①所测定的只是细胞因子的蛋白含量，与其生物活性不一定成正比；
②测定结果与所用的抗体来源及亲和力有很大的关系，使用不同来源亲和力的单抗，对同一标本测到的结果可能不同；
③敏感性相对较低，比生物活性法约低10～100倍，测定下限一般为100pg；
④若标本中存在细胞因子的可溶性受体，可能会影响特异性抗体对细胞因子的结合。
