记者近日从深圳华大基因研究院获悉,由该院发起的“千种动植物基因组计划”一期在重要物种基因组学研究领域和巨型基因组数据库构建上取得阶段性进展。
于2010年1月正式启动的“千种动植物基因组计划”(简称“千种”计划)预计在未来两年内将破译千种具有重要经济和科研价值的动植物物种基因组,并向全世界科学界征集测序物种的提案。该计划旨在构建一个全球最大的基因组数据库,为各物种的进一步研究提供重要基础和依据。由华大基因组织国际专家组成的委员会将从各地研究者的提案中挑选目的物种,评选条件包括物种的重要性、申请人的资金状况、项目的科学意义以及实验设计方案等。该计划一经启动就得到国内外各界人士的关注和支持,计划仅仅启动几个月,便已吸引了包括中国农业大学、中国农业科学院、中国科学院遗传与发育生物学研究所、上海交通大学在内的多所国内一流科研院校、研究机构以及加拿大、美国、澳大利亚、马来西亚等国际相关科研人员的加入。
“随着多项动植物基因组项目的顺利完成,华大基因研究院大力推动的‘千种’计划已经初具规模。同时,更多的合作项目纷纷启动,‘千种’计划勾勒的美好前景已清晰可见。”深圳华大基因研究院的杨碧澄博士介绍了“千种”计划一期取得的成果。到目前为止,华大基因和合作者们已经启动了100多种动植物基因组测序分析项目,其中近一半的项目已完成或接近尾声。已经进行全基因组测序的物种包括和人们的生活密切相关的蔬菜瓜果,如黄瓜、西瓜、白菜、甘蓝等,还有一些重要动物物种,如大熊猫、藏羚羊、企鹅、北极熊的基因组解析。另外,华大基因与国内外研究者还正在展开梅花、兰花、烟草、茶树、棉花、小麦、牦牛、石斑鱼、牙鲆、牡蛎、小菜蛾、环毛蚓、大鲵等近百种物种基因组项目的合作。这些物种涉及的领域涵盖模式生物、海洋生物、家畜、昆虫、稀有物种、农作物、园艺和生物能源等。
据悉,这些数据除了能用于进行各物种的基础研究,探索其生物学奥秘之外,世界各地、各领域的科学家们还可将这些公开数据应用到分子育种领域,培育高产的粮食作物品种和优质的畜牧品种。
“千种”计划负责人尹烨指出,该计划接下来的工作将是进一步扩大和挖掘重要的物种资源,搜集重要的样本,将测序的物种覆盖面继续扩张,构建一个空前巨大的基因组数据库,令全球的基因组学研究水平发生质的飞跃。
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