变性高效液相色谱分析法在人类基因组单核苷酸多态性检测中的应用

[摘　要]　目的: 检测白种人和汉族人RDH8 基因序列中单核苷酸多态性(SN P) 位点, 探讨变性高效液相色谱分析法(DHPLC) 在基因组研究中的效能。方法: 建立8 个由白种人和汉族人基因组DNA 组成的混合样品池, 并进行PCR 扩增。其产物以DHPLC 检测, 发现杂合子信号后, 对单独DNA 样本进行DHPLC 检测及直接测序确定其突变类型。以DHPLC 结合DNA 样本混合技术在150 个汉族人和20 个欧洲白种人样本中测定SN P 的基因频率。结果:在RDH8 基因中共检测到17 个SN P, 其中12 个为新发现的, 5 个为已报道的; 11 个SN P 在筛查阶段发现, 6 个在基因频率检测阶段发现; 2 个仅在白种人样本中检测到, 3 个SN P 的MA F 在两种人种间有较明显的差异; 汉族人基因频率检测确定了7 个常见SN P。结论:DHPLC 能有效地用于基因组SN P 的检测, 结合DNA 混合技术, 更能提高其检测效力, 有效地应用于基因频率的测定。