北京大学Nature子刊发布表观遗传新成果

　　来自北京大学的研究人员报告称，他们通过全转录组绘图揭示出了可逆及动态的N1甲基腺苷(N1 methyladenosine,m1A)甲基化组。这一重要的研究成果发布在2月10日的《自然化学生物学》（Nature Chemical Biology）杂志上。

　　北京大学生命科学学院伊成器(Chengqi Yi)研究员是这篇论文的通讯作者。伊成器博士的主要研究领域是通过化学生物学、结构生物学、高通量测序等手段，对核酸修饰的生物功能及其生理调控机制进行研究。

　　2015年伊成器研究员领导课题组取得多项突破性研究成果，一系列相关论文发表在Nature子刊杂志上。6月，伊成器领导北京大学的研究人员采用化学下拉（pulldown）方法揭示出了哺乳动物转录组的动态假尿嘧啶化 (pseudouridylation)。这一重要的研究成果发布Nature Chemical Biology杂志上（北京大学Nature子刊解析表观遗传修饰）。8月，伊成器研究员与罗彻斯特大学的Yi-Tao Yu、加州大学的John Karijolich合作，在权威期刊Nature Reviews Molecular Cell Biology 上发表文章，探讨了RNA假尿嘧啶化在转录组中的动态（北大学者发表Nature综述解析RNA修饰 ）。9月，其与芝加哥大学的何川教授合作，开发出了一种非重亚硫酸盐方法，并利用这种方法以单碱基分辨率分析了小鼠胚胎干细胞（mESCs）中的全基因组5 -胞嘧啶甲酰（5-formylcytosine，5fC）。这一重要的研究成果发布Nature Methods杂志上（北京大学Nature Methods发布表观遗传重要成果）。

　　在最新的Nature Chemical Biology论文中，伊成器研究员与合著者指出m1A是一种普遍存在的转录后RNA修饰，但当前对于它在mRNA中的丰度、拓扑结构及动态情况知之甚少。他们在新研究中证实m1A普遍存在于人类mRNA，m1A/A比例为~0.02%。

　　基于m1A免疫沉淀法及m1A具有阻止逆转录的能力，研究人员开发出了一种m1A-ID-seq技术来进行全转录组m1A分析。m1A-ID-seq在mRNA和非编码RNA中鉴别出了来自600个基因的901个m1A峰，并揭示出了突出的特征：不同于最丰富的哺乳动物mRNA 修饰N6甲基腺苷（m6A），m1A富集于mRNA转录物的5′非翻译区。并且一种已知的DNA/RNA去甲基化酶ALKBH3可以消除mRNA中的m1A。最后，他们证实m1A甲基化作用动态响应刺激，还鉴别出了数百个压力诱导的m1A位点。

　　作者们表示，他们开发出的新方法使得可以综合分析m1A修饰，为研究通过可逆及动态的m1A甲基化作用实现的潜在表观遗传调控的功能提供了宝贵的工具。