血清甲胎蛋白的检测对肝癌的诊断极为重要。90%～100%为阳性，比成人病例更高（成人为70%～80%阳性）。许多生物化学物质如蛋白、脂质、酶等皆由肝脏产生或在肝脏中进行代谢，故血胆固醇、乳酸脱氢酶（LDH）、白蛋白、球蛋白、碱性磷酸酶、胆红质等检查均能反映肝脏功能，均属必要。血清碱性磷酸酶常增高，这对肝癌的诊断亦颇有帮助。超声波检查、核素肝扫描对本病诊断均有帮助。CT、MRI（磁共振影像诊断）对诊断均有参考价值。
