发布时间:2019-11-16 10:44 原文链接: 双向电泳前去垢剂和离液剂对蛋白质的增溶作用实验

实验材料:蛋白质 

试剂、试剂盒:

十二烷基麦芽糖苷                                                                  

阳离子去垢剂                                                                 

尿素贮存液                                                                 

尿素-硫脲贮存液 

仪器、耗材:

超速离心机                                                                  

IPGphor 装置

实验步骤:

3.1 用于 IEF 的蛋白质样品在尿素中的溶解

1. 固体样品溶解(如组织或细胞颗粒)

在这种情况下,在终端溶解体积中往往忽略样品的体积。样品溶液含有尿素(终浓度 9~9.5 mol/L;见注释 1 ) ,所选取的去垢剂(依照 2.3.1 中列表)终浓度为 2% ~4% ( m/V ),两性电解质 [ IPG:0.4% (w/v ); [CA] - IEF:2% (w/v) ] ,还原剂 ( 50 mmol/L DTT 或 5 mmol/L TBP 或 5 mmol/L TCEP),将样品溶液加入固体样品中进行溶解,在水溶条件下进行超声波 30 min 会有助于蛋白质的溶解,通过高速离心 20000 g,30 min 去除不溶物质。

2. 蛋白样品从悬浮液或溶液中溶解

在这种情况下,必须考虑样品的体积。因此,有必要计算终体积。根据经验,样本量可以占最终提取体积的 35%。固体尿素、水和去垢剂贮存液,两性电解质要一同加入蛋白样品中来溶解蛋白质。

3.2 蛋白样品在尿素硫脲中的溶解

定量的蛋白样品体积通过水化过程进入 IPG 胶条中,如果是自制的 IPG 胶条,则可以制成比商业产品更宽一些,这时蛋白样品可调整至更大体积(最多 1 ml ) ,这样就可以稀释被浓缩的离液剂和蛋白样品。如果去垢剂能预先溶解在浓缩的离液剂中,其中还包含还原剂,那么样品体积占总溶解体积的 2%,如果去垢剂必须在最后加入,并且尿素的浓度不超过 8 mol/L,这样就很方便使用 1 份的样品,1 份的去垢剂贮存液和 8 份的浓缩离液剂。如果此方法使体积过大,可以用以下两种方法解决:

( 1 ) 在试管中加入相当于 1 份样品的去垢剂,在真空浓缩仪中进行浓缩后再加入 1 份样品和 4 份浓缩离液剂。

( 2 ) 考虑到样品体积占终体积的 40%,应称量相应量的尿素、硫脲和固体去垢剂,并且在冰浴条件下进行超声波溶解。所有情况下,蛋白样品先在室温下溶解 30~60 min,再在 200000 g,30 min 条件下离心去除不溶物质。

3.3 用于区带电泳的蛋白样品溶解

蛋白样品用 SDS 进行溶解不在本章中介绍,本章主要讲述蛋白样品在进行非对角电泳之前在尿素和阳离子去垢剂中的溶解情况 [ 16,17] 。计算样品溶解溶液中的组成很简单,蛋白样品占终溶解体积的 1/4,液体样品按如下顺序添加:0.4 体积的 20%(w/v) 阳离子去垢剂贮存液,0.2 体积还原剂,0.4 体积磷酸缓冲液和 2 体积的 8 mol/L 尿素。

混合后的样品溶液在水浴条件下超声处理 30 min,然后在 10000 g,15 min 条件下离心去除不溶物质。


相关文章

蛋白质酰基化修饰与生物合成代谢研究再获新进展

近日,华东理工大学生物工程学院、生物反应器工程国家重点实验室叶邦策教授团队在蛋白质酰基化修饰与生物合成代谢研究领域再次取得重要进展,相关研究成果以“乙酰磷酸与c-di-GMP协同调节BldD活性,控制......

德国应用化学:蛋白质复合物原位解析新技术

作为生命活动的执行者,蛋白质通过相互作用形成复合物等形式行使其特定的生物学功能。近日,中国科学院大连化学物理研究所研究员张丽华、研究员赵群等研制了一种基于糖苷键的质谱可碎裂型交联剂,显著地提高了交联信......

生成式AI设计出非天然蛋白质

加拿大多伦多大学研究人员开发了一种人工智能系统,可以使用生成扩散来创建自然界中不存在的蛋白质。该系统有望使治疗蛋白的设计和测试更加高效和灵活,从而加速人类药物开发。研究发表在最新一期《自然·计算科学》......

镜像分子为更好的癌症治疗方法打开了新世界大门

来自斯克里普斯研究所的科学家们设计了一种创新的技术来识别能够改变蛋白质功能的小分子,为靶向药物发现铺平了道路。该团队与来自其他机构的研究人员一起工作,采用他们的新方法来检测能够影响癌症相关蛋白活性的小......

人工智能设计出致密蛋白质外壳,或可用于基因治疗

4月20日,一项发表于《科学》的研究显示,人工智能可以设计出密度极高的蛋白质外壳,有朝一日能制造更有效的疫苗。病毒的遗传物质位于蛋白质外壳中。在实验室里制造的类似外壳也被用于疫苗中,只不过它包裹的是在......

新方法可精确控制蛋白质激活过程

据4月17日发表在《自然·化学》杂志上的一项研究,美国华盛顿大学医学院研究团队使用短暂的闪光将经过化学修饰的蛋白质片段连接在一起,形成功能性整体。这种名为光激活SpyLigation的新方法可打开通常......

中国科大校友发Science!蛋白质科学界版ChatGPT来了

凝视着手中的试管,又望向桌上那些依旧在各司其职的大大小小的实验仪器,赵惠民的一颗心像是被人用力攥着。他明白,已经到了不得不放弃的时候。读博第三年,学校资格考试的巨大压力如海啸般倾泻而来,这项奋战了两年......

发现干细胞清理蛋白质垃圾的特殊机制

蛋白质稳态(proteostasis)是指细胞内蛋白质的合成、折叠、修复、降解和运输等过程的平衡状态,保证细胞内蛋白质的数量、构象和功能处于稳定的状态。蛋白质稳态对于维持细胞的正常功能、细胞增殖和生存......

化妆品+蛋白质,修复皮肤不是梦

近日,英国研究人员发现了两种蛋白质片段。研究人员将其应用在前臂皮肤上后,这块区域的关键蛋白质结构水平增加了,而这种结构能使皮肤更有弹性。由于体内炎症水平上升和暴露在紫外线辐射下,皮肤中形成弹性网络的蛋......

Nature子刊:AI像造句一样设计人工蛋白质

近年来,人工智能(AI)已在医学、生物学及制药领域中展示出广阔的发展前景。特别是在蛋白质设计和工程领域,基于AI技术创建人工的蛋白质序列已经成为现实,并可能被用于治疗各种疾病。日前,来自AI研究企业S......