
10月27日下午,中国科学院北京基因组所组织召开了“北京基因组研究所计算生物学研讨会”,会议由所长吴仲义主持,书记杨卫平、副所长李俊雄、基因组所生物信息研究人员以及科技处相关人员参加了会议。
研讨会上,与会学者就目前计算生物学领域中涉及如何运用大规模高效的理论模型和数值计算来识别基因组序列中代表蛋白质的编码区,破译隐藏在核酸序列中的遗传语言规律,基因组遗传语言信息释放及其调控相关的转录谱等问题展开了讨论,会议还对目前基因组所计算资源和肿瘤基因组、个人基因组等生物信息未来重点研究领域以及酝酿成立“基因组所生物超算和生物信息研究中心”并就中心未来的发展目标、管理模式和人才引进等众多方面进行了热烈讨论。
计算生物学是随着人类基因组计划的研究而起步,目前已成为现代生物学研究的核心方法之一。计算生物学运用大规模高效的理论模型和数值计算来基因组学极高通量数据产出特点使得对其海量数据分析,挖掘、管理及整合已成为计算生物学的中心问题之一。当前高性能计算集群,云计算,网格计算和异构计算都因基因组学这一巨大计算需求推动而得到普遍的应用。根据超出摩尔定律的基因组学数据增长速度预计,未来的个体化医疗所产生的基因组数据使得基因组学将面临着与高能物理研究相同规模的海量数据分析和管理的挑战。然而由于基因组学中的计算和存储问题又与高能物理等领域中的计算和存储问题具有非常迥异的特点。成立生物超算和生物信息研究中心,使得基因组所能着力研究在计算生物学特别是基因组信息学中海量数据分析与管理整合计算方法、技术和策略问题,为未来的基因组医药和个体化医疗面临的计算问题提供有力的方法学保障,同时由基因组学内在需求驱动的对计算方法技术的研究也能带动整个计算生物学和高性能计算技术的发展,这也为在国家战略层面建立中国在基因组学和计算生物学的取得领先优势垫定坚实有力的基础。
7月1日,华南农业大学教授吴珍芳团队首次揭示了不同代谢类型猪骨骼肌的染色质空间构象及其介导的调控差异,通过整合表观基因组学与三维基因组学分析并结合分子实验,阐明了超级增强子调控肌纤维类型分化与转化的分......
根据市科技计划项目管理办法有关规定,现将上海市2025年度关键技术研发计划“计算生物学”拟立项项目予以公示。公示链接:http://svc.stcsm.sh.gov.cn/public/guide公示......
关于上海市2024年度“科技创新行动计划”计算生物学领域项目立项的通知沪科〔2024〕418号各有关单位:根据《关于发布上海市2024年度“科技创新行动计划”计算生物学领域项目申报指南的通知》(沪科指......
上海市2024年度“科技创新行动计划”计算生物学领域项目评审见面会于2024年11月7日召开。现公布参加会议评审的专家名单(按姓氏拼音排序)。BINCHEN、冯建峰、高召兵、郝沛、蒋皆恢、李洪林、刘琦......
上海市2024年度“科技创新行动计划”计算生物学领域项目通讯评审已结束,现公布参加通讯评审的专家名单(按姓氏拼音排序)。蔡雷、陈爱华、陈辉、陈兴、陈志龙、程时伟、代琦、范志宁、高栋、洪远、黄金艳、黄瑾......
中国科学院华南植物园研究员康明团队在国家自然科学基金、广东省重点领域研发计划、广东基础与应用基础研究旗舰项目等项目的资助下,基于三种桫椤属植物的全基因组重测序数据,在树蕨保护基因组学研究方面取得新进展......
中国厦门,2024年9月26日——全球基因测序和芯片技术的领导者因美纳以“基因组学点亮肿瘤精准医学未来”为主题,亮相第27届全国临床肿瘤学大会暨2024年中国临床肿瘤学会(CSCO)学术年会,全方位展......
关于发布上海市2024年度“科技创新行动计划”计算生物学领域项目申报指南的通知沪科指南〔2024〕25号各有关单位:为深入实施创新驱动发展战略,加快建设具有全球影响力的科技创新中心,根据《上海市建设具......
科技日报北京8月6日电 (记者张佳欣)DNA包含了维持生命所需的基础信息。理解这些信息是如何存储和组织的,一直是20世纪最大的科学挑战之一。现在,借助GROVER这一基于人类DNA训练的新型......
近日,一位名叫郑雅婷的女生在多个社交平台发文称,她的硕士生导师、江南大学生物工程学院副教授杨某某将本来属于她的论文第一作者署名占为己有。那是一篇发表于2020年6月的《分子遗传学和基因组学杂志》(Mo......