主要与其他引起肝功能异常的情况相鉴别。
1．病毒性肝炎
病毒性肝炎的患者在输血前即有肝功能异常，其血清学或病毒学检查阳性。输血后肝功能异常的患者，在输血前检查肝功能未见异常，可通过对比输血前后病毒定量等指标与病毒性肝炎鉴别。
2．输血后溶血所致的黄疸
输血后溶血发生在输入不相容红细胞或自身红细胞被抗体破坏的受血者，临床上常伴有发热、寒战、黄疸、腰背部疼痛，呼吸困难、肾功能不全等，实验室检查可见血红蛋白尿，可通过重复输血样本交叉配血、血型鉴定等加以鉴别。
3．自身免疫性疾病
可通过既往病史、发病年龄等特点鉴别，必要时穿刺病理活检可以明确。