一、采购国产设备退税的企业范围
该《办法》与之前被废止的外商投资企业采购国产设备退税政策的不同之处在于，只限定了外资研发机构或中心采购国产设备可享受全额退还增值税，并非是指所有的外商投资企业，其享受退税企业的范围是根据《财政部、海关总署、国家税务总局关于研发机构采购设备税收政策的通知》(财税[2009]115号)有关规定执行的，在设立时间内，应分为四类条件：
一是《科技开发用品免征进口税收暂行规定》(财政部、海关总署、国家税务总局令第44号)规定的科学研究、技术开发机构。
二是《科学研究和教学用品免征进口税收规定》(财政部、海关总署、国家税务总局令第45号)规定的科学研究机构和学校。
三是对2009年9月30日及其之前设立的外资研发中心，必须是：1、研发费用标准为，对新设立不足两年的外资研发中心，作为独立法人的，其投资总额不低于500万美元;作为公司内设部门或分公司的，其研发总投入不低于500万美元;对设立两年及以上的外资研发中心，企业研发经费年支出额不低于1000万元。2、专职研究与试验发展人员不低于90人。3、设立以来累计购置的设备原值不低于1000万元。
四是对2009年10月1日及其之后设立的外资研发中心，必须是：1、研发费用标准为，作为独立法人的，其投资总额不低于800万美元;作为公司内设部门或分公司的，其研发总投入不低于800万美元。2、专职研究与试验发展人员不低于150人。3、设立以来累计购置的设备原值不低于2000万元。
二、采购国产设备退税的设备范围
依据《财政部、海关总署、国家税务总局关于研发机构采购设备税收政策的通知》(财税[2009]115号)的有关规定，外资研发机构或中心采购国产设备退税的设备范围，主要可分为三类：
一是实验环境方面。例如：教学实验仪器及装置;教学示教、演示仪器及装置等。
二是样品制备设备和装置。例如：特种泵类(如分子泵、离子泵、真空泵、蠕动泵、蜗轮泵、干泵等);培养设备(如培养箱、发酵罐等)。
三是实验室专用设备。例如：特殊照相和摄影设备(如水下、高空、高温、低温等)。
三、采购国产设备退税的办理程序
外资研发机构或中心采购国产设备退税，由国家税务局主管部门负责其认定、审核、审批及监管工作。
(一)退税的认定、变更与注销
1、退税的认定。享受采购国产设备退税的研发机构或中心，应在申请办理退税前持以下资料向主管退税税务机关申请办理采购国产设备的退税认定手续：
(1)企业法人营业执照副本或组织机构代码证(原件及复印件);
(2)税务登记证副本(原件及复印件);
(3)退税账户证明;
(4)税务机关要求提供的其他资料。
如果此《办法》出台之前，外资研发机构或中心已经办理了出口退税认定手续的，可不再办理采购国产设备的退税认定手续。
2、退税的变更。如果已办理采购国产设备退税认定的外资研发机构或中心，其认定内容发生变化的，须自有关管理机关批准变更之日起30日内，持相关证件、资料向其主管退税税务机关办理变更认定手续。
3、退税的注销。外资研发机构或中心发生解散、破产、撤销以及其他依法应终止采购国产设备退税事项的，应持相关证件、资料向其主管退税税务机关办理注销认定手续。
(二)用于退税增值税专用发票的认证
属于增值税一般纳税人的外资研发机构或中心购进国产设备取得的增值税专用发票，应在规定的认证期限内办理认证手续。如果是在2009年12月31日(含)之前开具的增值税专用发票，其认证期限为90日;如果是在2010年1月1日(含)之后开具的增值税专用发票，其认证期限为180日。对此，申报退税的外资研发机构或中心需要注意的是，未认证或认证未通过的发票一律不能作为申报退税的凭证。
(三)采购国产设备退税的申报
外资研发机构或中心自购买国产设备开具增值税专用发票之日起180日内，应向其主管退税税务机关报送《研发机构采购国产设备退税申报审核审批表》及电子数据申请退税，同时附送以下资料：
1、采购国产设备合同;
2、增值税专用发票(抵扣联);
3、付款凭证;
4、税务机关要求提供的其他资料。
如果不属于独立法人的公司内设部门或分公司的外资研发机构或中心采购国产设备，由总公司向其主管退税税务机关申请退税。
四、采购国产设备退税的税收管理
一是根据《办法》规定，对属于增值税一般纳税人的外资研发机构或中心申报退税，主管退税税务机关应在增值税专用发票稽核信息核对无误的情况下，办理退税。对非增值税一般纳税人的外资研发机构或中心申报退税，主管退税税务机关须进行发函调查，在确认发票真实、发票所列设备已按照规定申报纳税后，方可办理退税。上述所指的非增值税一般纳税人通常包括：从事交通运输、开发普通住宅的企业以及从事海洋石油勘探开发生产的中外合作企业。
二是采购国产设备的应退税额，是按照增值税专用发票上注明的税额而确定的。凡外资研发机构或中心未全额支付所购设备货款的，按照已付款比例和增值税专用发票上注明的税额确定应退税款;凡未付款部分的相应税款，待企业实际支付货款后再予退税。
三是外资研发机构或中心已退税的国产设备，由主管退税税务机关进行监管，监管期为5年，其监管时限是以税务机关开具该国产设备的《收入退还书》上的日期为起始日期开始计算。如果外资研发机构或中心将已退税的设备发生转让、赠送等所有权转让情形，或者发生出租、再投资等行为的，应按以下计算公式，向主管退税税务机关补缴已退税款。
应补税款=增值税专用发票上注明的金额×(设备折余价值÷设备原值)×适用增值税税率设备折余价值=设备原值-累计已提折旧设备原值和已提折旧按企业会计核算数据计算。
四是外资研发机构或中心以假冒采购国产设备退税资格、既申报抵扣又申报退税、虚构采购国产设备业务、提供虚假退税申报资料等手段骗取国产设备退税款的，按照现行有关法律、法规处理。
五、采购国产设备申报退税的注意事项
一是及时熟悉出台的退税政策。外资研发机构或中心应当掌握政策变化，规划投资项目内设备的购进与发票的取得，及时按规定将发票进行认证，并在取得发票的180天内进行申报，避免误期申报的发生。
二是准确区分可享受退税企业与设备的范围。特别是对于2009年9月30日之前和2009年10月1日之后设立的外资研发中心，应准确核实划分企业类型。同时，还应注意可以享受退税设备的范围，防止设备划分混淆。
三是已享受退税的国产设备，增值税发票被主管退税税务机关加盖了“已申报退税”章的，不能再作为进项税额抵扣凭证。同时，对已退税的发票应做好留存备案。
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