国外临床试验显示，注射用左亚叶酸钙不良反应包括腹泻（47.6%）,食欲缺乏（47.6%），恶心、呕吐（46.1%），口腔内膜炎（20.5%），发热（19.0%）。Ⅲ级以上不良反应包括腹泻（14%），食欲缺乏（13.4%），恶心、呕吐（8%），发热（1.5%），口腔内膜炎（0.9%）。实验室检查异常包括白细胞数减少（60.7%），血红蛋白减少（40.5%）总蛋白降低（14.5%），血小板计数减少（13.7%）。Ⅲ级以上实验室检查异常包括白细胞减少（17.6%），血红蛋白减少（8.9%），血小板减少（2.4%）。
注射用左亚叶酸钙的严重不良反应：
1、剧烈的腹泻（5%以上）
剧烈的腹泻有时会引起脱水，应严密监测，出现腹泻应停止用药，进行补液等适当处理。
2、严重的肠炎（发生率不明）
有时会出现出血性肠炎、贫血性肠炎、坏死性肠炎等严重肠炎，应严密监测，出现剧烈的腹痛、腹泻等症状时，应停止给药并进行适当处理。
3、骨髓抑制（发生率不明）
有时会出现全血细胞减少、白细胞减少、嗜中性白细胞减少、贫血、血小板减少等骨髓抑制情况，要严密监视，发现异常时，应减量停药并进行适当处理。
4、休克、过敏样症状（发生率不明）
有时会出现休克、过敏样症状，要严密监视，发现发疹、呼吸困难、血压降低等症状时，应立即停药并进行适当处理。
5、大脑白质脑症、神经、精神障碍（发生率不明）
有时会出现大脑白质脑症（初期步态蹒跚、四肢末端麻木、舌不灵活等），同时有锥体外系症状，语言障碍、运动失调、眼震颤、意识障碍、痉挛、颜面麻痹、健忘、谵妄、记忆力降低、尿失禁等精神神经症状，应严密监测，出现这些症状时要停止给药。
6、充血性心衰、心肌梗死（发生率不明）
有时会出现充血性心衰、心肌梗死，应严密监测，发现异常时，应减量停药并进行适当处理
7、肝功能损害、黄疸（发生率不明）
出现AST（GOT）、ALT（GPT）、ALP、r-GTP升高等肝功能损害以及黄疸时，应停止注射用左亚叶酸钙并进行适当处理。
8、急性肾功能不全（发生率不明）
有时会出现急性肾功能不全的严重肾功能损害，要严密监测，发现异常时，应停止注射用左亚叶酸钙并进行适当处理。
9、间质性肺炎（发生率不明）
有时会出现间质性肺炎，因此当出现发热、咳嗽、呼吸困难等呼吸道症状时，要停止给药，进行X光等检查，同时给与肾上腺皮质激素等。
10、消化道溃疡（发生率不明）、严重的口腔内膜炎（0.1%～5%以下）有时会出现消化道溃疡、严重的口腔内膜炎，要严密监测，发现异常时，应停止给药并进行适当处理。
11、手足症侯群（发生率不明）
有时会出现手足症侯群（手掌、足趾红斑、疼痛性发红肿胀、知觉过敏等），要严密监测，出现异常时，应停止给药并进行适当处理。
12、弥漫性血管内凝血（DIC）（发生率不明）
有时会出现弥漫性血管内凝血，应定期进行血液检查，发现其症状时，应停止给药并进行适当处理。
13、嗅觉丧失（发生率不明）
有时有嗅觉障碍，甚至嗅觉丧失，要严密监测，出现异常时，应停止给药并进行适当处理。
14、重症肝炎、肝硬化、室性期前收缩、急性胰腺炎、肾病综合征、皮肤黏膜眼症状群（Stevens-Johnson症候群）、中毒性表皮坏死症（Lyell症侯群）、溶血性贫血（发生率不明）。