计划课题“基于高密度SNP芯片的牛、猪基因组选择技术研究”支持下,中国农业大学联合海南大学、华中农业大学、浙江大学以及广东温氏新兴育种公司和北京奶牛中心等单位合作攻关,以杜洛克种猪和荷斯坦奶牛为研究对象,采用全基因组SNP芯片对猪、牛基因组育种值估计,更准确地对种用家畜进行早期选种,这成为我国首次开展的家畜全基因组选择技术研究及应用。
该技术基于畜禽全基因组高密度单核苷酸多态性(SNP)芯片技术平台,获得覆盖全基因组的标记信息,通过与对应的重要经济性状的表型信息进行全基因组关联分析,估计出基因组中每个标记的效应,最后利用估计的标记效应估算出个体的育种值(gEBV)。
研究人员结合我国种猪和奶牛育种实践,构建了杜洛克公猪和中国荷斯坦奶牛基因组选择的参考群体,创建了基因组选择的核心技术体系和实施条件;依据研究性状成功建立了群体表型数据库,以及更准确、有效的全基因组选择新方法,提高了gEBV估计准确性,扩大了gEBV估计的适用范围;基于核基因组和线粒体基因组遗传变异特性,构建了家猪种质特性分子鉴定平台;全面、系统地分析了具有不同种质特征猪品种的遗传变异,实现了种质基因资源的高效发掘及分子标记的开发。
日前,在广东温氏食品集团有限公司新兴育种公司种猪场,已开展了杜洛克种公猪的选种并用于后续的种猪生产。项目中所建立的奶牛基因组选择技术已用于我国荷斯坦公牛的遗传评估,并成为农业部奶牛良种补贴计划中青年公牛的选择依据。该课题已发表SCI论文15篇,获得国家授权发明ZL5项,国家软件著作权证书6项。
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